RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.8■■■■■ 4.12
TCEA1-202ENST00000517351 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.79■■■■■ 4.12
TCEA1-202ENST00000517351 PREX2Q70Z35 1606 aa40.78■■■■■ 4.12
TCEA1-202ENST00000517351 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.78■■■■■ 4.12
TCEA1-202ENST00000517351 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.73■■■■■ 4.11
TCEA1-202ENST00000517351 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.72■■■■■ 4.11
TCEA1-202ENST00000517351 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.72■■■■■ 4.11
TCEA1-202ENST00000517351 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.69■■■■■ 4.1
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.67■■■■■ 4.1
TCEA1-202ENST00000517351 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
TCEA1-202ENST00000517351 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.63■■■■■ 4.09
TCEA1-202ENST00000517351 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.62■■■■■ 4.09
TCEA1-202ENST00000517351 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.61■■■■■ 4.09
TCEA1-202ENST00000517351 TIAM1Q13009 1591 aa40.61■■■■■ 4.09
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.6■■■■■ 4.09
TCEA1-202ENST00000517351 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.59■■■■■ 4.09
TCEA1-202ENST00000517351 ABCC1P33527 1531 aa40.58■■■■■ 4.09
TCEA1-202ENST00000517351 AFAP1Q8N556 730 aa40.56■■■■■ 4.08
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
TCEA1-202ENST00000517351 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
TCEA1-202ENST00000517351 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.52■■■■■ 4.08
TCEA1-202ENST00000517351 KDM5CP41229 1560 aa40.52■■■■■ 4.08
TCEA1-202ENST00000517351 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.51■■■■■ 4.08
TCEA1-202ENST00000517351 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.5■■■■■ 4.07
TCEA1-202ENST00000517351 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.49■■■■■ 4.07
TCEA1-202ENST00000517351 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
TCEA1-202ENST00000517351 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.45■■■■■ 4.07
TCEA1-202ENST00000517351 MAP3K1Q13233 1512 aa40.45■■■■■ 4.07
TCEA1-202ENST00000517351 NCOA2Q15596 1464 aa40.44■■■■■ 4.06
TCEA1-202ENST00000517351 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.44■■■■■ 4.06
TCEA1-202ENST00000517351 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.44■■■■■ 4.06
TCEA1-202ENST00000517351 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.42■■■■■ 4.06
TCEA1-202ENST00000517351 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.42■■■■■ 4.06
TCEA1-202ENST00000517351 ATP10AO60312 1499 aa40.41■■■■■ 4.06
TCEA1-202ENST00000517351 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.4■■■■■ 4.06
TCEA1-202ENST00000517351 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.39■■■■■ 4.06
TCEA1-202ENST00000517351 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.39■■■■■ 4.06
TCEA1-202ENST00000517351 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.054e-7■■■■□ 21.8
TCEA1-202ENST00000517351 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.37■■■■■ 4.05
TCEA1-202ENST00000517351 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.37■■■■■ 4.05
TCEA1-202ENST00000517351 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.36■■■■■ 4.05
TCEA1-202ENST00000517351 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
TCEA1-202ENST00000517351 APLP2Q06481 763 aa40.32■■■■■ 4.05
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
TCEA1-202ENST00000517351 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.31■■■■■ 4.04
TCEA1-202ENST00000517351 ABCA6Q8N139 1617 aa40.28■■■■■ 4.04
TCEA1-202ENST00000517351 MADDQ8WXG6 1647 aa40.27■■■■■ 4.04
TCEA1-202ENST00000517351 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.26■■■■■ 4.04
TCEA1-202ENST00000517351 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
TCEA1-202ENST00000517351 MLECQ14165 292 aa40.24■■■■■ 4.03
TCEA1-202ENST00000517351 PTPRMP28827 1452 aa40.22■■■■■ 4.03
TCEA1-202ENST00000517351 REREQ9P2R6 1566 aa40.2■■■■■ 4.03
TCEA1-202ENST00000517351 MBD5Q9P267 1494 aa40.18■■■■■ 4.02
TCEA1-202ENST00000517351 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.17■■■■■ 4.02
TCEA1-202ENST00000517351 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
TCEA1-202ENST00000517351 ATP7AQ04656 1500 aa40.15■■■■■ 4.02
TCEA1-202ENST00000517351 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
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TCEA1-202ENST00000517351 AGLP35573 1532 aa40.08■■■■■ 4.01
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.05■■■■■ 4
TCEA1-202ENST00000517351 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.04■■■■■ 4
TCEA1-202ENST00000517351 MIA2Q96PC5 1412 aa40.03■■■■■ 4
TCEA1-202ENST00000517351 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40■■■■□ 3.99
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TCEA1-202ENST00000517351 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.97■■■■□ 3.99
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TCEA1-202ENST00000517351 PLXNC1O60486 1568 aa39.93■■■■□ 3.98
TCEA1-202ENST00000517351 TSPY4P0CV99 314 aa39.9■■■■□ 3.98
TCEA1-202ENST00000517351 TSPY10P0CW01 314 aa39.9■■■■□ 3.98
TCEA1-202ENST00000517351 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
TCEA1-202ENST00000517351 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.83■■■■□ 3.97
TCEA1-202ENST00000517351 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.82■■■■□ 3.96
TCEA1-202ENST00000517351 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
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TCEA1-202ENST00000517351 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.76■■■■□ 3.96
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TCEA1-202ENST00000517351 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
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TCEA1-202ENST00000517351 C3P01024 1663 aa39.7■■■■□ 3.95
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TCEA1-202ENST00000517351 KIF3BO15066 747 aa39.67■■■■□ 3.94
TCEA1-202ENST00000517351 MROH2AA6NES4 1674 aa39.64■■■■□ 3.94
TCEA1-202ENST00000517351 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.64■■■■□ 3.94
TCEA1-202ENST00000517351 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.64■■■■□ 3.94
TCEA1-202ENST00000517351 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
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TCEA1-202ENST00000517351 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.63■■■■□ 3.94
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TCEA1-202ENST00000517351 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.59■■■■□ 3.93
TCEA1-202ENST00000517351 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
TCEA1-202ENST00000517351 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
TCEA1-202ENST00000517351 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
TCEA1-202ENST00000517351 HSPA2P54652 639 aa39.55■■■■□ 3.92
TCEA1-202ENST00000517351 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.51■■■■□ 3.92
TCEA1-202ENST00000517351 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.51■■■■□ 3.92
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