RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 ERBB3P21860 1342 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-397P-201ENST00000516226 STK25O00506 426 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-397P-201ENST00000516226 POTEB3A0JP26 581 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-397P-201ENST00000516226 POTEBQ6S5H4 581 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-397P-201ENST00000516226 MFRPQ9BY79 579 aa7.75□□□□□ -1.17
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR153Q6NV75 609 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTGER2P43116 358 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-397P-201ENST00000516226 PKD2Q13563 968 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-397P-201ENST00000516226 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIF3CO14782 793 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-397P-201ENST00000516226 RGL2O15211 777 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC34A2O95436 690 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMC2Q8TDI7 906 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-397P-201ENST00000516226 C2orf72A6NCS6 295 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARSIQ5FYB1 569 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-397P-201ENST00000516226 PBX2P40425 430 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-397P-201ENST00000516226 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-397P-201ENST00000516226 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-397P-201ENST00000516226 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-397P-201ENST00000516226 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-397P-201ENST00000516226 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-397P-201ENST00000516226 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-397P-201ENST00000516226 NUDT7P0C024 238 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-397P-201ENST00000516226 FOXK1P85037 733 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-397P-201ENST00000516226 TBC1D12O60347 775 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-397P-201ENST00000516226 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP1R37O75864 691 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-397P-201ENST00000516226 LHX6Q9UPM6 363 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-397P-201ENST00000516226 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLPP6Q8IY26 295 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARHGAP33O14559 1287 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-397P-201ENST00000516226 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-397P-201ENST00000516226 TK2O00142 265 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNH8Q96L42 1107 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-397P-201ENST00000516226 DSG2Q14126 1118 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-397P-201ENST00000516226 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-397P-201ENST00000516226 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-397P-201ENST00000516226 OXER1Q8TDS5 423 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-397P-201ENST00000516226 HCSTQ9UBK5 93 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-397P-201ENST00000516226 PDE4AP27815 886 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-397P-201ENST00000516226 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-397P-201ENST00000516226 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-397P-201ENST00000516226 HRO43593 1189 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 STAC3Q96MF2 364 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 PSEN2P49810 448 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 JPH4Q96JJ6 628 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 FOSBP53539 338 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNK17Q96T54 332 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTPREP23469 700 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 MFSD10Q14728 455 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 EVI5O60447 810 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAP3K9P80192 1104 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 NBPF3Q9H094 633 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 FBXW7Q969H0 707 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-397P-201ENST00000516226 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 IFFO2Q5TF58 517 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 RGS20O76081 388 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 PHF14O94880 888 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 EPAS1Q99814 870 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 CAMK2BQ13554 666 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 WNT2BQ93097 391 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-397P-201ENST00000516226 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.21□□□□□ -1.26
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