RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-215ENST00000514625 MAP3K1Q13233 1512 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-215ENST00000514625 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-215ENST00000514625 PREX2Q70Z35 1606 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-215ENST00000514625 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-215ENST00000514625 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-215ENST00000514625 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-215ENST00000514625 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-215ENST00000514625 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-215ENST00000514625 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-215ENST00000514625 NCOA2Q15596 1464 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-215ENST00000514625 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-215ENST00000514625 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-215ENST00000514625 RICTORQ6R327 1708 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-215ENST00000514625 ABCC1P33527 1531 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-215ENST00000514625 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-215ENST00000514625 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-215ENST00000514625 AFAP1Q8N556 730 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-215ENST00000514625 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-215ENST00000514625 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.95■■■□□ 2.07
FAAP20-215ENST00000514625 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-215ENST00000514625 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-215ENST00000514625 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-215ENST00000514625 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-215ENST00000514625 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-215ENST00000514625 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-215ENST00000514625 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-215ENST00000514625 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-215ENST00000514625 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-215ENST00000514625 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-215ENST00000514625 KDM5CP41229 1560 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-215ENST00000514625 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-215ENST00000514625 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-215ENST00000514625 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-215ENST00000514625 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.83■■■□□ 2.05
FAAP20-215ENST00000514625 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.83■■■□□ 2.05
FAAP20-215ENST00000514625 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.83■■■□□ 2.05
FAAP20-215ENST00000514625 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
FAAP20-215ENST00000514625 ATP10AO60312 1499 aa27.81■■■□□ 2.04
FAAP20-215ENST00000514625 MIA2Q96PC5 1412 aa27.8■■■□□ 2.04
FAAP20-215ENST00000514625 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.8■■■□□ 2.04
FAAP20-215ENST00000514625 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.79■■■□□ 2.04
FAAP20-215ENST00000514625 MBD5Q9P267 1494 aa27.76■■■□□ 2.04
FAAP20-215ENST00000514625 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.76■■■□□ 2.04
FAAP20-215ENST00000514625 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.71■■■□□ 2.03
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.7■■■□□ 2.03
FAAP20-215ENST00000514625 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.7■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 ATP7AQ04656 1500 aa27.69■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 TSPY4P0CV99 314 aa27.69■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 TSPY10P0CW01 314 aa27.69■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 ABCA6Q8N139 1617 aa27.69■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.67■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.67■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.66■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.65■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 MLECQ14165 292 aa27.65■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 REREQ9P2R6 1566 aa27.65■■■□□ 2.02
FAAP20-215ENST00000514625 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
FAAP20-215ENST00000514625 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.63■■■□□ 2.01
FAAP20-215ENST00000514625 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.61■■■□□ 2.01
FAAP20-215ENST00000514625 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.61■■■□□ 2.01
FAAP20-215ENST00000514625 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
FAAP20-215ENST00000514625 A2MP01023 1474 aa27.57■■■□□ 2
FAAP20-215ENST00000514625 AGLP35573 1532 aa27.57■■■□□ 2
FAAP20-215ENST00000514625 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
FAAP20-215ENST00000514625 MADDQ8WXG6 1647 aa27.54■■■□□ 2
FAAP20-215ENST00000514625 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.53■■■□□ 2
FAAP20-215ENST00000514625 PTPRMP28827 1452 aa27.51■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.5■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 ABCC5O15440 1437 aa27.5■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 DAPK1P53355 1430 aa27.49■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 PLXNC1O60486 1568 aa27.48■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.47■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.45■■□□□ 1.99
FAAP20-215ENST00000514625 GGT6Q6P531 493 aa27.42■■□□□ 1.98
FAAP20-215ENST00000514625 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.42■■□□□ 1.98
FAAP20-215ENST00000514625 KIF3BO15066 747 aa27.41■■□□□ 1.98
FAAP20-215ENST00000514625 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.41■■□□□ 1.98
FAAP20-215ENST00000514625 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.4■■□□□ 1.98
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.38■■□□□ 1.97
FAAP20-215ENST00000514625 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.38■■□□□ 1.97
FAAP20-215ENST00000514625 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.38■■□□□ 1.97
FAAP20-215ENST00000514625 KIF15Q9NS87 1388 aa27.37■■□□□ 1.97
FAAP20-215ENST00000514625 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.37■■□□□ 1.97
FAAP20-215ENST00000514625 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.35■■□□□ 1.97
FAAP20-215ENST00000514625 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
FAAP20-215ENST00000514625 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
FAAP20-215ENST00000514625 NCOA1Q15788 1441 aa27.31■■□□□ 1.96
FAAP20-215ENST00000514625 ITGAEP38570 1179 aa27.29■■□□□ 1.96
FAAP20-215ENST00000514625 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
FAAP20-215ENST00000514625 ADGRL2O95490 1459 aa27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms