RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514536.5

USP46-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 2

Gene USP46, Length 1,589 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-209ENST00000514536 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.9■■□□□ 1.1
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USP46-209ENST00000514536 ADGRL1O94910 1474 aa21.87■■□□□ 1.09
USP46-209ENST00000514536 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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USP46-209ENST00000514536 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.081e-7■■■□□ 14.8
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USP46-209ENST00000514536 ABCC1P33527 1531 aa21.72■■□□□ 1.07
USP46-209ENST00000514536 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.72■■□□□ 1.07
USP46-209ENST00000514536 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.71■■□□□ 1.07
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USP46-209ENST00000514536 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.69■■□□□ 1.06
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USP46-209ENST00000514536 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.68■■□□□ 1.06
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USP46-209ENST00000514536 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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USP46-209ENST00000514536 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.61■■□□□ 1.05
USP46-209ENST00000514536 ATP10AO60312 1499 aa21.59■■□□□ 1.05
USP46-209ENST00000514536 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.57■■□□□ 1.04
USP46-209ENST00000514536 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.55■■□□□ 1.04
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USP46-209ENST00000514536 TSPY10P0CW01 314 aa21.54■■□□□ 1.04
USP46-209ENST00000514536 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.54■■□□□ 1.04
USP46-209ENST00000514536 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.53■■□□□ 1.04
USP46-209ENST00000514536 MLECQ14165 292 aa21.53■■□□□ 1.04
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USP46-209ENST00000514536 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.49■■□□□ 1.03
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USP46-209ENST00000514536 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.46■■□□□ 1.03
USP46-209ENST00000514536 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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USP46-209ENST00000514536 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.43■■□□□ 1.02
USP46-209ENST00000514536 A2MP01023 1474 aa21.43■■□□□ 1.02
USP46-209ENST00000514536 REREQ9P2R6 1566 aa21.42■■□□□ 1.02
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USP46-209ENST00000514536 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.4■■□□□ 1.02
USP46-209ENST00000514536 DAPK1P53355 1430 aa21.4■■□□□ 1.02
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USP46-209ENST00000514536 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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USP46-209ENST00000514536 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
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USP46-209ENST00000514536 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
USP46-209ENST00000514536 PTPRKQ15262 1439 aa21.28■■□□□ 1
USP46-209ENST00000514536 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
USP46-209ENST00000514536 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.28■■□□□ 1
USP46-209ENST00000514536 NCOA1Q15788 1441 aa21.27■■□□□ 1
USP46-209ENST00000514536 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.26■□□□□ 0.99
USP46-209ENST00000514536 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.25■□□□□ 0.99
USP46-209ENST00000514536 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.25■□□□□ 0.99
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