RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513985.5

ZNF608-208, Transcript of zinc finger protein 608, human

TSL 1 (best)

Gene ZNF608, Length 1,539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF608-208	ENST00000513985	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ZNF608-208	ENST00000513985	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF608-208	ENST00000513985	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ZNF608-208	ENST00000513985	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ZNF608-208	ENST00000513985	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ZNF608-208	ENST00000513985	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ZNF608-208	ENST00000513985	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ZNF608-208	ENST00000513985	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ZNF608-208	ENST00000513985	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ZNF608-208	ENST00000513985	PROM2	Q8N271	834 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ZNF608-208	ENST00000513985	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	TSPOAP1	O95153	1857 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	KCNH8	Q96L42	1107 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ZNF608-208	ENST00000513985	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	KIF14	Q15058	1648 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	PKD2	Q13563	968 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ZNF608-208	ENST00000513985	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ZNF608-208	ENST00000513985	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ZNF608-208	ENST00000513985	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ZNF608-208	ENST00000513985	PLCH2	O75038	1416 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ZNF608-208	ENST00000513985	KDM6B	O15054	1643 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ZNF608-208	ENST00000513985	NEO1	Q92859	1461 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ZNF608-208	ENST00000513985	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ZNF608-208	ENST00000513985	APLP2	Q06481	763 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ZNF608-208	ENST00000513985	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ZNF608-208	ENST00000513985	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ZNF608-208	ENST00000513985	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	FANCA	O15360	1455 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
ZNF608-208	ENST00000513985	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	RICTOR	Q6R327	1708 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	ABCC1	P33527	1531 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	KDM5C	P41229	1560 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ZNF608-208	ENST00000513985	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.18	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.16	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ZNF608-208	ENST00000513985	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ZNF608-208	ENST00000513985	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ZNF608-208	ENST00000513985	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ZNF608-208	ENST00000513985	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ZNF608-208	ENST00000513985	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
ZNF608-208	ENST00000513985	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31

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