RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PREX2Q70Z35 1606 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ASXL2Q76L83 1435 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSPY4P0CV99 314 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSPY10P0CW01 314 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DAPK1P53355 1430 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLCH2O75038 1416 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ROCK1Q13464 1354 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HFM1A2PYH4 1435 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AKNAQ7Z591 1439 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABCC5O15440 1437 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAPKBP1O60336 1514 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTPRKQ15262 1439 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GCC2Q8IWJ2 1684 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NAIPQ13075 1403 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CD109Q6YHK3 1445 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FANCAO15360 1455 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADGRL2O95490 1459 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NCOA1Q15788 1441 aa17.89■□□□□ 0.46
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRIM52Q96A61 297 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MBD5Q9P267 1494 aa17.88■□□□□ 0.45
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABCC1P33527 1531 aa17.86■□□□□ 0.45
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GLI2P10070 1586 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAST1Q9Y2H9 1570 aa17.85■□□□□ 0.45
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADGRL1O94910 1474 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF15Q9NS87 1388 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEO1Q92859 1461 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLXNC1O60486 1568 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DIP2BQ9P265 1576 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AFAP1Q8N556 730 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERBINQ96RT1 1412 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP7AQ04656 1500 aa17.7■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KDM6BO15054 1643 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NUP155O75694 1391 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEUROD1Q13562 356 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KANK1Q14678 1352 aa17.66■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSPOAP1O95153 1857 aa17.65■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MLH3Q9UHC1 1453 aa17.65■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.65■□□□□ 0.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TONSLQ96HA7 1378 aa17.64■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KDM5CP41229 1560 aa17.63■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HECW2Q9P2P5 1572 aa17.63■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.62■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PKD2Q13563 968 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UNC13BO14795 1591 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17.58■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PZPP20742 1482 aa17.58■□□□□ 0.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAPGEF3O95398 923 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A2MP01023 1474 aa17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms