RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513095.5

SH3BP2-226, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-226ENST00000513095 RAPGEF3O95398 923 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-226ENST00000513095 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 ADGRL1O94910 1474 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 RICTORQ6R327 1708 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 APLP2Q06481 763 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 NCOA2Q15596 1464 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-226ENST00000513095 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-226ENST00000513095 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCC1P33527 1531 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-226ENST00000513095 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-226ENST00000513095 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-226ENST00000513095 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-226ENST00000513095 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-226ENST00000513095 AFAP1Q8N556 730 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-226ENST00000513095 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-226ENST00000513095 KDM5CP41229 1560 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-226ENST00000513095 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-226ENST00000513095 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-226ENST00000513095 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-226ENST00000513095 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-226ENST00000513095 MBD5Q9P267 1494 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-226ENST00000513095 MIA2Q96PC5 1412 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP2-226ENST00000513095 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-226ENST00000513095 ATP10AO60312 1499 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-226ENST00000513095 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-226ENST00000513095 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCA6Q8N139 1617 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 ATP7AQ04656 1500 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-226ENST00000513095 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-226ENST00000513095 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-226ENST00000513095 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-226ENST00000513095 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-226ENST00000513095 REREQ9P2R6 1566 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-226ENST00000513095 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-226ENST00000513095 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-226ENST00000513095 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-226ENST00000513095 TSPY4P0CV99 314 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-226ENST00000513095 TSPY10P0CW01 314 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-226ENST00000513095 AGLP35573 1532 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-226ENST00000513095 MLECQ14165 292 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-226ENST00000513095 MADDQ8WXG6 1647 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-226ENST00000513095 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-226ENST00000513095 A2MP01023 1474 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-226ENST00000513095 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-226ENST00000513095 PLXNC1O60486 1568 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCC5O15440 1437 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-226ENST00000513095 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SH3BP2-226ENST00000513095 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-226ENST00000513095 DAPK1P53355 1430 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-226ENST00000513095 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-226ENST00000513095 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-226ENST00000513095 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-226ENST00000513095 PTPRMP28827 1452 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-226ENST00000513095 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-226ENST00000513095 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-226ENST00000513095 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-226ENST00000513095 GGT6Q6P531 493 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 KIF15Q9NS87 1388 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 KIF3BO15066 747 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 PTPRKQ15262 1439 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 ADGRL2O95490 1459 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 NCOA1Q15788 1441 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-226ENST00000513095 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms