RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512212.1

CD164-209, Transcript of CD164 molecule, humanhuman

TSL 2

Gene CD164, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164-209ENST00000512212 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.25■■□□□ 1.15
CD164-209ENST00000512212 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.23■■□□□ 1.15
CD164-209ENST00000512212 FANCAO15360 1455 aa22.22■■□□□ 1.15
CD164-209ENST00000512212 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CD164-209ENST00000512212 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
CD164-209ENST00000512212 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.2■■□□□ 1.14
CD164-209ENST00000512212 AKNAQ7Z591 1439 aa22.17■■□□□ 1.14
CD164-209ENST00000512212 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.17■■□□□ 1.14
CD164-209ENST00000512212 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CD164-209ENST00000512212 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.15■■□□□ 1.14
CD164-209ENST00000512212 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.15■■□□□ 1.14
CD164-209ENST00000512212 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.15■■□□□ 1.14
CD164-209ENST00000512212 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.14■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.13■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 RAPGEF3O95398 923 aa22.13■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 NEO1Q92859 1461 aa22.13■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.134e-8■■■□□ 18.4
CD164-209ENST00000512212 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.11■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 ABCC1P33527 1531 aa22.11■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 ADGRL1O94910 1474 aa22.1■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.1■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 KDM6BO15054 1643 aa22.1■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 RICTORQ6R327 1708 aa22.1■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.1■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.1■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.1■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.09■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.08■■□□□ 1.13
CD164-209ENST00000512212 AFAP1Q8N556 730 aa22.07■■□□□ 1.12
CD164-209ENST00000512212 MBD5Q9P267 1494 aa22.04■■□□□ 1.12
CD164-209ENST00000512212 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CD164-209ENST00000512212 MIA2Q96PC5 1412 aa22.02■■□□□ 1.12
CD164-209ENST00000512212 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CD164-209ENST00000512212 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.01■■□□□ 1.11
CD164-209ENST00000512212 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CD164-209ENST00000512212 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CD164-209ENST00000512212 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.97■■□□□ 1.11
CD164-209ENST00000512212 PTPRKQ15262 1439 aa21.96■■□□□ 1.11
CD164-209ENST00000512212 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.96■■□□□ 1.11
CD164-209ENST00000512212 ABCC5O15440 1437 aa21.95■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 KDM5CP41229 1560 aa21.95■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.94■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.94■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.93■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.93■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 ITGAEP38570 1179 aa21.92■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.91■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.9■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.9■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 ABCA6Q8N139 1617 aa21.9■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.9■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.9■■□□□ 1.1
CD164-209ENST00000512212 DAPK1P53355 1430 aa21.89■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.87■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.87■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.85■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 ATP7AQ04656 1500 aa21.85■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.83■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.83■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.83■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.83■■□□□ 1.09
CD164-209ENST00000512212 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.82■■□□□ 1.08
CD164-209ENST00000512212 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.8■■□□□ 1.08
CD164-209ENST00000512212 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.081e-7■■■□□ 18.7
CD164-209ENST00000512212 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.77■■□□□ 1.08
CD164-209ENST00000512212 TSPY4P0CV99 314 aa21.75■■□□□ 1.07
CD164-209ENST00000512212 TSPY10P0CW01 314 aa21.75■■□□□ 1.07
CD164-209ENST00000512212 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.75■■□□□ 1.07
CD164-209ENST00000512212 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.75■■□□□ 1.07
CD164-209ENST00000512212 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.74■■□□□ 1.07
CD164-209ENST00000512212 ATP10AO60312 1499 aa21.74■■□□□ 1.07
CD164-209ENST00000512212 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.73■■□□□ 1.07
CD164-209ENST00000512212 NCOA1Q15788 1441 aa21.72■■□□□ 1.07
CD164-209ENST00000512212 PLXNC1O60486 1568 aa21.71■■□□□ 1.07
CD164-209ENST00000512212 ADGRL2O95490 1459 aa21.71■■□□□ 1.07
CD164-209ENST00000512212 A2MP01023 1474 aa21.7■■□□□ 1.06
CD164-209ENST00000512212 KIF15Q9NS87 1388 aa21.69■■□□□ 1.06
CD164-209ENST00000512212 MLECQ14165 292 aa21.67■■□□□ 1.06
CD164-209ENST00000512212 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CD164-209ENST00000512212 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.65■■□□□ 1.06
CD164-209ENST00000512212 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 REREQ9P2R6 1566 aa21.63■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 NAIPQ13075 1403 aa21.61■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 ROCK1Q13464 1354 aa21.61■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.6■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.6■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 KIF3BO15066 747 aa21.6■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.59■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.59■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 AGLP35573 1532 aa21.59■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.58■■□□□ 1.05
CD164-209ENST00000512212 GGT6Q6P531 493 aa21.56■■□□□ 1.04
CD164-209ENST00000512212 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.56■■□□□ 1.04
CD164-209ENST00000512212 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.55■■□□□ 1.04
CD164-209ENST00000512212 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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