RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507305.5

FAM200B-211, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 2

Gene FAM200B, Length 800 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-211ENST00000507305 NEO1Q92859 1461 aa29.1■■■□□ 2.25
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FAM200B-211ENST00000507305 FANCAO15360 1455 aa29.1■■■□□ 2.25
FAM200B-211ENST00000507305 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
FAM200B-211ENST00000507305 NCOA2Q15596 1464 aa29.09■■■□□ 2.25
FAM200B-211ENST00000507305 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.09■■■□□ 2.25
FAM200B-211ENST00000507305 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
FAM200B-211ENST00000507305 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.06■■■□□ 2.24
FAM200B-211ENST00000507305 AKNAQ7Z591 1439 aa29.06■■■□□ 2.24
FAM200B-211ENST00000507305 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
FAM200B-211ENST00000507305 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.03■■■□□ 2.24
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FAM200B-211ENST00000507305 RAPGEF3O95398 923 aa28.93■■■□□ 2.22
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FAM200B-211ENST00000507305 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.84■■■□□ 2.21
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FAM200B-211ENST00000507305 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.84■■■□□ 2.21
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FAM200B-211ENST00000507305 AFAP1Q8N556 730 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM200B-211ENST00000507305 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.78■■■□□ 2.2
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FAM200B-211ENST00000507305 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.76■■■□□ 2.19
FAM200B-211ENST00000507305 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.75■■■□□ 2.19
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FAM200B-211ENST00000507305 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.7■■■□□ 2.18
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FAM200B-211ENST00000507305 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.69■■■□□ 2.18
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FAM200B-211ENST00000507305 KDM5CP41229 1560 aa28.67■■■□□ 2.18
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FAM200B-211ENST00000507305 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.64■■■□□ 2.17
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FAM200B-211ENST00000507305 ILDR2Q71H61 639 aa28.62■■■□□ 2.17
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FAM200B-211ENST00000507305 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.56■■■□□ 2.16
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FAM200B-211ENST00000507305 ATP10AO60312 1499 aa28.55■■■□□ 2.16
FAM200B-211ENST00000507305 ABCC5O15440 1437 aa28.54■■■□□ 2.16
FAM200B-211ENST00000507305 ATP7AQ04656 1500 aa28.53■■■□□ 2.16
FAM200B-211ENST00000507305 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.52■■■□□ 2.16
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FAM200B-211ENST00000507305 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
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FAM200B-211ENST00000507305 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
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FAM200B-211ENST00000507305 AGLP35573 1532 aa28.33■■■□□ 2.13
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FAM200B-211ENST00000507305 KIF15Q9NS87 1388 aa28.32■■■□□ 2.12
FAM200B-211ENST00000507305 PLXNC1O60486 1568 aa28.32■■■□□ 2.12
FAM200B-211ENST00000507305 ADGRL2O95490 1459 aa28.31■■■□□ 2.12
FAM200B-211ENST00000507305 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.31■■■□□ 2.12
FAM200B-211ENST00000507305 ROCK1Q13464 1354 aa28.28■■■□□ 2.12
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