RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504927.5

DDR1-255, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, human

TSL 4

Gene DDR1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDR1-255	ENST00000504927	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.54	■■■□□ 2.8
DDR1-255	ENST00000504927	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.54	■■■□□ 2.8
DDR1-255	ENST00000504927	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.54	■■■□□ 2.8
DDR1-255	ENST00000504927	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.52	■■■□□ 2.8
DDR1-255	ENST00000504927	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.52	■■■□□ 2.8
DDR1-255	ENST00000504927	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.51	■■■□□ 2.79
DDR1-255	ENST00000504927	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.51	■■■□□ 2.79
DDR1-255	ENST00000504927	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.51	■■■□□ 2.79
DDR1-255	ENST00000504927	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.49	■■■□□ 2.79
DDR1-255	ENST00000504927	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
DDR1-255	ENST00000504927	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.46	■■■□□ 2.79
DDR1-255	ENST00000504927	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
DDR1-255	ENST00000504927	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.45	■■■□□ 2.79
DDR1-255	ENST00000504927	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.43	■■■□□ 2.78
DDR1-255	ENST00000504927	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.43	■■■□□ 2.78
DDR1-255	ENST00000504927	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.41	■■■□□ 2.78
DDR1-255	ENST00000504927	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
DDR1-255	ENST00000504927	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
DDR1-255	ENST00000504927	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DDR1-255	ENST00000504927	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
DDR1-255	ENST00000504927	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.35	■■■□□ 2.77
DDR1-255	ENST00000504927	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.34	■■■□□ 2.77
DDR1-255	ENST00000504927	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.34	■■■□□ 2.77
DDR1-255	ENST00000504927	ABCC1	P33527	1531 aa		32.34	■■■□□ 2.77
DDR1-255	ENST00000504927	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.34	■■■□□ 2.77
DDR1-255	ENST00000504927	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.32	■■■□□ 2.76
DDR1-255	ENST00000504927	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.32	■■■□□ 2.76
DDR1-255	ENST00000504927	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.3	■■■□□ 2.76
DDR1-255	ENST00000504927	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.3	■■■□□ 2.76
DDR1-255	ENST00000504927	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.29	■■■□□ 2.76
DDR1-255	ENST00000504927	KDM5C	P41229	1560 aa		32.28	■■■□□ 2.76
DDR1-255	ENST00000504927	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.28	■■■□□ 2.76
DDR1-255	ENST00000504927	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.28	■■■□□ 2.76
DDR1-255	ENST00000504927	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.26	■■■□□ 2.75
DDR1-255	ENST00000504927	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.25	■■■□□ 2.75
DDR1-255	ENST00000504927	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.23	■■■□□ 2.75
DDR1-255	ENST00000504927	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
DDR1-255	ENST00000504927	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.2	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.19	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.19	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.19	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.19	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.18	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	ATP10A	O60312	1499 aa		32.16	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.14	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.14	■■■□□ 2.74
DDR1-255	ENST00000504927	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.13	■■■□□ 2.73
DDR1-255	ENST00000504927	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.13	■■■□□ 2.73
DDR1-255	ENST00000504927	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.11	■■■□□ 2.73
DDR1-255	ENST00000504927	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.11	■■■□□ 2.73
DDR1-255	ENST00000504927	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.09	■■■□□ 2.73
DDR1-255	ENST00000504927	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.09	■■■□□ 2.73
DDR1-255	ENST00000504927	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.08	■■■□□ 2.73
DDR1-255	ENST00000504927	PTPRM	P28827	1452 aa		32.02	■■■□□ 2.72
DDR1-255	ENST00000504927	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.01	■■■□□ 2.71
DDR1-255	ENST00000504927	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.01	■■■□□ 2.71
DDR1-255	ENST00000504927	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32	■■■□□ 2.71
DDR1-255	ENST00000504927	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32	■■■□□ 2.71
DDR1-255	ENST00000504927	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
DDR1-255	ENST00000504927	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
DDR1-255	ENST00000504927	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.99	■■■□□ 2.71
DDR1-255	ENST00000504927	MLEC	Q14165	292 aa		31.97	■■■□□ 2.71
DDR1-255	ENST00000504927	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.96	■■■□□ 2.71
DDR1-255	ENST00000504927	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.95	■■■□□ 2.71
DDR1-255	ENST00000504927	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.94	■■■□□ 2.7
DDR1-255	ENST00000504927	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.92	■■■□□ 2.7
DDR1-255	ENST00000504927	AGL	P35573	1532 aa		31.89	■■■□□ 2.7
DDR1-255	ENST00000504927	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.87	■■■□□ 2.69
DDR1-255	ENST00000504927	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
DDR1-255	ENST00000504927	A2M	P01023	1474 aa		31.85	■■■□□ 2.69
DDR1-255	ENST00000504927	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
DDR1-255	ENST00000504927	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.84	■■■□□ 2.69
DDR1-255	ENST00000504927	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
DDR1-255	ENST00000504927	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
DDR1-255	ENST00000504927	ABCC5	O15440	1437 aa		31.78	■■■□□ 2.68
DDR1-255	ENST00000504927	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.77	■■■□□ 2.68
DDR1-255	ENST00000504927	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
DDR1-255	ENST00000504927	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.77	■■■□□ 2.68
DDR1-255	ENST00000504927	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.76	■■■□□ 2.67
DDR1-255	ENST00000504927	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.74	■■■□□ 2.67
DDR1-255	ENST00000504927	DAPK1	P53355	1430 aa		31.74	■■■□□ 2.67
DDR1-255	ENST00000504927	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.72	■■■□□ 2.67
DDR1-255	ENST00000504927	GGT6	Q6P531	493 aa		31.69	■■■□□ 2.66
DDR1-255	ENST00000504927	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
DDR1-255	ENST00000504927	KIF3B	O15066	747 aa		31.68	■■■□□ 2.66
DDR1-255	ENST00000504927	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
DDR1-255	ENST00000504927	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.66	■■■□□ 2.66
DDR1-255	ENST00000504927	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.66	■■■□□ 2.66
DDR1-255	ENST00000504927	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	31.65	■■■□□ 2.66
DDR1-255	ENST00000504927	C3	P01024	1663 aa		31.64	■■■□□ 2.66
DDR1-255	ENST00000504927	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		31.64	■■■□□ 2.66
DDR1-255	ENST00000504927	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		31.63	■■■□□ 2.65
DDR1-255	ENST00000504927	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.63	■■■□□ 2.65
DDR1-255	ENST00000504927	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		31.61	■■■□□ 2.65
DDR1-255	ENST00000504927	KIF15	Q9NS87	1388 aa		31.6	■■■□□ 2.65
DDR1-255	ENST00000504927	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		31.59	■■■□□ 2.65
DDR1-255	ENST00000504927	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.58	■■■□□ 2.65
DDR1-255	ENST00000504927	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64

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