RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.87■□□□□ 0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.87■□□□□ 0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.84■□□□□ 0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.83■□□□□ 0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.82■□□□□ 0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 FANCAO15360 1455 aa20.8■□□□□ 0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 NCOA2Q15596 1464 aa20.8■□□□□ 0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 PLCH2O75038 1416 aa20.79■□□□□ 0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.77■□□□□ 0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.76■□□□□ 0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.76■□□□□ 0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 PREX2Q70Z35 1606 aa20.75■□□□□ 0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 RAPGEF3O95398 923 aa20.74■□□□□ 0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 NEO1Q92859 1461 aa20.74■□□□□ 0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PGGT1B-204ENST00000503638 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.73■□□□□ 0.91
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PGGT1B-204ENST00000503638 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.72■□□□□ 0.91
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PGGT1B-204ENST00000503638 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.7■□□□□ 0.9
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PGGT1B-204ENST00000503638 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.62■□□□□ 0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 PTPRMP28827 1452 aa20.62■□□□□ 0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.61■□□□□ 0.89
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PGGT1B-204ENST00000503638 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.6■□□□□ 0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.6■□□□□ 0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.59■□□□□ 0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
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PGGT1B-204ENST00000503638 MIA2Q96PC5 1412 aa20.57■□□□□ 0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.56■□□□□ 0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.56■□□□□ 0.88
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PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.56■□□□□ 0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 AFAP1Q8N556 730 aa20.55■□□□□ 0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.54■□□□□ 0.88
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PGGT1B-204ENST00000503638 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.53■□□□□ 0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.53■□□□□ 0.88
PGGT1B-204ENST00000503638 RICTORQ6R327 1708 aa20.53■□□□□ 0.88
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PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.48■□□□□ 0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.47■□□□□ 0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.47■□□□□ 0.87
PGGT1B-204ENST00000503638 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.45■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 MBD5Q9P267 1494 aa20.45■□□□□ 0.86
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PGGT1B-204ENST00000503638 TSPY10P0CW01 314 aa20.45■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 KDM5CP41229 1560 aa20.45■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 HSPA2P54652 639 aa20.44■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.44■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 ITGAEP38570 1179 aa20.43■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.43■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.43■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.42■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.42■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP7AQ04656 1500 aa20.4■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.4■□□□□ 0.86
PGGT1B-204ENST00000503638 DAPK1P53355 1430 aa20.38■□□□□ 0.85
PGGT1B-204ENST00000503638 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.38■□□□□ 0.85
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PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.37■□□□□ 0.85
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PGGT1B-204ENST00000503638 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PGGT1B-204ENST00000503638 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCC5O15440 1437 aa20.36■□□□□ 0.85
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCA6Q8N139 1617 aa20.36■□□□□ 0.85
PGGT1B-204ENST00000503638 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.36■□□□□ 0.85
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP10AO60312 1499 aa20.36■□□□□ 0.85
PGGT1B-204ENST00000503638 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PGGT1B-204ENST00000503638 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.34■□□□□ 0.85
PGGT1B-204ENST00000503638 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.34■□□□□ 0.85
PGGT1B-204ENST00000503638 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.32■□□□□ 0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.31■□□□□ 0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.3■□□□□ 0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.29■□□□□ 0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 A2MP01023 1474 aa20.29■□□□□ 0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.28■□□□□ 0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.27■□□□□ 0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF15Q9NS87 1388 aa20.26■□□□□ 0.83
PGGT1B-204ENST00000503638 PLXNC1O60486 1568 aa20.25■□□□□ 0.83
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