RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.04□□□□□ -0.32
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RABGGTB-214ENST00000497648 VSIG10Q8N0Z9 540 aa13.03□□□□□ -0.32
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RABGGTB-214ENST00000497648 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.01□□□□□ -0.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RABGGTB-214ENST00000497648 HRCP23327 699 aa12.97□□□□□ -0.33
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RABGGTB-214ENST00000497648 SLC39A7Q92504 469 aa12.82□□□□□ -0.36
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RABGGTB-214ENST00000497648 C7P10643 843 aa12.79□□□□□ -0.36
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RABGGTB-214ENST00000497648 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.64□□□□□ -0.39
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RABGGTB-214ENST00000497648 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
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RABGGTB-214ENST00000497648 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa12.53□□□□□ -0.4
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RABGGTB-214ENST00000497648 TOPBP1Q92547 1522 aa12.5□□□□□ -0.41
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RABGGTB-214ENST00000497648 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGGTB-214ENST00000497648 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGGTB-214ENST00000497648 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
RABGGTB-214ENST00000497648 CUX1P39880 1505 aa12.47□□□□□ -0.41
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCC8Q09428 1581 aa12.46□□□□□ -0.41
RABGGTB-214ENST00000497648 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGGTB-214ENST00000497648 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGGTB-214ENST00000497648 OTUD5Q96G74 571 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGGTB-214ENST00000497648 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
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