RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 ARAP1Q96P48 1450 aa15.4■□□□□ 0.06
CTPS1-211ENST00000497210 FMN1Q68DA7 1419 aa15.39■□□□□ 0.05
CTPS1-211ENST00000497210 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.38■□□□□ 0.05
CTPS1-211ENST00000497210 RGL2O15211 777 aa15.38■□□□□ 0.05
CTPS1-211ENST00000497210 GSE1Q14687 1217 aa15.37■□□□□ 0.05
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CTPS1-211ENST00000497210 ARHGEF11O15085 1522 aa15.31■□□□□ 0.04
CTPS1-211ENST00000497210 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.31■□□□□ 0.04
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CTPS1-211ENST00000497210 FAM212AQ96EL1 285 aa15.3■□□□□ 0.04
CTPS1-211ENST00000497210 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.29■□□□□ 0.04
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CTPS1-211ENST00000497210 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.27■□□□□ 0.03
CTPS1-211ENST00000497210 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.27■□□□□ 0.03
CTPS1-211ENST00000497210 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.25■□□□□ 0.03
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CTPS1-211ENST00000497210 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
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CTPS1-211ENST00000497210 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.12■□□□□ 0.01
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CTPS1-211ENST00000497210 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.02■□□□□ -0
CTPS1-211ENST00000497210 ARID3CA6NKF2 412 aa15.01□□□□□ -0.01
CTPS1-211ENST00000497210 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.01□□□□□ -0.01
CTPS1-211ENST00000497210 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.01□□□□□ -0.01
CTPS1-211ENST00000497210 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.99□□□□□ -0.01
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CTPS1-211ENST00000497210 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.98□□□□□ -0.01
CTPS1-211ENST00000497210 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.97□□□□□ -0.01
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CTPS1-211ENST00000497210 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CTPS1-211ENST00000497210 ASXL2Q76L83 1435 aa14.96□□□□□ -0.01
CTPS1-211ENST00000497210 NCOA2Q15596 1464 aa14.95□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.94□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.92□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 CFAP44Q96MT7 982 aa14.91□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.91□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 STK25O00506 426 aa14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 PREX2Q70Z35 1606 aa14.9□□□□□ -0.02
CTPS1-211ENST00000497210 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.88□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 DIP2BQ9P265 1576 aa14.88□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.88□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-211ENST00000497210 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.87□□□□□ -0.03
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