RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492947.1

AGRN-209, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-209ENST00000492947 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.3■■□□□ 1.96
AGRN-209ENST00000492947 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.29■■□□□ 1.96
AGRN-209ENST00000492947 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.29■■□□□ 1.96
AGRN-209ENST00000492947 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.27■■□□□ 1.96
AGRN-209ENST00000492947 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.26■■□□□ 1.95
AGRN-209ENST00000492947 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.26■■□□□ 1.95
AGRN-209ENST00000492947 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.24■■□□□ 1.95
AGRN-209ENST00000492947 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.23■■□□□ 1.95
AGRN-209ENST00000492947 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.21■■□□□ 1.95
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AGRN-209ENST00000492947 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.19■■□□□ 1.94
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AGRN-209ENST00000492947 PREX2Q70Z35 1606 aa27.16■■□□□ 1.94
AGRN-209ENST00000492947 KDM5CP41229 1560 aa27.16■■□□□ 1.94
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AGRN-209ENST00000492947 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.14■■□□□ 1.94
AGRN-209ENST00000492947 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.13■■□□□ 1.93
AGRN-209ENST00000492947 AFAP1Q8N556 730 aa27.13■■□□□ 1.93
AGRN-209ENST00000492947 CEP162Q5TB80 1403 aa27.12■■□□□ 1.93
AGRN-209ENST00000492947 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
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AGRN-209ENST00000492947 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27■■□□□ 1.91
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AGRN-209ENST00000492947 TIAM1Q13009 1591 aa26.9■■□□□ 1.9
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AGRN-209ENST00000492947 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
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AGRN-209ENST00000492947 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.84■■□□□ 1.89
AGRN-209ENST00000492947 MBD5Q9P267 1494 aa26.83■■□□□ 1.89
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AGRN-209ENST00000492947 A2MP01023 1474 aa26.68■■□□□ 1.86
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AGRN-209ENST00000492947 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.58■■□□□ 1.85
AGRN-209ENST00000492947 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.58■■□□□ 1.85
AGRN-209ENST00000492947 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
AGRN-209ENST00000492947 ZMYM3Q14202 1370 aa26.57■■□□□ 1.84
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AGRN-209ENST00000492947 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.52■■□□□ 1.84
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AGRN-209ENST00000492947 TSPY4P0CV99 314 aa26.41■■□□□ 1.82
AGRN-209ENST00000492947 TSPY10P0CW01 314 aa26.41■■□□□ 1.82
AGRN-209ENST00000492947 KIF3BO15066 747 aa26.4■■□□□ 1.82
AGRN-209ENST00000492947 FBXO41Q8TF61 875 aa26.4■■□□□ 1.82
AGRN-209ENST00000492947 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.38■■□□□ 1.81
AGRN-209ENST00000492947 NCOA1Q15788 1441 aa26.38■■□□□ 1.81
AGRN-209ENST00000492947 PTPRTO14522 1441 aa26.36■■□□□ 1.81
AGRN-209ENST00000492947 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.34■■□□□ 1.81
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