RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490697.1

HDLBP-244, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-244ENST00000490697 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.64■■■□□ 2.18
HDLBP-244ENST00000490697 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.61■■■□□ 2.17
HDLBP-244ENST00000490697 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.6■■■□□ 2.17
HDLBP-244ENST00000490697 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.6■■■□□ 2.17
HDLBP-244ENST00000490697 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.59■■■□□ 2.17
HDLBP-244ENST00000490697 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.58■■■□□ 2.17
HDLBP-244ENST00000490697 PTPRMP28827 1452 aa28.55■■■□□ 2.16
HDLBP-244ENST00000490697 AFAP1Q8N556 730 aa28.55■■■□□ 2.16
HDLBP-244ENST00000490697 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.53■■■□□ 2.16
HDLBP-244ENST00000490697 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.53■■■□□ 2.16
HDLBP-244ENST00000490697 CEP162Q5TB80 1403 aa28.52■■■□□ 2.16
HDLBP-244ENST00000490697 ATP10AO60312 1499 aa28.51■■■□□ 2.15
HDLBP-244ENST00000490697 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.48■■■□□ 2.15
HDLBP-244ENST00000490697 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.46■■■□□ 2.15
HDLBP-244ENST00000490697 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.45■■■□□ 2.15
HDLBP-244ENST00000490697 PREX2Q70Z35 1606 aa28.45■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 MADDQ8WXG6 1647 aa28.44■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.44■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.44■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 KDM5CP41229 1560 aa28.44■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.43■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 MLECQ14165 292 aa28.42■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.42■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.42■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.41■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 ABCC1P33527 1531 aa28.41■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
HDLBP-244ENST00000490697 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.38■■■□□ 2.13
HDLBP-244ENST00000490697 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
HDLBP-244ENST00000490697 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.36■■■□□ 2.13
HDLBP-244ENST00000490697 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.35■■■□□ 2.13
HDLBP-244ENST00000490697 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.33■■■□□ 2.13
HDLBP-244ENST00000490697 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.121e-10■□□□□ 10.4
HDLBP-244ENST00000490697 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
HDLBP-244ENST00000490697 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.3■■■□□ 2.12
HDLBP-244ENST00000490697 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.29■■■□□ 2.12
HDLBP-244ENST00000490697 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.29■■■□□ 2.12
HDLBP-244ENST00000490697 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.28■■■□□ 2.12
HDLBP-244ENST00000490697 REREQ9P2R6 1566 aa28.28■■■□□ 2.12
HDLBP-244ENST00000490697 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.28■■■□□ 2.12
HDLBP-244ENST00000490697 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
HDLBP-244ENST00000490697 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.27■■■□□ 2.12
HDLBP-244ENST00000490697 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.24■■■□□ 2.11
HDLBP-244ENST00000490697 ABCA6Q8N139 1617 aa28.23■■■□□ 2.11
HDLBP-244ENST00000490697 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.23■■■□□ 2.11
HDLBP-244ENST00000490697 AGLP35573 1532 aa28.23■■■□□ 2.11
HDLBP-244ENST00000490697 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.21■■■□□ 2.11
HDLBP-244ENST00000490697 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
HDLBP-244ENST00000490697 TIAM1Q13009 1591 aa28.19■■■□□ 2.1
HDLBP-244ENST00000490697 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.19■■■□□ 2.1
HDLBP-244ENST00000490697 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.18■■■□□ 2.1
HDLBP-244ENST00000490697 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
HDLBP-244ENST00000490697 NCOA2Q15596 1464 aa28.15■■■□□ 2.1
HDLBP-244ENST00000490697 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
HDLBP-244ENST00000490697 MBD5Q9P267 1494 aa28.14■■■□□ 2.09
HDLBP-244ENST00000490697 HSPA2P54652 639 aa28.11■■■□□ 2.09
HDLBP-244ENST00000490697 ATP7AQ04656 1500 aa28.1■■■□□ 2.09
HDLBP-244ENST00000490697 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.1■■■□□ 2.09
HDLBP-244ENST00000490697 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.09■■■□□ 2.09
HDLBP-244ENST00000490697 MAP3K1Q13233 1512 aa28.08■■■□□ 2.08
HDLBP-244ENST00000490697 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
HDLBP-244ENST00000490697 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.07■■■□□ 2.08
HDLBP-244ENST00000490697 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HDLBP-244ENST00000490697 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.06■■■□□ 2.08
HDLBP-244ENST00000490697 A2MP01023 1474 aa28.06■■■□□ 2.08
HDLBP-244ENST00000490697 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
HDLBP-244ENST00000490697 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HDLBP-244ENST00000490697 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28■■■□□ 2.07
HDLBP-244ENST00000490697 PLXNC1O60486 1568 aa27.99■■■□□ 2.07
HDLBP-244ENST00000490697 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.99■■■□□ 2.07
HDLBP-244ENST00000490697 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.98■■■□□ 2.07
HDLBP-244ENST00000490697 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.98■■■□□ 2.07
HDLBP-244ENST00000490697 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
HDLBP-244ENST00000490697 APLP2Q06481 763 aa27.96■■■□□ 2.07
HDLBP-244ENST00000490697 GGT6Q6P531 493 aa27.96■■■□□ 2.07
HDLBP-244ENST00000490697 ZMYM3Q14202 1370 aa27.96■■■□□ 2.07
HDLBP-244ENST00000490697 TSPY4P0CV99 314 aa27.95■■■□□ 2.06
HDLBP-244ENST00000490697 TSPY10P0CW01 314 aa27.95■■■□□ 2.06
HDLBP-244ENST00000490697 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.93■■■□□ 2.06
HDLBP-244ENST00000490697 C3P01024 1663 aa27.92■■■□□ 2.06
HDLBP-244ENST00000490697 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
HDLBP-244ENST00000490697 MIA2Q96PC5 1412 aa27.91■■■□□ 2.06
HDLBP-244ENST00000490697 NPATQ14207 1427 aa27.9■■■□□ 2.06
HDLBP-244ENST00000490697 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.9■■■□□ 2.06
HDLBP-244ENST00000490697 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.89■■■□□ 2.06
HDLBP-244ENST00000490697 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.89■■■□□ 2.05
HDLBP-244ENST00000490697 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.87■■■□□ 2.05
HDLBP-244ENST00000490697 KIF3BO15066 747 aa27.86■■■□□ 2.05
HDLBP-244ENST00000490697 MROH2AA6NES4 1674 aa27.84■■■□□ 2.05
HDLBP-244ENST00000490697 FBXO41Q8TF61 875 aa27.83■■■□□ 2.05
HDLBP-244ENST00000490697 PTPRKQ15262 1439 aa27.8■■■□□ 2.04
HDLBP-244ENST00000490697 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HDLBP-244ENST00000490697 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.74■■■□□ 2.03
HDLBP-244ENST00000490697 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.74■■■□□ 2.03
HDLBP-244ENST00000490697 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.72■■■□□ 2.03
HDLBP-244ENST00000490697 PTPRTO14522 1441 aa27.71■■■□□ 2.03
HDLBP-244ENST00000490697 NCOA1Q15788 1441 aa27.7■■■□□ 2.03
HDLBP-244ENST00000490697 CERKQ8TCT0 537 aa27.7■■■□□ 2.02
HDLBP-244ENST00000490697 STRCQ7RTU9 1775 aa27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms