RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.41■■■□□ 2.62
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C1orf61-220ENST00000489918 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.36■■■□□ 2.61
C1orf61-220ENST00000489918 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.36■■■□□ 2.61
C1orf61-220ENST00000489918 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.35■■■□□ 2.61
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C1orf61-220ENST00000489918 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
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C1orf61-220ENST00000489918 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.03■■■□□ 2.56
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C1orf61-220ENST00000489918 KIF3BO15066 747 aa30.5■■■□□ 2.47
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C1orf61-220ENST00000489918 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.48■■■□□ 2.47
C1orf61-220ENST00000489918 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.47■■■□□ 2.47
C1orf61-220ENST00000489918 HSPA2P54652 639 aa30.47■■■□□ 2.47
C1orf61-220ENST00000489918 ZMYM3Q14202 1370 aa30.46■■■□□ 2.47
C1orf61-220ENST00000489918 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.43■■■□□ 2.46
C1orf61-220ENST00000489918 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
C1orf61-220ENST00000489918 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
C1orf61-220ENST00000489918 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.39■■■□□ 2.46
C1orf61-220ENST00000489918 KIF15Q9NS87 1388 aa30.39■■■□□ 2.45
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