RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.58
NISCH-212ENST00000488380 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.63■□□□□ 0.57
NISCH-212ENST00000488380 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.63■□□□□ 0.57
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0556O60303 1618 aa18.62■□□□□ 0.57
NISCH-212ENST00000488380 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.61■□□□□ 0.57
NISCH-212ENST00000488380 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NISCH-212ENST00000488380 GRIN2AQ12879 1464 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-212ENST00000488380 MIA2Q96PC5 1412 aa18.58■□□□□ 0.57
NISCH-212ENST00000488380 FBLN2P98095 1184 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.58■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 ERCC6Q03468 1493 aa18.55■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.55■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 DAPK1P53355 1430 aa18.54■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 ABCC5O15440 1437 aa18.53■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 AKNAQ7Z591 1439 aa18.53■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-212ENST00000488380 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
NISCH-212ENST00000488380 CEP170Q5SW79 1584 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-212ENST00000488380 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-212ENST00000488380 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-212ENST00000488380 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-212ENST00000488380 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NISCH-212ENST00000488380 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NISCH-212ENST00000488380 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
NISCH-212ENST00000488380 KIF14Q15058 1648 aa18.45■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 ROCK1Q13464 1354 aa18.44■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 SYNJ2O15056 1496 aa18.43■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.43■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.43■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 JPH4Q96JJ6 628 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
NISCH-212ENST00000488380 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
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NISCH-212ENST00000488380 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
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NISCH-212ENST00000488380 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-212ENST00000488380 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NISCH-212ENST00000488380 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
NISCH-212ENST00000488380 CCDC184Q52MB2 194 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-212ENST00000488380 PZPP20742 1482 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-212ENST00000488380 NCOA1Q15788 1441 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-212ENST00000488380 NUP160Q12769 1436 aa18.35■□□□□ 0.53
NISCH-212ENST00000488380 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
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NISCH-212ENST00000488380 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.32■□□□□ 0.52
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NISCH-212ENST00000488380 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 CCDC7Q96M83 1385 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 IL27Q8NEV9 243 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 ATP10BO94823 1461 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 PKD2Q13563 968 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.27■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.27■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
NISCH-212ENST00000488380 MRS2Q9HD23 443 aa18.27■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 ABCA8O94911 1581 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 ADGRL2O95490 1459 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
NISCH-212ENST00000488380 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-212ENST00000488380 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-212ENST00000488380 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-212ENST00000488380 NUP155O75694 1391 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-212ENST00000488380 MBD5Q9P267 1494 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-212ENST00000488380 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.16■□□□□ 0.5
NISCH-212ENST00000488380 PTPRGP23470 1445 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-212ENST00000488380 USP47Q96K76 1375 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-212ENST00000488380 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NISCH-212ENST00000488380 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.14■□□□□ 0.49
NISCH-212ENST00000488380 TSPY4P0CV99 314 aa18.14■□□□□ 0.49
NISCH-212ENST00000488380 TSPY10P0CW01 314 aa18.14■□□□□ 0.49
NISCH-212ENST00000488380 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-212ENST00000488380 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
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