RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.15■■□□□ 1.78
HCLS1-208ENST00000487290 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
HCLS1-208ENST00000487290 NCOA2Q15596 1464 aa26.14■■□□□ 1.78
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.12■■□□□ 1.77
HCLS1-208ENST00000487290 AKNAQ7Z591 1439 aa26.12■■□□□ 1.77
HCLS1-208ENST00000487290 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.11■■□□□ 1.77
HCLS1-208ENST00000487290 RICTORQ6R327 1708 aa26.11■■□□□ 1.77
HCLS1-208ENST00000487290 ABCC1P33527 1531 aa26.08■■□□□ 1.77
HCLS1-208ENST00000487290 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
HCLS1-208ENST00000487290 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.06■■□□□ 1.76
HCLS1-208ENST00000487290 ADGRL1O94910 1474 aa26.05■■□□□ 1.76
HCLS1-208ENST00000487290 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.05■■□□□ 1.76
HCLS1-208ENST00000487290 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.05■■□□□ 1.76
HCLS1-208ENST00000487290 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.04■■□□□ 1.76
HCLS1-208ENST00000487290 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HCLS1-208ENST00000487290 APLP2Q06481 763 aa26.02■■□□□ 1.76
HCLS1-208ENST00000487290 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.02■■□□□ 1.76
HCLS1-208ENST00000487290 KDM5CP41229 1560 aa26■■□□□ 1.75
HCLS1-208ENST00000487290 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
HCLS1-208ENST00000487290 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.98■■□□□ 1.75
HCLS1-208ENST00000487290 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.97■■□□□ 1.75
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.96■■□□□ 1.75
HCLS1-208ENST00000487290 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.96■■□□□ 1.75
HCLS1-208ENST00000487290 MIA2Q96PC5 1412 aa25.96■■□□□ 1.75
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.95■■□□□ 1.74
HCLS1-208ENST00000487290 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.93■■□□□ 1.74
HCLS1-208ENST00000487290 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.92■■□□□ 1.74
HCLS1-208ENST00000487290 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.92■■□□□ 1.74
HCLS1-208ENST00000487290 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.9■■□□□ 1.74
HCLS1-208ENST00000487290 MBD5Q9P267 1494 aa25.89■■□□□ 1.73
HCLS1-208ENST00000487290 RAPGEF3O95398 923 aa25.88■■□□□ 1.73
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.87■■□□□ 1.73
HCLS1-208ENST00000487290 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.87■■□□□ 1.73
HCLS1-208ENST00000487290 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.86■■□□□ 1.73
HCLS1-208ENST00000487290 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.85■■□□□ 1.73
HCLS1-208ENST00000487290 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
HCLS1-208ENST00000487290 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.83■■□□□ 1.73
HCLS1-208ENST00000487290 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.83■■□□□ 1.73
HCLS1-208ENST00000487290 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
HCLS1-208ENST00000487290 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.82■■□□□ 1.72
HCLS1-208ENST00000487290 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.8■■□□□ 1.72
HCLS1-208ENST00000487290 REREQ9P2R6 1566 aa25.79■■□□□ 1.72
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.79■■□□□ 1.72
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
HCLS1-208ENST00000487290 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.77■■□□□ 1.72
HCLS1-208ENST00000487290 ABCA6Q8N139 1617 aa25.77■■□□□ 1.72
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.76■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.75■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 AFAP1Q8N556 730 aa25.75■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 ATP7AQ04656 1500 aa25.74■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.74■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.73■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.72■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.71■■□□□ 1.71
HCLS1-208ENST00000487290 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.7■■□□□ 1.7
HCLS1-208ENST00000487290 ATP10AO60312 1499 aa25.69■■□□□ 1.7
HCLS1-208ENST00000487290 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.69■■□□□ 1.7
HCLS1-208ENST00000487290 PLXNC1O60486 1568 aa25.67■■□□□ 1.7
HCLS1-208ENST00000487290 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.66■■□□□ 1.7
HCLS1-208ENST00000487290 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
HCLS1-208ENST00000487290 AGLP35573 1532 aa25.65■■□□□ 1.7
HCLS1-208ENST00000487290 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
HCLS1-208ENST00000487290 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
HCLS1-208ENST00000487290 ABCC5O15440 1437 aa25.63■■□□□ 1.69
HCLS1-208ENST00000487290 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.62■■□□□ 1.69
HCLS1-208ENST00000487290 DAPK1P53355 1430 aa25.62■■□□□ 1.69
HCLS1-208ENST00000487290 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.58■■□□□ 1.69
HCLS1-208ENST00000487290 ADGRL2O95490 1459 aa25.55■■□□□ 1.68
HCLS1-208ENST00000487290 A2MP01023 1474 aa25.55■■□□□ 1.68
HCLS1-208ENST00000487290 TSPY4P0CV99 314 aa25.51■■□□□ 1.67
HCLS1-208ENST00000487290 TSPY10P0CW01 314 aa25.51■■□□□ 1.67
HCLS1-208ENST00000487290 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HCLS1-208ENST00000487290 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
HCLS1-208ENST00000487290 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
HCLS1-208ENST00000487290 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.47■■□□□ 1.67
HCLS1-208ENST00000487290 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.46■■□□□ 1.67
HCLS1-208ENST00000487290 MADDQ8WXG6 1647 aa25.45■■□□□ 1.67
HCLS1-208ENST00000487290 PTPRKQ15262 1439 aa25.45■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.44■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 NCOA1Q15788 1441 aa25.44■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.44■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.43■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 ROCK1Q13464 1354 aa25.43■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 ERBINQ96RT1 1412 aa25.41■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 KIF15Q9NS87 1388 aa25.41■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.4■■□□□ 1.66
HCLS1-208ENST00000487290 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HCLS1-208ENST00000487290 DEPDC5O75140 1603 aa25.37■■□□□ 1.65
HCLS1-208ENST00000487290 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.36■■□□□ 1.65
HCLS1-208ENST00000487290 MROH2AA6NES4 1674 aa25.36■■□□□ 1.65
HCLS1-208ENST00000487290 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HCLS1-208ENST00000487290 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HCLS1-208ENST00000487290 PTPRMP28827 1452 aa25.32■■□□□ 1.64
HCLS1-208ENST00000487290 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.31■■□□□ 1.64
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