RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486917.1

PRRT1-208, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene PRRT1, Length 620 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-208ENST00000486917 KIF14Q15058 1648 aa23.66■■□□□ 1.38
PRRT1-208ENST00000486917 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-208ENST00000486917 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.65■■□□□ 1.38
PRRT1-208ENST00000486917 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.64■■□□□ 1.38
PRRT1-208ENST00000486917 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.63■■□□□ 1.37
PRRT1-208ENST00000486917 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.62■■□□□ 1.37
PRRT1-208ENST00000486917 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PRRT1-208ENST00000486917 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
PRRT1-208ENST00000486917 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PRRT1-208ENST00000486917 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.55■■□□□ 1.36
PRRT1-208ENST00000486917 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.55■■□□□ 1.36
PRRT1-208ENST00000486917 ATP10AO60312 1499 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-208ENST00000486917 KDM5CP41229 1560 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-208ENST00000486917 CLIP1P30622 1438 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-208ENST00000486917 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-208ENST00000486917 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-208ENST00000486917 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRT1-208ENST00000486917 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRT1-208ENST00000486917 PREX2Q70Z35 1606 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-208ENST00000486917 MLECQ14165 292 aa23.48■■□□□ 1.35
PRRT1-208ENST00000486917 FBXO41Q8TF61 875 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-208ENST00000486917 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.46■■□□□ 1.35
PRRT1-208ENST00000486917 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.46■■□□□ 1.35
PRRT1-208ENST00000486917 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 REREQ9P2R6 1566 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 ABCA6Q8N139 1617 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 HSPA2P54652 639 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 AFAP1Q8N556 730 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 ABCC1P33527 1531 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-208ENST00000486917 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.38■■□□□ 1.33
PRRT1-208ENST00000486917 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PRRT1-208ENST00000486917 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.35■■□□□ 1.33
PRRT1-208ENST00000486917 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.35■■□□□ 1.33
PRRT1-208ENST00000486917 AGLP35573 1532 aa23.33■■□□□ 1.32
PRRT1-208ENST00000486917 C3P01024 1663 aa23.32■■□□□ 1.32
PRRT1-208ENST00000486917 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PRRT1-208ENST00000486917 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.3■■□□□ 1.32
PRRT1-208ENST00000486917 STRCQ7RTU9 1775 aa23.29■■□□□ 1.32
PRRT1-208ENST00000486917 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.29■■□□□ 1.32
PRRT1-208ENST00000486917 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PRRT1-208ENST00000486917 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.23■■□□□ 1.31
PRRT1-208ENST00000486917 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.23■■□□□ 1.31
PRRT1-208ENST00000486917 MROH2AA6NES4 1674 aa23.19■■□□□ 1.3
PRRT1-208ENST00000486917 CERKQ8TCT0 537 aa23.18■■□□□ 1.3
PRRT1-208ENST00000486917 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PRRT1-208ENST00000486917 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PRRT1-208ENST00000486917 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PRRT1-208ENST00000486917 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.16■■□□□ 1.3
PRRT1-208ENST00000486917 ATP7AQ04656 1500 aa23.16■■□□□ 1.3
PRRT1-208ENST00000486917 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.16■■□□□ 1.3
PRRT1-208ENST00000486917 PLXNC1O60486 1568 aa23.14■■□□□ 1.3
PRRT1-208ENST00000486917 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.14■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.12■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.11■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 TIAM1Q13009 1591 aa23.1■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.1■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.09■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.08■■□□□ 1.29
PRRT1-208ENST00000486917 PTPRTO14522 1441 aa23.08■■□□□ 1.28
PRRT1-208ENST00000486917 NPATQ14207 1427 aa23.08■■□□□ 1.28
PRRT1-208ENST00000486917 A2MP01023 1474 aa23.07■■□□□ 1.28
PRRT1-208ENST00000486917 NCOA1Q15788 1441 aa23.04■■□□□ 1.28
PRRT1-208ENST00000486917 ZMYM3Q14202 1370 aa23.03■■□□□ 1.28
PRRT1-208ENST00000486917 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PRRT1-208ENST00000486917 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.01■■□□□ 1.27
PRRT1-208ENST00000486917 CEP162Q5TB80 1403 aa23.01■■□□□ 1.27
PRRT1-208ENST00000486917 MBD5Q9P267 1494 aa23.01■■□□□ 1.27
PRRT1-208ENST00000486917 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23■■□□□ 1.27
PRRT1-208ENST00000486917 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.99■■□□□ 1.27
PRRT1-208ENST00000486917 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PRRT1-208ENST00000486917 PTPRKQ15262 1439 aa22.96■■□□□ 1.27
PRRT1-208ENST00000486917 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.95■■□□□ 1.26
PRRT1-208ENST00000486917 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PRRT1-208ENST00000486917 GGT6Q6P531 493 aa22.93■■□□□ 1.26
PRRT1-208ENST00000486917 NCOA2Q15596 1464 aa22.92■■□□□ 1.26
PRRT1-208ENST00000486917 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.91■■□□□ 1.26
PRRT1-208ENST00000486917 PLA2R1Q13018 1463 aa22.91■■□□□ 1.26
PRRT1-208ENST00000486917 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.91■■□□□ 1.26
PRRT1-208ENST00000486917 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.9■■□□□ 1.26
PRRT1-208ENST00000486917 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.89■■□□□ 1.25
PRRT1-208ENST00000486917 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PRRT1-208ENST00000486917 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PRRT1-208ENST00000486917 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.85■■□□□ 1.25
PRRT1-208ENST00000486917 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.85■■□□□ 1.25
PRRT1-208ENST00000486917 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.85■■□□□ 1.25
PRRT1-208ENST00000486917 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PRRT1-208ENST00000486917 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.82■■□□□ 1.24
PRRT1-208ENST00000486917 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.82■■□□□ 1.24
PRRT1-208ENST00000486917 PKD2Q13563 968 aa22.82■■□□□ 1.24
PRRT1-208ENST00000486917 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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