RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-211ENST00000485941 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
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NBPF3-211ENST00000485941 KIF14Q15058 1648 aa38.51■■■■□ 3.76
NBPF3-211ENST00000485941 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
NBPF3-211ENST00000485941 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.49■■■■□ 3.75
NBPF3-211ENST00000485941 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
NBPF3-211ENST00000485941 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.48■■■■□ 3.75
NBPF3-211ENST00000485941 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.47■■■■□ 3.75
NBPF3-211ENST00000485941 ATP10AO60312 1499 aa38.41■■■■□ 3.74
NBPF3-211ENST00000485941 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.36■■■■□ 3.73
NBPF3-211ENST00000485941 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.35■■■■□ 3.73
NBPF3-211ENST00000485941 KDM5CP41229 1560 aa38.35■■■■□ 3.73
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.34■■■■□ 3.73
NBPF3-211ENST00000485941 CLIP1P30622 1438 aa38.33■■■■□ 3.73
NBPF3-211ENST00000485941 MLECQ14165 292 aa38.33■■■■□ 3.73
NBPF3-211ENST00000485941 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.32■■■■□ 3.73
NBPF3-211ENST00000485941 FBXO41Q8TF61 875 aa38.32■■■■□ 3.72
NBPF3-211ENST00000485941 AFAP1Q8N556 730 aa38.31■■■■□ 3.72
NBPF3-211ENST00000485941 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.31■■■■□ 3.72
NBPF3-211ENST00000485941 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.3■■■■□ 3.72
NBPF3-211ENST00000485941 HSPA2P54652 639 aa38.28■■■■□ 3.72
NBPF3-211ENST00000485941 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.28■■■■□ 3.72
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.23■■■■□ 3.71
NBPF3-211ENST00000485941 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.22■■■■□ 3.71
NBPF3-211ENST00000485941 MLH3Q9UHC1 1453 aa38.2■■■■□ 3.71
NBPF3-211ENST00000485941 PREX2Q70Z35 1606 aa38.2■■■■□ 3.7
NBPF3-211ENST00000485941 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa38.19■■■■□ 3.7
NBPF3-211ENST00000485941 REREQ9P2R6 1566 aa38.19■■■■□ 3.7
NBPF3-211ENST00000485941 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.16■■■■□ 3.7
NBPF3-211ENST00000485941 ABCC1P33527 1531 aa38.16■■■■□ 3.7
NBPF3-211ENST00000485941 ABCA6Q8N139 1617 aa38.12■■■■□ 3.69
NBPF3-211ENST00000485941 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.11■■■■□ 3.69
NBPF3-211ENST00000485941 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
NBPF3-211ENST00000485941 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.07■■■■□ 3.69
NBPF3-211ENST00000485941 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.07■■■■□ 3.68
NBPF3-211ENST00000485941 AGLP35573 1532 aa38.07■■■■□ 3.68
NBPF3-211ENST00000485941 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.04■■■■□ 3.68
NBPF3-211ENST00000485941 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.01■■■■□ 3.68
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NBPF3-211ENST00000485941 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.94■■■■□ 3.66
NBPF3-211ENST00000485941 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
NBPF3-211ENST00000485941 C3P01024 1663 aa37.89■■■■□ 3.66
NBPF3-211ENST00000485941 STRCQ7RTU9 1775 aa37.89■■■■□ 3.66
NBPF3-211ENST00000485941 CERKQ8TCT0 537 aa37.88■■■■□ 3.65
NBPF3-211ENST00000485941 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.87■■■■□ 3.65
NBPF3-211ENST00000485941 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.86■■■■□ 3.65
NBPF3-211ENST00000485941 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.84■■■■□ 3.65
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
NBPF3-211ENST00000485941 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.82■■■■□ 3.64
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NBPF3-211ENST00000485941 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
NBPF3-211ENST00000485941 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
NBPF3-211ENST00000485941 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.74■■■■□ 3.63
NBPF3-211ENST00000485941 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.74■■■■□ 3.63
NBPF3-211ENST00000485941 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
NBPF3-211ENST00000485941 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.73■■■■□ 3.63
NBPF3-211ENST00000485941 ATP7AQ04656 1500 aa37.72■■■■□ 3.63
NBPF3-211ENST00000485941 PLXNC1O60486 1568 aa37.72■■■■□ 3.63
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NBPF3-211ENST00000485941 MROH2AA6NES4 1674 aa37.68■■■■□ 3.62
NBPF3-211ENST00000485941 NPATQ14207 1427 aa37.66■■■■□ 3.62
NBPF3-211ENST00000485941 ZMYM3Q14202 1370 aa37.66■■■■□ 3.62
NBPF3-211ENST00000485941 A2MP01023 1474 aa37.64■■■■□ 3.62
NBPF3-211ENST00000485941 TIAM1Q13009 1591 aa37.64■■■■□ 3.62
NBPF3-211ENST00000485941 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
NBPF3-211ENST00000485941 MBD5Q9P267 1494 aa37.64■■■■□ 3.62
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
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NBPF3-211ENST00000485941 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.59■■■■□ 3.61
NBPF3-211ENST00000485941 CEP162Q5TB80 1403 aa37.59■■■■□ 3.61
NBPF3-211ENST00000485941 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.52■■■■□ 3.6
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NBPF3-211ENST00000485941 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.51■■■■□ 3.59
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NBPF3-211ENST00000485941 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.49■■■■□ 3.59
NBPF3-211ENST00000485941 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.48■■■■□ 3.59
NBPF3-211ENST00000485941 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.47■■■■□ 3.59
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NBPF3-211ENST00000485941 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.39■■■■□ 3.58
NBPF3-211ENST00000485941 PLA2R1Q13018 1463 aa37.37■■■■□ 3.57
NBPF3-211ENST00000485941 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.36■■■■□ 3.57
NBPF3-211ENST00000485941 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
NBPF3-211ENST00000485941 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.34■■■■□ 3.57
NBPF3-211ENST00000485941 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
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NBPF3-211ENST00000485941 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.33■■■■□ 3.57
NBPF3-211ENST00000485941 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.3■■■■□ 3.56
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NBPF3-211ENST00000485941 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.24■■■■□ 3.55
NBPF3-211ENST00000485941 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.23■■■■□ 3.55
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NBPF3-211ENST00000485941 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
NBPF3-211ENST00000485941 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.21■■■■□ 3.55
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