RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485921.5

ABCF3-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily F member 3, humanhuman

TSL 2

Gene ABCF3, Length 813 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3-216ENST00000485921 KDM6BO15054 1643 aa36.86■■■■□ 3.49
ABCF3-216ENST00000485921 PREX2Q70Z35 1606 aa36.86■■■■□ 3.49
ABCF3-216ENST00000485921 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.85■■■■□ 3.49
ABCF3-216ENST00000485921 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.85■■■■□ 3.49
ABCF3-216ENST00000485921 AKNAQ7Z591 1439 aa36.85■■■■□ 3.49
ABCF3-216ENST00000485921 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.84■■■■□ 3.49
ABCF3-216ENST00000485921 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
ABCF3-216ENST00000485921 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
ABCF3-216ENST00000485921 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
ABCF3-216ENST00000485921 ADGRL1O94910 1474 aa36.74■■■■□ 3.47
ABCF3-216ENST00000485921 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.73■■■■□ 3.47
ABCF3-216ENST00000485921 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.7■■■■□ 3.47
ABCF3-216ENST00000485921 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
ABCF3-216ENST00000485921 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
ABCF3-216ENST00000485921 RAPGEF3O95398 923 aa36.68■■■■□ 3.46
ABCF3-216ENST00000485921 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.65■■■■□ 3.46
ABCF3-216ENST00000485921 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.64■■■■□ 3.46
ABCF3-216ENST00000485921 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
ABCF3-216ENST00000485921 ABCC1P33527 1531 aa36.61■■■■□ 3.45
ABCF3-216ENST00000485921 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.58■■■■□ 3.45
ABCF3-216ENST00000485921 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.58■■■■□ 3.45
ABCF3-216ENST00000485921 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.58■■■■□ 3.45
ABCF3-216ENST00000485921 MIA2Q96PC5 1412 aa36.57■■■■□ 3.44
ABCF3-216ENST00000485921 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.57■■■■□ 3.44
ABCF3-216ENST00000485921 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.56■■■■□ 3.44
ABCF3-216ENST00000485921 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.56■■■■□ 3.44
ABCF3-216ENST00000485921 RICTORQ6R327 1708 aa36.56■■■■□ 3.44
ABCF3-216ENST00000485921 AFAP1Q8N556 730 aa36.53■■■■□ 3.44
ABCF3-216ENST00000485921 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.53■■■■□ 3.44
ABCF3-216ENST00000485921 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.52■■■■□ 3.44
ABCF3-216ENST00000485921 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.52■■■■□ 3.44
ABCF3-216ENST00000485921 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.51■■■■□ 3.44
ABCF3-216ENST00000485921 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.49■■■■□ 3.43
ABCF3-216ENST00000485921 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.44■■■■□ 3.42
ABCF3-216ENST00000485921 MBD5Q9P267 1494 aa36.43■■■■□ 3.42
ABCF3-216ENST00000485921 KDM5CP41229 1560 aa36.42■■■■□ 3.42
ABCF3-216ENST00000485921 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.41■■■■□ 3.42
ABCF3-216ENST00000485921 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.38■■■■□ 3.41
ABCF3-216ENST00000485921 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.38■■■■□ 3.41
ABCF3-216ENST00000485921 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.38■■■■□ 3.41
ABCF3-216ENST00000485921 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
ABCF3-216ENST00000485921 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
ABCF3-216ENST00000485921 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.34■■■■□ 3.41
ABCF3-216ENST00000485921 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.34■■■■□ 3.41
ABCF3-216ENST00000485921 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.33■■■■□ 3.41
ABCF3-216ENST00000485921 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.33■■■■□ 3.41
ABCF3-216ENST00000485921 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.32■■■■□ 3.41
ABCF3-216ENST00000485921 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
ABCF3-216ENST00000485921 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.32■■■■□ 3.4
ABCF3-216ENST00000485921 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.29■■■■□ 3.4
ABCF3-216ENST00000485921 TSPY4P0CV99 314 aa36.25■■■■□ 3.39
ABCF3-216ENST00000485921 TSPY10P0CW01 314 aa36.25■■■■□ 3.39
ABCF3-216ENST00000485921 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.23■■■■□ 3.39
ABCF3-216ENST00000485921 ATP7AQ04656 1500 aa36.22■■■■□ 3.39
ABCF3-216ENST00000485921 ATP10AO60312 1499 aa36.21■■■■□ 3.39
ABCF3-216ENST00000485921 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
ABCF3-216ENST00000485921 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.2■■■■□ 3.39
ABCF3-216ENST00000485921 ABCC5O15440 1437 aa36.2■■■■□ 3.39
ABCF3-216ENST00000485921 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.18■■■■□ 3.38
ABCF3-216ENST00000485921 DAPK1P53355 1430 aa36.17■■■■□ 3.38
ABCF3-216ENST00000485921 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
ABCF3-216ENST00000485921 ABCA6Q8N139 1617 aa36.17■■■■□ 3.38
ABCF3-216ENST00000485921 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
ABCF3-216ENST00000485921 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.15■■■■□ 3.38
ABCF3-216ENST00000485921 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.14■■■■□ 3.38
ABCF3-216ENST00000485921 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.11■■■■□ 3.37
ABCF3-216ENST00000485921 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
ABCF3-216ENST00000485921 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.1■■■■□ 3.37
ABCF3-216ENST00000485921 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.09■■■■□ 3.37
ABCF3-216ENST00000485921 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.06■■■■□ 3.36
ABCF3-216ENST00000485921 REREQ9P2R6 1566 aa36.05■■■■□ 3.36
ABCF3-216ENST00000485921 A2MP01023 1474 aa36.03■■■■□ 3.36
ABCF3-216ENST00000485921 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.03■■■■□ 3.36
ABCF3-216ENST00000485921 ITGAEP38570 1179 aa36.02■■■■□ 3.36
ABCF3-216ENST00000485921 ADGBQ8N7X0 1667 aa36■■■■□ 3.35
ABCF3-216ENST00000485921 PTPRKQ15262 1439 aa35.99■■■■□ 3.35
ABCF3-216ENST00000485921 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
ABCF3-216ENST00000485921 PLXNC1O60486 1568 aa35.97■■■■□ 3.35
ABCF3-216ENST00000485921 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.96■■■■□ 3.35
ABCF3-216ENST00000485921 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.96■■■■□ 3.35
ABCF3-216ENST00000485921 AGLP35573 1532 aa35.95■■■■□ 3.35
ABCF3-216ENST00000485921 MLECQ14165 292 aa35.93■■■■□ 3.34
ABCF3-216ENST00000485921 NCOA1Q15788 1441 aa35.92■■■■□ 3.34
ABCF3-216ENST00000485921 KIF15Q9NS87 1388 aa35.92■■■■□ 3.34
ABCF3-216ENST00000485921 ADGRL2O95490 1459 aa35.92■■■■□ 3.34
ABCF3-216ENST00000485921 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.91■■■■□ 3.34
ABCF3-216ENST00000485921 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.89■■■■□ 3.34
ABCF3-216ENST00000485921 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.87■■■■□ 3.33
ABCF3-216ENST00000485921 ROCK1Q13464 1354 aa35.85■■■■□ 3.33
ABCF3-216ENST00000485921 KIF3BO15066 747 aa35.83■■■■□ 3.33
ABCF3-216ENST00000485921 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.81■■■■□ 3.32
ABCF3-216ENST00000485921 GGT6Q6P531 493 aa35.78■■■■□ 3.32
ABCF3-216ENST00000485921 ERBINQ96RT1 1412 aa35.77■■■■□ 3.32
ABCF3-216ENST00000485921 MADDQ8WXG6 1647 aa35.73■■■■□ 3.31
ABCF3-216ENST00000485921 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
ABCF3-216ENST00000485921 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.71■■■■□ 3.31
ABCF3-216ENST00000485921 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
ABCF3-216ENST00000485921 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.68■■■■□ 3.3
ABCF3-216ENST00000485921 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.66■■■■□ 3.3
ABCF3-216ENST00000485921 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms