RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 CLIP1P30622 1438 aa36.24■■■■□ 3.39
PTPRN-215ENST00000484986 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
PTPRN-215ENST00000484986 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.21■■■■□ 3.39
PTPRN-215ENST00000484986 KIF14Q15058 1648 aa36.19■■■■□ 3.38
PTPRN-215ENST00000484986 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.17■■■■□ 3.38
PTPRN-215ENST00000484986 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.1■■■■□ 3.37
PTPRN-215ENST00000484986 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.09■■■■□ 3.37
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.09■■■■□ 3.37
PTPRN-215ENST00000484986 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
PTPRN-215ENST00000484986 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
PTPRN-215ENST00000484986 ATP10AO60312 1499 aa36.08■■■■□ 3.37
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.08■■■■□ 3.37
PTPRN-215ENST00000484986 MLECQ14165 292 aa36.04■■■■□ 3.36
PTPRN-215ENST00000484986 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.04■■■■□ 3.36
PTPRN-215ENST00000484986 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.04■■■■□ 3.36
PTPRN-215ENST00000484986 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36■■■■□ 3.35
PTPRN-215ENST00000484986 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36■■■■□ 3.35
PTPRN-215ENST00000484986 AFAP1Q8N556 730 aa35.99■■■■□ 3.35
PTPRN-215ENST00000484986 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.97■■■■□ 3.35
PTPRN-215ENST00000484986 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.96■■■■□ 3.35
PTPRN-215ENST00000484986 KDM5CP41229 1560 aa35.95■■■■□ 3.35
PTPRN-215ENST00000484986 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.95■■■■□ 3.35
PTPRN-215ENST00000484986 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.92■■■■□ 3.34
PTPRN-215ENST00000484986 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.89■■■■□ 3.34
PTPRN-215ENST00000484986 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.88■■■■□ 3.33
PTPRN-215ENST00000484986 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.87■■■■□ 3.33
PTPRN-215ENST00000484986 PREX2Q70Z35 1606 aa35.87■■■■□ 3.33
PTPRN-215ENST00000484986 HSPA2P54652 639 aa35.84■■■■□ 3.33
PTPRN-215ENST00000484986 ABCC1P33527 1531 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPRN-215ENST00000484986 FBXO41Q8TF61 875 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPRN-215ENST00000484986 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.81■■■■□ 3.32
PTPRN-215ENST00000484986 REREQ9P2R6 1566 aa35.81■■■■□ 3.32
PTPRN-215ENST00000484986 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.8■■■■□ 3.32
PTPRN-215ENST00000484986 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPRN-215ENST00000484986 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
PTPRN-215ENST00000484986 ABCA6Q8N139 1617 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPRN-215ENST00000484986 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.71■■■■□ 3.31
PTPRN-215ENST00000484986 AGLP35573 1532 aa35.71■■■■□ 3.31
PTPRN-215ENST00000484986 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
PTPRN-215ENST00000484986 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
PTPRN-215ENST00000484986 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRN-215ENST00000484986 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
PTPRN-215ENST00000484986 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRN-215ENST00000484986 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRN-215ENST00000484986 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.62■■■■□ 3.29
PTPRN-215ENST00000484986 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PTPRN-215ENST00000484986 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.61■■■■□ 3.29
PTPRN-215ENST00000484986 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.61■■■■□ 3.29
PTPRN-215ENST00000484986 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.61■■■■□ 3.29
PTPRN-215ENST00000484986 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.6■■■■□ 3.29
PTPRN-215ENST00000484986 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.59■■■■□ 3.29
PTPRN-215ENST00000484986 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.59■■■■□ 3.29
PTPRN-215ENST00000484986 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.57■■■■□ 3.28
PTPRN-215ENST00000484986 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.55■■■■□ 3.28
PTPRN-215ENST00000484986 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PTPRN-215ENST00000484986 CEP162Q5TB80 1403 aa35.49■■■■□ 3.27
PTPRN-215ENST00000484986 C3P01024 1663 aa35.47■■■■□ 3.27
PTPRN-215ENST00000484986 CERKQ8TCT0 537 aa35.47■■■■□ 3.27
PTPRN-215ENST00000484986 ATP7AQ04656 1500 aa35.47■■■■□ 3.27
PTPRN-215ENST00000484986 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.46■■■■□ 3.27
PTPRN-215ENST00000484986 A2MP01023 1474 aa35.41■■■■□ 3.26
PTPRN-215ENST00000484986 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
PTPRN-215ENST00000484986 NPATQ14207 1427 aa35.38■■■■□ 3.25
PTPRN-215ENST00000484986 TIAM1Q13009 1591 aa35.38■■■■□ 3.25
PTPRN-215ENST00000484986 ZMYM3Q14202 1370 aa35.37■■■■□ 3.25
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
PTPRN-215ENST00000484986 PLXNC1O60486 1568 aa35.36■■■■□ 3.25
PTPRN-215ENST00000484986 STRCQ7RTU9 1775 aa35.34■■■■□ 3.25
PTPRN-215ENST00000484986 MROH2AA6NES4 1674 aa35.33■■■■□ 3.25
PTPRN-215ENST00000484986 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
PTPRN-215ENST00000484986 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.32■■■■□ 3.24
PTPRN-215ENST00000484986 MBD5Q9P267 1494 aa35.32■■■■□ 3.24
PTPRN-215ENST00000484986 PTPRTO14522 1441 aa35.31■■■■□ 3.24
PTPRN-215ENST00000484986 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.3■■■■□ 3.24
PTPRN-215ENST00000484986 GGT6Q6P531 493 aa35.29■■■■□ 3.24
PTPRN-215ENST00000484986 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.25■■■■□ 3.23
PTPRN-215ENST00000484986 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.24■■■■□ 3.23
PTPRN-215ENST00000484986 NCOA2Q15596 1464 aa35.24■■■■□ 3.23
PTPRN-215ENST00000484986 NCOA1Q15788 1441 aa35.23■■■■□ 3.23
PTPRN-215ENST00000484986 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
PTPRN-215ENST00000484986 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.18■■■■□ 3.22
PTPRN-215ENST00000484986 PTPRKQ15262 1439 aa35.16■■■■□ 3.22
PTPRN-215ENST00000484986 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.16■■■■□ 3.22
PTPRN-215ENST00000484986 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.15■■■■□ 3.22
PTPRN-215ENST00000484986 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.14■■■■□ 3.22
PTPRN-215ENST00000484986 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.09■■■■□ 3.21
PTPRN-215ENST00000484986 KIF3BO15066 747 aa35.09■■■■□ 3.21
PTPRN-215ENST00000484986 TSPY4P0CV99 314 aa35.08■■■■□ 3.21
PTPRN-215ENST00000484986 TSPY10P0CW01 314 aa35.08■■■■□ 3.21
PTPRN-215ENST00000484986 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.07■■■■□ 3.2
PTPRN-215ENST00000484986 PKD2Q13563 968 aa35.06■■■■□ 3.2
PTPRN-215ENST00000484986 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.06■■■■□ 3.2
PTPRN-215ENST00000484986 PLA2R1Q13018 1463 aa35.05■■■■□ 3.2
PTPRN-215ENST00000484986 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
PTPRN-215ENST00000484986 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.04■■■■□ 3.2
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
PTPRN-215ENST00000484986 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.03■■■■□ 3.2
PTPRN-215ENST00000484986 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.02■■■■□ 3.2
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