RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
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SOGA3-207ENST00000481848 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
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SOGA3-207ENST00000481848 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SOGA3-207ENST00000481848 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
SOGA3-207ENST00000481848 GOLGA6L10A6NI86 522 aa15.25■□□□□ 0.03
SOGA3-207ENST00000481848 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SOGA3-207ENST00000481848 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.24■□□□□ 0.03
SOGA3-207ENST00000481848 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SOGA3-207ENST00000481848 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SOGA3-207ENST00000481848 ERLIN1O75477 346 aa15.24■□□□□ 0.03
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