RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479185.1

TNS1-214, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 2,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-214ENST00000479185 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TNS1-214ENST00000479185 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.21■□□□□ 0.51
TNS1-214ENST00000479185 PTPRGP23470 1445 aa18.21■□□□□ 0.51
TNS1-214ENST00000479185 UACAQ9BZF9 1416 aa18.21■□□□□ 0.51
TNS1-214ENST00000479185 ATP10BO94823 1461 aa18.18■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 ABCC5O15440 1437 aa18.17■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 DAPK1P53355 1430 aa18.16■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 FOXD1Q16676 465 aa18.16■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 KDM6BO15054 1643 aa18.16■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 KIF14Q15058 1648 aa18.15■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 CHD1O14646 1710 aa18.15■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 ABCA8O94911 1581 aa18.15■□□□□ 0.5
TNS1-214ENST00000479185 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TNS1-214ENST00000479185 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.11■□□□□ 0.49
TNS1-214ENST00000479185 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.11■□□□□ 0.49
TNS1-214ENST00000479185 TONSLQ96HA7 1378 aa18.1■□□□□ 0.49
TNS1-214ENST00000479185 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.1■□□□□ 0.49
TNS1-214ENST00000479185 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.1■□□□□ 0.49
TNS1-214ENST00000479185 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.09■□□□□ 0.49
TNS1-214ENST00000479185 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
TNS1-214ENST00000479185 AKNAQ7Z591 1439 aa18.07■□□□□ 0.48
TNS1-214ENST00000479185 ROCK1Q13464 1354 aa18.05■□□□□ 0.48
TNS1-214ENST00000479185 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TNS1-214ENST00000479185 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
TNS1-214ENST00000479185 KCNH8Q96L42 1107 aa18.03■□□□□ 0.48
TNS1-214ENST00000479185 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.03■□□□□ 0.48
TNS1-214ENST00000479185 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.03■□□□□ 0.48
TNS1-214ENST00000479185 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TNS1-214ENST00000479185 NCOA1Q15788 1441 aa18.01■□□□□ 0.47
TNS1-214ENST00000479185 ADCY10Q96PN6 1610 aa18■□□□□ 0.47
TNS1-214ENST00000479185 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TNS1-214ENST00000479185 SHROOM2Q13796 1616 aa17.98■□□□□ 0.47
TNS1-214ENST00000479185 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.97■□□□□ 0.47
TNS1-214ENST00000479185 TSPY4P0CV99 314 aa17.96■□□□□ 0.47
TNS1-214ENST00000479185 TSPY10P0CW01 314 aa17.96■□□□□ 0.47
TNS1-214ENST00000479185 L3MBTL2Q969R5 705 aa17.95■□□□□ 0.46
TNS1-214ENST00000479185 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.95■□□□□ 0.46
TNS1-214ENST00000479185 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.94■□□□□ 0.46
TNS1-214ENST00000479185 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.92■□□□□ 0.46
TNS1-214ENST00000479185 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.92■□□□□ 0.46
TNS1-214ENST00000479185 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.91■□□□□ 0.46
TNS1-214ENST00000479185 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.91■□□□□ 0.46
TNS1-214ENST00000479185 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-214ENST00000479185 ABCC2Q92887 1545 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-214ENST00000479185 PLEKHG5O94827 1062 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-214ENST00000479185 PKD2Q13563 968 aa17.89■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 ADGRL2O95490 1459 aa17.88■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 PZPP20742 1482 aa17.88■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 MBD5Q9P267 1494 aa17.88■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 ERICH6BQ5W0A0 696 aa17.88■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 NUP155O75694 1391 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 KIF15Q9NS87 1388 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.85■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 NBPF8Q3BBV2 869 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.83■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.83■□□□□ 0.45
TNS1-214ENST00000479185 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.82■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 PKNOX2Q96KN3 472 aa17.81■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 PREX2Q70Z35 1606 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.442e-9■□□□□ 10.6
TNS1-214ENST00000479185 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.78■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.78■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TNS1-214ENST00000479185 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.76■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 PODXL2Q9NZ53 605 aa17.76■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.75■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 OSCARQ8IYS5 282 aa17.75■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.75■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.75■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.75■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 PLCH2O75038 1416 aa17.74■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 WASHC2AQ641Q2 1341 aa17.73■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 AFAP1Q8N556 730 aa17.72■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 CCDC136Q96JN2 1154 aa17.71■□□□□ 0.43
TNS1-214ENST00000479185 ANP32CO43423 234 aa17.69■□□□□ 0.42
TNS1-214ENST00000479185 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.69■□□□□ 0.42
TNS1-214ENST00000479185 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.69■□□□□ 0.42
TNS1-214ENST00000479185 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.67■□□□□ 0.42
TNS1-214ENST00000479185 MYO5CQ9NQX4 1742 aa17.67■□□□□ 0.42
TNS1-214ENST00000479185 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.64■□□□□ 0.41
TNS1-214ENST00000479185 RGL3Q3MIN7 710 aa17.63■□□□□ 0.41
TNS1-214ENST00000479185 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.63■□□□□ 0.41
TNS1-214ENST00000479185 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms