RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGB3BP-211ENST00000478538 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGB3BP-211ENST00000478538 POTEB3A0JP26 581 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGB3BP-211ENST00000478538 POTEBQ6S5H4 581 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGB3BP-211ENST00000478538 SNPHO15079 494 aa8.89□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 EMP3P54852 163 aa8.89□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.89□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 OCEL1Q9H607 264 aa8.89□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.88□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 CABP2Q9NPB3 220 aa8.88□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 SOX12O15370 315 aa8.87□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 NLRP6P59044 892 aa8.86□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.86□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.85□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPP1R37O75864 691 aa8.84□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 WDR70Q9NW82 654 aa8.84□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.84□□□□□ -0.99
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM205CA6NFA0 338 aa8.83□□□□□ -1
ITGB3BP-211ENST00000478538 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
ITGB3BP-211ENST00000478538 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.78□□□□□ -1
ITGB3BP-211ENST00000478538 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.78□□□□□ -1
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 GOLGA2Q08379 1002 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 E2F4Q16254 413 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 MFSD10Q14728 455 aa8.72□□□□□ -1.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 PDE4AP27815 886 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 CAMK2BQ13554 666 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB3BP-211ENST00000478538 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.63□□□□□ -1.03
ITGB3BP-211ENST00000478538 SEMA3EO15041 775 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGB3BP-211ENST00000478538 ERBB3P21860 1342 aa8.59□□□□□ -1.03
ITGB3BP-211ENST00000478538 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ITGB3BP-211ENST00000478538 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ITGB3BP-211ENST00000478538 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGB3BP-211ENST00000478538 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB3BP-211ENST00000478538 MICALL2Q8IY33 904 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGB3BP-211ENST00000478538 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB3BP-211ENST00000478538 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB3BP-211ENST00000478538 DOK7Q18PE1 504 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 DSG2Q14126 1118 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 FOXK1P85037 733 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 G3V3G9 751 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZMYND10O75800 440 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 PDIA6Q15084 440 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMC2Q8TDI7 906 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ITGB3BP-211ENST00000478538 DPYSL4O14531 572 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 KIF3CO14782 793 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 C2orf72A6NCS6 295 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 RIMBP2O15034 1052 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 BARGINQ6ZT62 677 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 PLPP6Q8IY26 295 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 PTGER2P43116 358 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGB3BP-211ENST00000478538 NEUROD2Q15784 382 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB3BP-211ENST00000478538 GPR153Q6NV75 609 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB3BP-211ENST00000478538 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB3BP-211ENST00000478538 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGB3BP-211ENST00000478538 GPR37O15354 613 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.36□□□□□ -1.07
ITGB3BP-211ENST00000478538 OXER1Q8TDS5 423 aa8.34□□□□□ -1.07
ITGB3BP-211ENST00000478538 AK7Q96M32 723 aa8.34□□□□□ -1.07
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAP3K9P80192 1104 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB3BP-211ENST00000478538 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.082e-7■■■□□ 19.1
ITGB3BP-211ENST00000478538 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB3BP-211ENST00000478538 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARSIQ5FYB1 569 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB3BP-211ENST00000478538 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB3BP-211ENST00000478538 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
ITGB3BP-211ENST00000478538 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
ITGB3BP-211ENST00000478538 OSBPP22059 807 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB3BP-211ENST00000478538 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms