RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478336.5

ARF1-208, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARF1, Length 930 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-208ENST00000478336 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.96■■■■□ 3.67
ARF1-208ENST00000478336 ADGRL1O94910 1474 aa37.94■■■■□ 3.66
ARF1-208ENST00000478336 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
ARF1-208ENST00000478336 RICTORQ6R327 1708 aa37.92■■■■□ 3.66
ARF1-208ENST00000478336 RAPGEF3O95398 923 aa37.91■■■■□ 3.66
ARF1-208ENST00000478336 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
ARF1-208ENST00000478336 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.88■■■■□ 3.65
ARF1-208ENST00000478336 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.87■■■■□ 3.65
ARF1-208ENST00000478336 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
ARF1-208ENST00000478336 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.83■■■■□ 3.65
ARF1-208ENST00000478336 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.82■■■■□ 3.64
ARF1-208ENST00000478336 NCOA2Q15596 1464 aa37.81■■■■□ 3.64
ARF1-208ENST00000478336 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.8■■■■□ 3.64
ARF1-208ENST00000478336 ABCC1P33527 1531 aa37.79■■■■□ 3.64
ARF1-208ENST00000478336 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.78■■■■□ 3.64
ARF1-208ENST00000478336 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
ARF1-208ENST00000478336 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.76■■■■□ 3.63
ARF1-208ENST00000478336 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.71■■■■□ 3.63
ARF1-208ENST00000478336 APLP2Q06481 763 aa37.71■■■■□ 3.63
ARF1-208ENST00000478336 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
ARF1-208ENST00000478336 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.71■■■■□ 3.63
ARF1-208ENST00000478336 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.7■■■■□ 3.63
ARF1-208ENST00000478336 KDM5CP41229 1560 aa37.69■■■■□ 3.62
ARF1-208ENST00000478336 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.67■■■■□ 3.62
ARF1-208ENST00000478336 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
ARF1-208ENST00000478336 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.64■■■■□ 3.62
ARF1-208ENST00000478336 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.63■■■■□ 3.61
ARF1-208ENST00000478336 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.63■■■■□ 3.61
ARF1-208ENST00000478336 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.63■■■■□ 3.61
ARF1-208ENST00000478336 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.61■■■■□ 3.61
ARF1-208ENST00000478336 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.61■■■■□ 3.61
ARF1-208ENST00000478336 AFAP1Q8N556 730 aa37.6■■■■□ 3.61
ARF1-208ENST00000478336 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.57■■■■□ 3.6
ARF1-208ENST00000478336 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
ARF1-208ENST00000478336 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.53■■■■□ 3.6
ARF1-208ENST00000478336 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.52■■■■□ 3.6
ARF1-208ENST00000478336 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.51■■■■□ 3.59
ARF1-208ENST00000478336 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.5■■■■□ 3.597e-7■■■■□ 22.9
ARF1-208ENST00000478336 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.5■■■■□ 3.59
ARF1-208ENST00000478336 MBD5Q9P267 1494 aa37.48■■■■□ 3.59
ARF1-208ENST00000478336 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.45■■■■□ 3.59
ARF1-208ENST00000478336 ATP10AO60312 1499 aa37.45■■■■□ 3.59
ARF1-208ENST00000478336 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.45■■■■□ 3.58
ARF1-208ENST00000478336 MIA2Q96PC5 1412 aa37.44■■■■□ 3.58
ARF1-208ENST00000478336 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.44■■■■□ 3.58
ARF1-208ENST00000478336 ABCA6Q8N139 1617 aa37.43■■■■□ 3.58
ARF1-208ENST00000478336 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.41■■■■□ 3.58
ARF1-208ENST00000478336 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
ARF1-208ENST00000478336 REREQ9P2R6 1566 aa37.37■■■■□ 3.57
ARF1-208ENST00000478336 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
ARF1-208ENST00000478336 ATP7AQ04656 1500 aa37.36■■■■□ 3.57
ARF1-208ENST00000478336 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.36■■■■□ 3.57
ARF1-208ENST00000478336 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.36■■■■□ 3.57
ARF1-208ENST00000478336 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.36■■■■□ 3.57
ARF1-208ENST00000478336 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.34■■■■□ 3.57
ARF1-208ENST00000478336 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
ARF1-208ENST00000478336 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.32■■■■□ 3.57
ARF1-208ENST00000478336 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
ARF1-208ENST00000478336 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.29■■■■□ 3.56
ARF1-208ENST00000478336 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.28■■■■□ 3.56
ARF1-208ENST00000478336 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.28■■■■□ 3.56
ARF1-208ENST00000478336 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.26■■■■□ 3.55
ARF1-208ENST00000478336 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
ARF1-208ENST00000478336 AGLP35573 1532 aa37.22■■■■□ 3.55
ARF1-208ENST00000478336 MADDQ8WXG6 1647 aa37.21■■■■□ 3.55
ARF1-208ENST00000478336 PLXNC1O60486 1568 aa37.17■■■■□ 3.54
ARF1-208ENST00000478336 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.17■■■■□ 3.54
ARF1-208ENST00000478336 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.16■■■■□ 3.54
ARF1-208ENST00000478336 A2MP01023 1474 aa37.14■■■■□ 3.54
ARF1-208ENST00000478336 MLECQ14165 292 aa37.11■■■■□ 3.53
ARF1-208ENST00000478336 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.1■■■■□ 3.53
ARF1-208ENST00000478336 TSPY4P0CV99 314 aa37.1■■■■□ 3.53
ARF1-208ENST00000478336 TSPY10P0CW01 314 aa37.1■■■■□ 3.53
ARF1-208ENST00000478336 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
ARF1-208ENST00000478336 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
ARF1-208ENST00000478336 PTPRMP28827 1452 aa37.08■■■■□ 3.53
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ARF1-208ENST00000478336 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.08■■■■□ 3.53
ARF1-208ENST00000478336 ABCC5O15440 1437 aa37.08■■■■□ 3.53
ARF1-208ENST00000478336 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.07■■■■□ 3.52
ARF1-208ENST00000478336 DAPK1P53355 1430 aa37.05■■■■□ 3.52
ARF1-208ENST00000478336 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
ARF1-208ENST00000478336 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
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ARF1-208ENST00000478336 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.85■■■■□ 3.497e-9■■□□□ 12.8
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ARF1-208ENST00000478336 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
ARF1-208ENST00000478336 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.84■■■■□ 3.49
ARF1-208ENST00000478336 ADGRL2O95490 1459 aa36.83■■■■□ 3.49
ARF1-208ENST00000478336 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 KIF3BO15066 747 aa36.81■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 GGT6Q6P531 493 aa36.8■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 MROH2AA6NES4 1674 aa36.8■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.79■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 NCOA1Q15788 1441 aa36.79■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.78■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 PTPRKQ15262 1439 aa36.77■■■■□ 3.48
ARF1-208ENST00000478336 C3P01024 1663 aa36.77■■■■□ 3.48
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