RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NCOA2Q15596 1464 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KDM6BO15054 1643 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PREX2Q70Z35 1606 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RAPGEF3O95398 923 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADGRL1O94910 1474 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MIA2Q96PC5 1412 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.89■■■□□ 2.38
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 AFAP1Q8N556 730 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.8■■■□□ 2.36
HOXB-AS3-208ENST00000476204 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABCC1P33527 1531 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.77■■■□□ 2.36
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 TSPY10P0CW01 314 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.76■■■□□ 2.35
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.68■■■□□ 2.34
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 KDM5CP41229 1560 aa29.65■■■□□ 2.34
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.63■■■□□ 2.33
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A2MP01023 1474 aa29.4■■■□□ 2.3
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIF3BO15066 747 aa29.3■■■□□ 2.28
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADGRL2O95490 1459 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLXNC1O60486 1568 aa29.28■■■□□ 2.28
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.27■■■□□ 2.28
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 GGT6Q6P531 493 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ERBINQ96RT1 1412 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
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