RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475241.1

PKDCC-204, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 3

Gene PKDCC, Length 773 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-204ENST00000475241 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.69■■□□□ 1.86
PKDCC-204ENST00000475241 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.69■■□□□ 1.86
PKDCC-204ENST00000475241 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.69■■□□□ 1.86
PKDCC-204ENST00000475241 TIAM1Q13009 1591 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-204ENST00000475241 RICTORQ6R327 1708 aa26.68■■□□□ 1.86
PKDCC-204ENST00000475241 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PKDCC-204ENST00000475241 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.65■■□□□ 1.86
PKDCC-204ENST00000475241 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.65■■□□□ 1.86
PKDCC-204ENST00000475241 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.64■■□□□ 1.86
PKDCC-204ENST00000475241 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.64■■□□□ 1.85
PKDCC-204ENST00000475241 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.63■■□□□ 1.85
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.59■■□□□ 1.85
PKDCC-204ENST00000475241 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.59■■□□□ 1.85
PKDCC-204ENST00000475241 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PKDCC-204ENST00000475241 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.57■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 ABCC1P33527 1531 aa26.56■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 APLP2Q06481 763 aa26.56■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 NCOA2Q15596 1464 aa26.55■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.55■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.55■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.54■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 KDM5CP41229 1560 aa26.53■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.53■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.52■■□□□ 1.84
PKDCC-204ENST00000475241 AFAP1Q8N556 730 aa26.51■■□□□ 1.83
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PKDCC-204ENST00000475241 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.5■■□□□ 1.83
PKDCC-204ENST00000475241 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.5■■□□□ 1.83
PKDCC-204ENST00000475241 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PKDCC-204ENST00000475241 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.48■■□□□ 1.83
PKDCC-204ENST00000475241 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.48■■□□□ 1.83
PKDCC-204ENST00000475241 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.47■■□□□ 1.83
PKDCC-204ENST00000475241 ATP10AO60312 1499 aa26.44■■□□□ 1.82
PKDCC-204ENST00000475241 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.43■■□□□ 1.82
PKDCC-204ENST00000475241 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.43■■□□□ 1.82
PKDCC-204ENST00000475241 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
PKDCC-204ENST00000475241 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PKDCC-204ENST00000475241 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.39■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.38■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.37■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 MBD5Q9P267 1494 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 MIA2Q96PC5 1412 aa26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 REREQ9P2R6 1566 aa26.35■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.34■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.33■■□□□ 1.81
PKDCC-204ENST00000475241 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.33■■□□□ 1.8
PKDCC-204ENST00000475241 ABCA6Q8N139 1617 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-204ENST00000475241 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.29■■□□□ 1.8
PKDCC-204ENST00000475241 ATP7AQ04656 1500 aa26.28■■□□□ 1.8
PKDCC-204ENST00000475241 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-204ENST00000475241 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-204ENST00000475241 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.27■■□□□ 1.8
PKDCC-204ENST00000475241 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-204ENST00000475241 AGLP35573 1532 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-204ENST00000475241 TSPY4P0CV99 314 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-204ENST00000475241 TSPY10P0CW01 314 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-204ENST00000475241 PTPRMP28827 1452 aa26.2■■□□□ 1.78
PKDCC-204ENST00000475241 MADDQ8WXG6 1647 aa26.2■■□□□ 1.78
PKDCC-204ENST00000475241 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.18■■□□□ 1.78
PKDCC-204ENST00000475241 A2MP01023 1474 aa26.17■■□□□ 1.78
PKDCC-204ENST00000475241 MLECQ14165 292 aa26.16■■□□□ 1.78
PKDCC-204ENST00000475241 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.15■■□□□ 1.78
PKDCC-204ENST00000475241 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PKDCC-204ENST00000475241 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.14■■□□□ 1.78
PKDCC-204ENST00000475241 PLXNC1O60486 1568 aa26.14■■□□□ 1.78
PKDCC-204ENST00000475241 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.12■■□□□ 1.77
PKDCC-204ENST00000475241 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-204ENST00000475241 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PKDCC-204ENST00000475241 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.1■■□□□ 1.77
PKDCC-204ENST00000475241 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.07■■□□□ 1.76
PKDCC-204ENST00000475241 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-204ENST00000475241 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-204ENST00000475241 ABCC5O15440 1437 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-204ENST00000475241 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-204ENST00000475241 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-204ENST00000475241 DAPK1P53355 1430 aa26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-204ENST00000475241 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.99■■□□□ 1.75
PKDCC-204ENST00000475241 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PKDCC-204ENST00000475241 GGT6Q6P531 493 aa25.96■■□□□ 1.75
PKDCC-204ENST00000475241 KIF3BO15066 747 aa25.95■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.93■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.93■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 MROH2AA6NES4 1674 aa25.93■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.92■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 KIF15Q9NS87 1388 aa25.91■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 ZMYM3Q14202 1370 aa25.9■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PKDCC-204ENST00000475241 NCOA1Q15788 1441 aa25.88■■□□□ 1.73
PKDCC-204ENST00000475241 C3P01024 1663 aa25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms