RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475208.5

TMEM54-205, Transcript of transmembrane protein 54, human

TSL 1 (best)

Gene TMEM54, Length 768 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM54-205	ENST00000475208	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.12	■■■■■ 4.17
TMEM54-205	ENST00000475208	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.11	■■■■■ 4.17
TMEM54-205	ENST00000475208	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.11	■■■■■ 4.17
TMEM54-205	ENST00000475208	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.11	■■■■■ 4.17
TMEM54-205	ENST00000475208	KIF14	Q15058	1648 aa		41.08	■■■■■ 4.17
TMEM54-205	ENST00000475208	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		41.07	■■■■■ 4.16
TMEM54-205	ENST00000475208	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.04	■■■■■ 4.16
TMEM54-205	ENST00000475208	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.04	■■■■■ 4.16
TMEM54-205	ENST00000475208	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.98	■■■■■ 4.15
TMEM54-205	ENST00000475208	CLIP1	P30622	1438 aa		40.98	■■■■■ 4.15
TMEM54-205	ENST00000475208	MLEC	Q14165	292 aa		40.96	■■■■■ 4.15
TMEM54-205	ENST00000475208	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		40.96	■■■■■ 4.15
TMEM54-205	ENST00000475208	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.94	■■■■■ 4.14
TMEM54-205	ENST00000475208	ATP10A	O60312	1499 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TMEM54-205	ENST00000475208	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TMEM54-205	ENST00000475208	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TMEM54-205	ENST00000475208	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		40.9	■■■■■ 4.14
TMEM54-205	ENST00000475208	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.84	■■■■■ 4.13
TMEM54-205	ENST00000475208	KDM5C	P41229	1560 aa		40.84	■■■■■ 4.13
TMEM54-205	ENST00000475208	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.84	■■■■■ 4.13
TMEM54-205	ENST00000475208	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.83	■■■■■ 4.13
TMEM54-205	ENST00000475208	HSPA2	P54652	639 aa		40.82	■■■■■ 4.13
TMEM54-205	ENST00000475208	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.82	■■■■■ 4.12
TMEM54-205	ENST00000475208	AFAP1	Q8N556	730 aa		40.8	■■■■■ 4.12
TMEM54-205	ENST00000475208	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		40.79	■■■■■ 4.12
TMEM54-205	ENST00000475208	PREX2	Q70Z35	1606 aa		40.75	■■■■■ 4.11
TMEM54-205	ENST00000475208	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.72	■■■■■ 4.11
TMEM54-205	ENST00000475208	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.72	■■■■■ 4.11
TMEM54-205	ENST00000475208	ABCC1	P33527	1531 aa		40.69	■■■■■ 4.1
TMEM54-205	ENST00000475208	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.67	■■■■■ 4.1
TMEM54-205	ENST00000475208	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.66	■■■■■ 4.1
TMEM54-205	ENST00000475208	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.65	■■■■■ 4.1
TMEM54-205	ENST00000475208	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.65	■■■■■ 4.1
TMEM54-205	ENST00000475208	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.64	■■■■■ 4.1
TMEM54-205	ENST00000475208	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.62	■■■■■ 4.09
TMEM54-205	ENST00000475208	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.61	■■■■■ 4.09
TMEM54-205	ENST00000475208	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.61	■■■■■ 4.09
TMEM54-205	ENST00000475208	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		40.6	■■■■■ 4.09
TMEM54-205	ENST00000475208	AGL	P35573	1532 aa		40.52	■■■■■ 4.08
TMEM54-205	ENST00000475208	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.49	■■■■■ 4.07
TMEM54-205	ENST00000475208	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.45	■■■■■ 4.07
TMEM54-205	ENST00000475208	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.45	■■■■■ 4.07
TMEM54-205	ENST00000475208	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
TMEM54-205	ENST00000475208	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
TMEM54-205	ENST00000475208	C3	P01024	1663 aa		40.42	■■■■■ 4.06
TMEM54-205	ENST00000475208	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.42	■■■■■ 4.06
TMEM54-205	ENST00000475208	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
TMEM54-205	ENST00000475208	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
TMEM54-205	ENST00000475208	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.37	■■■■■ 4.05
TMEM54-205	ENST00000475208	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.33	■■■■■ 4.05
TMEM54-205	ENST00000475208	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.31	■■■■■ 4.04
TMEM54-205	ENST00000475208	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.31	■■■■■ 4.04
TMEM54-205	ENST00000475208	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.31	■■■■■ 4.04
TMEM54-205	ENST00000475208	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.29	■■■■■ 4.04
TMEM54-205	ENST00000475208	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.29	■■■■■ 4.04
TMEM54-205	ENST00000475208	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.28	■■■■■ 4.04
TMEM54-205	ENST00000475208	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.27	■■■■■ 4.04
TMEM54-205	ENST00000475208	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.27	■■■■■ 4.04
TMEM54-205	ENST00000475208	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.27	■■■■■ 4.04
TMEM54-205	ENST00000475208	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.26	■■■■■ 4.03
TMEM54-205	ENST00000475208	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.23	■■■■■ 4.03
TMEM54-205	ENST00000475208	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
TMEM54-205	ENST00000475208	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.18	■■■■■ 4.02
TMEM54-205	ENST00000475208	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.17	■■■■■ 4.02
TMEM54-205	ENST00000475208	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.15	■■■■■ 4.02
TMEM54-205	ENST00000475208	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.15	■■■■■ 4.02
TMEM54-205	ENST00000475208	A2M	P01023	1474 aa		40.14	■■■■■ 4.02
TMEM54-205	ENST00000475208	PTPRT	O14522	1441 aa		40.12	■■■■■ 4.01
TMEM54-205	ENST00000475208	NPAT	Q14207	1427 aa		40.12	■■■■■ 4.01
TMEM54-205	ENST00000475208	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.1	■■■■■ 4.01
TMEM54-205	ENST00000475208	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.08	■■■■■ 4.01
TMEM54-205	ENST00000475208	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4
TMEM54-205	ENST00000475208	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.07	■■■■■ 4
TMEM54-205	ENST00000475208	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.06	■■■■■ 4
TMEM54-205	ENST00000475208	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.02	■■■■■ 4
TMEM54-205	ENST00000475208	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.02	■■■■■ 4
TMEM54-205	ENST00000475208	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		39.99	■■■■□ 3.99
TMEM54-205	ENST00000475208	GGT6	Q6P531	493 aa		39.99	■■■■□ 3.99
TMEM54-205	ENST00000475208	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		39.94	■■■■□ 3.98
TMEM54-205	ENST00000475208	PTPRK	Q15262	1439 aa		39.93	■■■■□ 3.98
TMEM54-205	ENST00000475208	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		39.92	■■■■□ 3.98
TMEM54-205	ENST00000475208	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		39.91	■■■■□ 3.98
TMEM54-205	ENST00000475208	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	39.9	■■■■□ 3.98
TMEM54-205	ENST00000475208	NCOA2	Q15596	1464 aa		39.89	■■■■□ 3.98
TMEM54-205	ENST00000475208	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		39.88	■■■■□ 3.97
TMEM54-205	ENST00000475208	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	39.85	■■■■□ 3.97
TMEM54-205	ENST00000475208	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		39.85	■■■■□ 3.97
TMEM54-205	ENST00000475208	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	39.84	■■■■□ 3.97
TMEM54-205	ENST00000475208	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		39.84	■■■■□ 3.97
TMEM54-205	ENST00000475208	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		39.83	■■■■□ 3.97
TMEM54-205	ENST00000475208	PLA2R1	Q13018	1463 aa		39.81	■■■■□ 3.96
TMEM54-205	ENST00000475208	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		39.77	■■■■□ 3.96
TMEM54-205	ENST00000475208	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	39.74	■■■■□ 3.95
TMEM54-205	ENST00000475208	KIF3B	O15066	747 aa		39.73	■■■■□ 3.95
TMEM54-205	ENST00000475208	PKD2	Q13563	968 aa		39.73	■■■■□ 3.95
TMEM54-205	ENST00000475208	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		39.73	■■■■□ 3.95
TMEM54-205	ENST00000475208	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		39.69	■■■■□ 3.94
TMEM54-205	ENST00000475208	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	39.68	■■■■□ 3.94
TMEM54-205	ENST00000475208	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		39.68	■■■■□ 3.94
TMEM54-205	ENST00000475208	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		39.68	■■■■□ 3.94

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