RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473689.5

IMP4-213, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, human

TSL 5

Gene IMP4, Length 877 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IMP4-213	ENST00000473689	PTPRM	P28827	1452 aa		33.57	■■■□□ 2.97
IMP4-213	ENST00000473689	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.56	■■■□□ 2.96
IMP4-213	ENST00000473689	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.55	■■■□□ 2.96
IMP4-213	ENST00000473689	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
IMP4-213	ENST00000473689	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.53	■■■□□ 2.96
IMP4-213	ENST00000473689	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.52	■■■□□ 2.96
IMP4-213	ENST00000473689	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.49	■■■□□ 2.95
IMP4-213	ENST00000473689	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.48	■■■□□ 2.95
IMP4-213	ENST00000473689	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.46	■■■□□ 2.95
IMP4-213	ENST00000473689	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.45	■■■□□ 2.95
IMP4-213	ENST00000473689	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.43	■■■□□ 2.94
IMP4-213	ENST00000473689	ATP10A	O60312	1499 aa		33.41	■■■□□ 2.94
IMP4-213	ENST00000473689	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.41	■■■□□ 2.94
IMP4-213	ENST00000473689	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.38	■■■□□ 2.93
IMP4-213	ENST00000473689	MLEC	Q14165	292 aa		33.34	■■■□□ 2.93
IMP4-213	ENST00000473689	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.34	■■■□□ 2.93
IMP4-213	ENST00000473689	KDM5C	P41229	1560 aa		33.34	■■■□□ 2.93
IMP4-213	ENST00000473689	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.33	■■■□□ 2.93
IMP4-213	ENST00000473689	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.33	■■■□□ 2.93
IMP4-213	ENST00000473689	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.3	■■■□□ 2.92
IMP4-213	ENST00000473689	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.29	■■■□□ 2.92
IMP4-213	ENST00000473689	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.28	■■■□□ 2.92
IMP4-213	ENST00000473689	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.92
IMP4-213	ENST00000473689	ABCC1	P33527	1531 aa		33.25	■■■□□ 2.91
IMP4-213	ENST00000473689	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
IMP4-213	ENST00000473689	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.24	■■■□□ 2.91
IMP4-213	ENST00000473689	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.23	■■■□□ 2.91
IMP4-213	ENST00000473689	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.22	■■■□□ 2.91
IMP4-213	ENST00000473689	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
IMP4-213	ENST00000473689	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
IMP4-213	ENST00000473689	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.19	■■■□□ 2.9
IMP4-213	ENST00000473689	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.19	■■■□□ 2.9
IMP4-213	ENST00000473689	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.17	■■■□□ 2.9
IMP4-213	ENST00000473689	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.17	■■■□□ 2.9
IMP4-213	ENST00000473689	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.15	■■■□□ 2.9
IMP4-213	ENST00000473689	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
IMP4-213	ENST00000473689	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.14	■■■□□ 2.9
IMP4-213	ENST00000473689	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.14	■■■□□ 2.9
IMP4-213	ENST00000473689	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.13	■■■□□ 2.89
IMP4-213	ENST00000473689	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.11	■■■□□ 2.89
IMP4-213	ENST00000473689	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.11	■■■□□ 2.89
IMP4-213	ENST00000473689	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.1	■■■□□ 2.89
IMP4-213	ENST00000473689	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.09	■■■□□ 2.89
IMP4-213	ENST00000473689	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
IMP4-213	ENST00000473689	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.09	■■■□□ 2.89
IMP4-213	ENST00000473689	AGL	P35573	1532 aa		33.08	■■■□□ 2.89
IMP4-213	ENST00000473689	HSPA2	P54652	639 aa		33.08	■■■□□ 2.89
IMP4-213	ENST00000473689	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
IMP4-213	ENST00000473689	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.05	■■■□□ 2.88
IMP4-213	ENST00000473689	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.05	■■■□□ 2.88
IMP4-213	ENST00000473689	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.05	■■■□□ 2.88
IMP4-213	ENST00000473689	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33	■■■□□ 2.87
IMP4-213	ENST00000473689	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
IMP4-213	ENST00000473689	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.96	■■■□□ 2.87
IMP4-213	ENST00000473689	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
IMP4-213	ENST00000473689	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.92	■■■□□ 2.86
IMP4-213	ENST00000473689	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.9	■■■□□ 2.86
IMP4-213	ENST00000473689	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.88	■■■□□ 2.85
IMP4-213	ENST00000473689	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.86	■■■□□ 2.85
IMP4-213	ENST00000473689	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.86	■■■□□ 2.85
IMP4-213	ENST00000473689	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
IMP4-213	ENST00000473689	A2M	P01023	1474 aa		32.85	■■■□□ 2.85
IMP4-213	ENST00000473689	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.83	■■■□□ 2.85
IMP4-213	ENST00000473689	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.83	■■■□□ 2.85
IMP4-213	ENST00000473689	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.82	■■■□□ 2.84
IMP4-213	ENST00000473689	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.81	■■■□□ 2.84
IMP4-213	ENST00000473689	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.8	■■■□□ 2.84
IMP4-213	ENST00000473689	C3	P01024	1663 aa		32.78	■■■□□ 2.84
IMP4-213	ENST00000473689	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.78	■■■□□ 2.84
IMP4-213	ENST00000473689	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.78	■■■□□ 2.84
IMP4-213	ENST00000473689	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
IMP4-213	ENST00000473689	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.76	■■■□□ 2.84
IMP4-213	ENST00000473689	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
IMP4-213	ENST00000473689	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
IMP4-213	ENST00000473689	GGT6	Q6P531	493 aa		32.74	■■■□□ 2.83
IMP4-213	ENST00000473689	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.74	■■■□□ 2.83
IMP4-213	ENST00000473689	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
IMP4-213	ENST00000473689	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.72	■■■□□ 2.83
IMP4-213	ENST00000473689	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.71	■■■□□ 2.83
IMP4-213	ENST00000473689	NPAT	Q14207	1427 aa		32.7	■■■□□ 2.83
IMP4-213	ENST00000473689	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.7	■■■□□ 2.83
IMP4-213	ENST00000473689	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.69	■■■□□ 2.82
IMP4-213	ENST00000473689	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.65	■■■□□ 2.82
IMP4-213	ENST00000473689	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.65	■■■□□ 2.82
IMP4-213	ENST00000473689	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.63	■■■□□ 2.81
IMP4-213	ENST00000473689	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.61	■■■□□ 2.81
IMP4-213	ENST00000473689	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.61	■■■□□ 2.81
IMP4-213	ENST00000473689	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.6	■■■□□ 2.81
IMP4-213	ENST00000473689	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.6	■■■□□ 2.81
IMP4-213	ENST00000473689	KIF3B	O15066	747 aa		32.59	■■■□□ 2.81
IMP4-213	ENST00000473689	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.58	■■■□□ 2.81
IMP4-213	ENST00000473689	PTPRT	O14522	1441 aa		32.56	■■■□□ 2.8
IMP4-213	ENST00000473689	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
IMP4-213	ENST00000473689	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.55	■■■□□ 2.8
IMP4-213	ENST00000473689	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.53	■■■□□ 2.8
IMP4-213	ENST00000473689	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.53	■■■□□ 2.8
IMP4-213	ENST00000473689	APLP2	Q06481	763 aa		32.46	■■■□□ 2.79
IMP4-213	ENST00000473689	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.45	■■■□□ 2.78
IMP4-213	ENST00000473689	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.44	■■■□□ 2.78
IMP4-213	ENST00000473689	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78

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