RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.13■■■■■ 4.18
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HOXB3-207ENST00000472863 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
HOXB3-207ENST00000472863 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.08■■■■■ 4.17
HOXB3-207ENST00000472863 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.06■■■■■ 4.16
HOXB3-207ENST00000472863 ABCC5O15440 1437 aa41.06■■■■■ 4.16
HOXB3-207ENST00000472863 DAPK1P53355 1430 aa41.06■■■■■ 4.16
HOXB3-207ENST00000472863 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.06■■■■■ 4.16
HOXB3-207ENST00000472863 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
HOXB3-207ENST00000472863 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.03■■■■■ 4.16
HOXB3-207ENST00000472863 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.03■■■■■ 4.16
HOXB3-207ENST00000472863 PLCH2O75038 1416 aa41.02■■■■■ 4.16
HOXB3-207ENST00000472863 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.97■■■■■ 4.15
HOXB3-207ENST00000472863 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.152e-6■■■■□ 24.7
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HOXB3-207ENST00000472863 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.95■■■■■ 4.15
HOXB3-207ENST00000472863 HFM1A2PYH4 1435 aa40.94■■■■■ 4.14
HOXB3-207ENST00000472863 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.91■■■■■ 4.14
HOXB3-207ENST00000472863 NAIPQ13075 1403 aa40.9■■■■■ 4.14
HOXB3-207ENST00000472863 MAPKBP1O60336 1514 aa40.88■■■■■ 4.14
HOXB3-207ENST00000472863 MBD5Q9P267 1494 aa40.88■■■■■ 4.13
HOXB3-207ENST00000472863 AKNAQ7Z591 1439 aa40.86■■■■■ 4.13
HOXB3-207ENST00000472863 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.82■■■■■ 4.13
HOXB3-207ENST00000472863 ROCK1Q13464 1354 aa40.82■■■■■ 4.12
HOXB3-207ENST00000472863 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.81■■■■■ 4.12
HOXB3-207ENST00000472863 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.81■■■■■ 4.12
HOXB3-207ENST00000472863 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
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HOXB3-207ENST00000472863 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.78■■■■■ 4.12
HOXB3-207ENST00000472863 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.76■■■■■ 4.12
HOXB3-207ENST00000472863 TSPY4P0CV99 314 aa40.76■■■■■ 4.12
HOXB3-207ENST00000472863 TSPY10P0CW01 314 aa40.76■■■■■ 4.12
HOXB3-207ENST00000472863 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
HOXB3-207ENST00000472863 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.76■■■■■ 4.12
HOXB3-207ENST00000472863 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.76■■■■■ 4.11
HOXB3-207ENST00000472863 CD109Q6YHK3 1445 aa40.74■■■■■ 4.11
HOXB3-207ENST00000472863 FANCAO15360 1455 aa40.74■■■■■ 4.11
HOXB3-207ENST00000472863 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.74■■■■■ 4.11
HOXB3-207ENST00000472863 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.73■■■■■ 4.11
HOXB3-207ENST00000472863 NCOA1Q15788 1441 aa40.73■■■■■ 4.11
HOXB3-207ENST00000472863 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.72■■■■■ 4.11
HOXB3-207ENST00000472863 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.71■■■■■ 4.11
HOXB3-207ENST00000472863 ADGRL2O95490 1459 aa40.7■■■■■ 4.11
HOXB3-207ENST00000472863 ABCC1P33527 1531 aa40.69■■■■■ 4.1
HOXB3-207ENST00000472863 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.69■■■■■ 4.1
HOXB3-207ENST00000472863 KDM6BO15054 1643 aa40.67■■■■■ 4.1
HOXB3-207ENST00000472863 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.66■■■■■ 4.1
HOXB3-207ENST00000472863 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.61■■■■■ 4.09
HOXB3-207ENST00000472863 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.57■■■■■ 4.09
HOXB3-207ENST00000472863 GLI2P10070 1586 aa40.56■■■■■ 4.08
HOXB3-207ENST00000472863 ADGRL1O94910 1474 aa40.55■■■■■ 4.08
HOXB3-207ENST00000472863 AFAP1Q8N556 730 aa40.55■■■■■ 4.08
HOXB3-207ENST00000472863 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.54■■■■■ 4.08
HOXB3-207ENST00000472863 DIP2BQ9P265 1576 aa40.53■■■■■ 4.08
HOXB3-207ENST00000472863 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.52■■■■■ 4.08
HOXB3-207ENST00000472863 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.52■■■■■ 4.08
HOXB3-207ENST00000472863 KIF15Q9NS87 1388 aa40.49■■■■■ 4.07
HOXB3-207ENST00000472863 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.49■■■■■ 4.07
HOXB3-207ENST00000472863 TRIM52Q96A61 297 aa40.48■■■■■ 4.07
HOXB3-207ENST00000472863 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.46■■■■■ 4.07
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HOXB3-207ENST00000472863 PLXNC1O60486 1568 aa40.35■■■■■ 4.05
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HOXB3-207ENST00000472863 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.26■■■■■ 4.04
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HOXB3-207ENST00000472863 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.98■■■■□ 3.99
HOXB3-207ENST00000472863 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.95■■■■□ 3.99
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