RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SYP-205ENST00000472598 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.95■■■□□ 2.38
SYP-205ENST00000472598 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.93■■■□□ 2.38
SYP-205ENST00000472598 MLECQ14165 292 aa29.91■■■□□ 2.38
SYP-205ENST00000472598 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.9■■■□□ 2.38
SYP-205ENST00000472598 MADDQ8WXG6 1647 aa29.9■■■□□ 2.38
SYP-205ENST00000472598 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.9■■■□□ 2.38
SYP-205ENST00000472598 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.89■■■□□ 2.38
SYP-205ENST00000472598 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.89■■■□□ 2.38
SYP-205ENST00000472598 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
SYP-205ENST00000472598 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.89■■■□□ 2.38
SYP-205ENST00000472598 AFAP1Q8N556 730 aa29.86■■■□□ 2.37
SYP-205ENST00000472598 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.86■■■□□ 2.37
SYP-205ENST00000472598 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.85■■■□□ 2.37
SYP-205ENST00000472598 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.85■■■□□ 2.37
SYP-205ENST00000472598 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.84■■■□□ 2.37
SYP-205ENST00000472598 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.82■■■□□ 2.36
SYP-205ENST00000472598 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
SYP-205ENST00000472598 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.78■■■□□ 2.36
SYP-205ENST00000472598 ATP10AO60312 1499 aa29.77■■■□□ 2.36
SYP-205ENST00000472598 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.74■■■□□ 2.35
SYP-205ENST00000472598 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.72■■■□□ 2.35
SYP-205ENST00000472598 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.71■■■□□ 2.35
SYP-205ENST00000472598 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
SYP-205ENST00000472598 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.68■■■□□ 2.34
SYP-205ENST00000472598 HSPA2P54652 639 aa29.68■■■□□ 2.34
SYP-205ENST00000472598 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.67■■■□□ 2.34
SYP-205ENST00000472598 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.67■■■□□ 2.34
SYP-205ENST00000472598 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
SYP-205ENST00000472598 PREX2Q70Z35 1606 aa29.64■■■□□ 2.34
SYP-205ENST00000472598 KDM5CP41229 1560 aa29.64■■■□□ 2.33
SYP-205ENST00000472598 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.62■■■□□ 2.33
SYP-205ENST00000472598 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.61■■■□□ 2.33
SYP-205ENST00000472598 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.6■■■□□ 2.33
SYP-205ENST00000472598 ABCC1P33527 1531 aa29.59■■■□□ 2.33
SYP-205ENST00000472598 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.58■■■□□ 2.33
SYP-205ENST00000472598 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.57■■■□□ 2.32
SYP-205ENST00000472598 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.56■■■□□ 2.32
SYP-205ENST00000472598 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
SYP-205ENST00000472598 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.54■■■□□ 2.32
SYP-205ENST00000472598 ABCA6Q8N139 1617 aa29.53■■■□□ 2.32
SYP-205ENST00000472598 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SYP-205ENST00000472598 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.52■■■□□ 2.32
SYP-205ENST00000472598 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.51■■■□□ 2.31
SYP-205ENST00000472598 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.49■■■□□ 2.31
SYP-205ENST00000472598 TIAM1Q13009 1591 aa29.48■■■□□ 2.31
SYP-205ENST00000472598 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.47■■■□□ 2.31
SYP-205ENST00000472598 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
SYP-205ENST00000472598 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.45■■■□□ 2.31
SYP-205ENST00000472598 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SYP-205ENST00000472598 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.45■■■□□ 2.3
SYP-205ENST00000472598 REREQ9P2R6 1566 aa29.44■■■□□ 2.3
SYP-205ENST00000472598 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SYP-205ENST00000472598 FBXO41Q8TF61 875 aa29.41■■■□□ 2.3
SYP-205ENST00000472598 AGLP35573 1532 aa29.4■■■□□ 2.3
SYP-205ENST00000472598 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.38■■■□□ 2.29
SYP-205ENST00000472598 MAP3K1Q13233 1512 aa29.36■■■□□ 2.29
SYP-205ENST00000472598 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.34■■■□□ 2.29
SYP-205ENST00000472598 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.33■■■□□ 2.29
SYP-205ENST00000472598 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.32■■■□□ 2.28
SYP-205ENST00000472598 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SYP-205ENST00000472598 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SYP-205ENST00000472598 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.3■■■□□ 2.28
SYP-205ENST00000472598 C3P01024 1663 aa29.3■■■□□ 2.28
SYP-205ENST00000472598 ATP7AQ04656 1500 aa29.3■■■□□ 2.28
SYP-205ENST00000472598 GGT6Q6P531 493 aa29.28■■■□□ 2.28
SYP-205ENST00000472598 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SYP-205ENST00000472598 NCOA2Q15596 1464 aa29.26■■■□□ 2.27
SYP-205ENST00000472598 A2MP01023 1474 aa29.25■■■□□ 2.27
SYP-205ENST00000472598 MBD5Q9P267 1494 aa29.24■■■□□ 2.27
SYP-205ENST00000472598 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.24■■■□□ 2.27
SYP-205ENST00000472598 ZMYM3Q14202 1370 aa29.24■■■□□ 2.27
SYP-205ENST00000472598 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
SYP-205ENST00000472598 CERKQ8TCT0 537 aa29.22■■■□□ 2.27
SYP-205ENST00000472598 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.19■■■□□ 2.26
SYP-205ENST00000472598 STRCQ7RTU9 1775 aa29.18■■■□□ 2.26
SYP-205ENST00000472598 PLXNC1O60486 1568 aa29.15■■■□□ 2.26
SYP-205ENST00000472598 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
SYP-205ENST00000472598 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.11■■■□□ 2.25
SYP-205ENST00000472598 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.11■■■□□ 2.25
SYP-205ENST00000472598 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SYP-205ENST00000472598 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.09■■■□□ 2.25
SYP-205ENST00000472598 KIF3BO15066 747 aa29.09■■■□□ 2.25
SYP-205ENST00000472598 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.09■■■□□ 2.25
SYP-205ENST00000472598 MROH2AA6NES4 1674 aa29.09■■■□□ 2.25
SYP-205ENST00000472598 APLP2Q06481 763 aa29.08■■■□□ 2.25
SYP-205ENST00000472598 NPATQ14207 1427 aa29.08■■■□□ 2.25
SYP-205ENST00000472598 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.07■■■□□ 2.24
SYP-205ENST00000472598 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.07■■■□□ 2.24
SYP-205ENST00000472598 TSPY4P0CV99 314 aa29.05■■■□□ 2.24
SYP-205ENST00000472598 TSPY10P0CW01 314 aa29.05■■■□□ 2.24
SYP-205ENST00000472598 PTPRKQ15262 1439 aa29.03■■■□□ 2.24
SYP-205ENST00000472598 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.02■■■□□ 2.24
SYP-205ENST00000472598 PTPRTO14522 1441 aa29.02■■■□□ 2.24
SYP-205ENST00000472598 NCOA1Q15788 1441 aa29.02■■■□□ 2.24
SYP-205ENST00000472598 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.02■■■□□ 2.24
SYP-205ENST00000472598 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.99■■■□□ 2.23
SYP-205ENST00000472598 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
SYP-205ENST00000472598 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.95■■■□□ 2.23
SYP-205ENST00000472598 MIA2Q96PC5 1412 aa28.94■■■□□ 2.22
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