RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470711.6

LMAN1L-204, Transcript of lectin, mannose binding 1 like, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMAN1L, Length 1,398 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1L-204ENST00000470711 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.38■■■□□ 2.77
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LMAN1L-204ENST00000470711 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.37■■■□□ 2.77
LMAN1L-204ENST00000470711 KIF14Q15058 1648 aa32.36■■■□□ 2.77
LMAN1L-204ENST00000470711 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.34■■■□□ 2.77
LMAN1L-204ENST00000470711 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
LMAN1L-204ENST00000470711 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.33■■■□□ 2.77
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LMAN1L-204ENST00000470711 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.31■■■□□ 2.76
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LMAN1L-204ENST00000470711 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.23■■■□□ 2.75
LMAN1L-204ENST00000470711 AFAP1Q8N556 730 aa32.22■■■□□ 2.75
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LMAN1L-204ENST00000470711 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.19■■■□□ 2.74
LMAN1L-204ENST00000470711 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.17■■■□□ 2.74
LMAN1L-204ENST00000470711 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.17■■■□□ 2.74
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LMAN1L-204ENST00000470711 KDM5CP41229 1560 aa32.14■■■□□ 2.73
LMAN1L-204ENST00000470711 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.12■■■□□ 2.73
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LMAN1L-204ENST00000470711 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.35■■■□□ 2.61
LMAN1L-204ENST00000470711 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
LMAN1L-204ENST00000470711 PKD2Q13563 968 aa31.3■■■□□ 2.6
LMAN1L-204ENST00000470711 PLA2R1Q13018 1463 aa31.3■■■□□ 2.6
LMAN1L-204ENST00000470711 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
LMAN1L-204ENST00000470711 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.29■■■□□ 2.6
LMAN1L-204ENST00000470711 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
LMAN1L-204ENST00000470711 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
LMAN1L-204ENST00000470711 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.27■■■□□ 2.6
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