RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469990.1

LMNTD2-203, Transcript of lamin tail domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMNTD2, Length 1,232 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2-203ENST00000469990 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.18■■■■■ 4.34
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LMNTD2-203ENST00000469990 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.13■■■■■ 4.34
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LMNTD2-203ENST00000469990 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.09■■■■■ 4.33
LMNTD2-203ENST00000469990 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
LMNTD2-203ENST00000469990 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.07■■■■■ 4.33
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LMNTD2-203ENST00000469990 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.94■■■■■ 4.3
LMNTD2-203ENST00000469990 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.94■■■■■ 4.3
LMNTD2-203ENST00000469990 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.93■■■■■ 4.3
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LMNTD2-203ENST00000469990 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.91■■■■■ 4.3
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LMNTD2-203ENST00000469990 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.84■■■■■ 4.29
LMNTD2-203ENST00000469990 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.81■■■■■ 4.28
LMNTD2-203ENST00000469990 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.8■■■■■ 4.28
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LMNTD2-203ENST00000469990 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.74■■■■■ 4.27
LMNTD2-203ENST00000469990 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
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LMNTD2-203ENST00000469990 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.72■■■■■ 4.27
LMNTD2-203ENST00000469990 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.72■■■■■ 4.27
LMNTD2-203ENST00000469990 MIA2Q96PC5 1412 aa41.71■■■■■ 4.27
LMNTD2-203ENST00000469990 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.7■■■■■ 4.27
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LMNTD2-203ENST00000469990 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.67■■■■■ 4.26
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LMNTD2-203ENST00000469990 ATP10AO60312 1499 aa41.66■■■■■ 4.26
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LMNTD2-203ENST00000469990 MBD5Q9P267 1494 aa41.61■■■■■ 4.25
LMNTD2-203ENST00000469990 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.59■■■■■ 4.25
LMNTD2-203ENST00000469990 TSPY4P0CV99 314 aa41.52■■■■■ 4.24
LMNTD2-203ENST00000469990 TSPY10P0CW01 314 aa41.52■■■■■ 4.24
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LMNTD2-203ENST00000469990 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.49■■■■■ 4.23
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LMNTD2-203ENST00000469990 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.48■■■■■ 4.23
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LMNTD2-203ENST00000469990 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.46■■■■■ 4.23
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LMNTD2-203ENST00000469990 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.33■■■■■ 4.21
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LMNTD2-203ENST00000469990 KIF15Q9NS87 1388 aa41■■■■■ 4.15
LMNTD2-203ENST00000469990 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.99■■■■■ 4.15
LMNTD2-203ENST00000469990 NCOA1Q15788 1441 aa40.94■■■■■ 4.14
LMNTD2-203ENST00000469990 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
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LMNTD2-203ENST00000469990 ERBINQ96RT1 1412 aa40.9■■■■■ 4.14
LMNTD2-203ENST00000469990 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
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