RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPN3-209ENST00000466222 PLCH2O75038 1416 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPN3-209ENST00000466222 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
CAPN3-209ENST00000466222 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPN3-209ENST00000466222 MAPKBP1O60336 1514 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPN3-209ENST00000466222 ABCC5O15440 1437 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPN3-209ENST00000466222 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPN3-209ENST00000466222 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPN3-209ENST00000466222 PREX2Q70Z35 1606 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPN3-209ENST00000466222 DAPK1P53355 1430 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPN3-209ENST00000466222 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPN3-209ENST00000466222 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPN3-209ENST00000466222 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPN3-209ENST00000466222 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPN3-209ENST00000466222 CD109Q6YHK3 1445 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPN3-209ENST00000466222 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPN3-209ENST00000466222 MBD5Q9P267 1494 aa27.7■■■□□ 2.03
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPN3-209ENST00000466222 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPN3-209ENST00000466222 FANCAO15360 1455 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPN3-209ENST00000466222 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPN3-209ENST00000466222 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPN3-209ENST00000466222 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPN3-209ENST00000466222 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
CAPN3-209ENST00000466222 NAIPQ13075 1403 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPN3-209ENST00000466222 AKNAQ7Z591 1439 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPN3-209ENST00000466222 TSPY4P0CV99 314 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPN3-209ENST00000466222 TSPY10P0CW01 314 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPN3-209ENST00000466222 AFAP1Q8N556 730 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPN3-209ENST00000466222 HFM1A2PYH4 1435 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPN3-209ENST00000466222 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CAPN3-209ENST00000466222 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPN3-209ENST00000466222 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPN3-209ENST00000466222 DIP2BQ9P265 1576 aa27.57■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.57■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.57■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.56■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.56■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.56■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 NCOA1Q15788 1441 aa27.55■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 ABCC1P33527 1531 aa27.55■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 ROCK1Q13464 1354 aa27.55■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 ADGRL1O94910 1474 aa27.54■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 GLI2P10070 1586 aa27.53■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.53■■■□□ 2
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPN3-209ENST00000466222 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPN3-209ENST00000466222 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPN3-209ENST00000466222 ADGRL2O95490 1459 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPN3-209ENST00000466222 RAPGEF3O95398 923 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPN3-209ENST00000466222 KDM6BO15054 1643 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPN3-209ENST00000466222 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CAPN3-209ENST00000466222 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPN3-209ENST00000466222 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPN3-209ENST00000466222 KIF15Q9NS87 1388 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPN3-209ENST00000466222 NEO1Q92859 1461 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPN3-209ENST00000466222 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPN3-209ENST00000466222 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM52Q96A61 297 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPN3-209ENST00000466222 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPN3-209ENST00000466222 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPN3-209ENST00000466222 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPN3-209ENST00000466222 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPN3-209ENST00000466222 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPN3-209ENST00000466222 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPN3-209ENST00000466222 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPN3-209ENST00000466222 TSPOAP1O95153 1857 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPN3-209ENST00000466222 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPN3-209ENST00000466222 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPN3-209ENST00000466222 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPN3-209ENST00000466222 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPN3-209ENST00000466222 ATP7AQ04656 1500 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPN3-209ENST00000466222 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPN3-209ENST00000466222 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPN3-209ENST00000466222 FOXD1Q16676 465 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPN3-209ENST00000466222 PLXNC1O60486 1568 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPN3-209ENST00000466222 KDM5CP41229 1560 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPN3-209ENST00000466222 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPN3-209ENST00000466222 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
CAPN3-209ENST00000466222 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPN3-209ENST00000466222 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPN3-209ENST00000466222 NUP155O75694 1391 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPN3-209ENST00000466222 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPN3-209ENST00000466222 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPN3-209ENST00000466222 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPN3-209ENST00000466222 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPN3-209ENST00000466222 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPN3-209ENST00000466222 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPN3-209ENST00000466222 ERBINQ96RT1 1412 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPN3-209ENST00000466222 KIF3BO15066 747 aa27.14■■□□□ 1.93
CAPN3-209ENST00000466222 PZPP20742 1482 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPN3-209ENST00000466222 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPN3-209ENST00000466222 RICTORQ6R327 1708 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPN3-209ENST00000466222 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPN3-209ENST00000466222 NEUROD1Q13562 356 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPN3-209ENST00000466222 A2MP01023 1474 aa27.09■■□□□ 1.93
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