RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464957.1

CPTP-202, Transcript of ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

TSL 2

Gene CPTP, Length 1,101 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTP-202ENST00000464957 YEATS2Q9ULM3 1422 aa49.87■■■■■ 5.57
CPTP-202ENST00000464957 MYO5CQ9NQX4 1742 aa49.83■■■■■ 5.57
CPTP-202ENST00000464957 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa49.82■■■■■ 5.57
CPTP-202ENST00000464957 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP49.79■■■■■ 5.56
CPTP-202ENST00000464957 KIF14Q15058 1648 aa49.78■■■■■ 5.56
CPTP-202ENST00000464957 PLPPR3Q6T4P5 718 aa49.75■■■■■ 5.55
CPTP-202ENST00000464957 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP49.75■■■■■ 5.55
CPTP-202ENST00000464957 CLIP1P30622 1438 aa49.74■■■■■ 5.55
CPTP-202ENST00000464957 MLECQ14165 292 aa49.73■■■■■ 5.55
CPTP-202ENST00000464957 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa49.73■■■■■ 5.55
CPTP-202ENST00000464957 LMTK3Q96Q04 1460 aa49.7■■■■■ 5.55
CPTP-202ENST00000464957 ARHGAP5Q13017 1502 aa49.65■■■■■ 5.54
CPTP-202ENST00000464957 ATP10AO60312 1499 aa49.63■■■■■ 5.54
CPTP-202ENST00000464957 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa49.63■■■■■ 5.54
CPTP-202ENST00000464957 C9orf84Q5VXU9 1444 aa49.59■■■■■ 5.53
CPTP-202ENST00000464957 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa49.58■■■■■ 5.53
CPTP-202ENST00000464957 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa49.57■■■■■ 5.53
CPTP-202ENST00000464957 MYT1LQ9UL68 1186 aa49.54■■■■■ 5.52
CPTP-202ENST00000464957 FBXO41Q8TF61 875 aa49.51■■■■■ 5.52
CPTP-202ENST00000464957 CCDC18Q5T9S5 1454 aa49.5■■■■■ 5.52
CPTP-202ENST00000464957 AFAP1Q8N556 730 aa49.5■■■■■ 5.51
CPTP-202ENST00000464957 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa49.5■■■■■ 5.51
CPTP-202ENST00000464957 HSPA2P54652 639 aa49.49■■■■■ 5.51
CPTP-202ENST00000464957 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa49.45■■■■■ 5.51
CPTP-202ENST00000464957 KDM5CP41229 1560 aa49.44■■■■■ 5.5
CPTP-202ENST00000464957 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa49.43■■■■■ 5.5
CPTP-202ENST00000464957 PREX2Q70Z35 1606 aa49.37■■■■■ 5.49
CPTP-202ENST00000464957 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa49.31■■■■■ 5.48
CPTP-202ENST00000464957 FYCO1Q9BQS8 1478 aa49.3■■■■■ 5.48
CPTP-202ENST00000464957 ABCC1P33527 1531 aa49.29■■■■■ 5.48
CPTP-202ENST00000464957 MLH3Q9UHC1 1453 aa49.26■■■■■ 5.48
CPTP-202ENST00000464957 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP49.26■■■■■ 5.48
CPTP-202ENST00000464957 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa49.25■■■■■ 5.47
CPTP-202ENST00000464957 ABCA6Q8N139 1617 aa49.23■■■■■ 5.47
CPTP-202ENST00000464957 ITSN2Q9NZM3 1697 aa49.23■■■■■ 5.47
CPTP-202ENST00000464957 REREQ9P2R6 1566 aa49.22■■■■■ 5.47
CPTP-202ENST00000464957 PREX1Q8TCU6 1659 aa49.2■■■■■ 5.47
CPTP-202ENST00000464957 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa49.2■■■■■ 5.47
CPTP-202ENST00000464957 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP49.14■■■■■ 5.46
CPTP-202ENST00000464957 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP49.12■■■■■ 5.45
CPTP-202ENST00000464957 AGLP35573 1532 aa49.08■■■■■ 5.45
CPTP-202ENST00000464957 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa49.05■■■■■ 5.44
CPTP-202ENST00000464957 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa49.05■■■■■ 5.44
CPTP-202ENST00000464957 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP49■■■■■ 5.43
CPTP-202ENST00000464957 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa49■■■■■ 5.43
CPTP-202ENST00000464957 SYCP2Q9BX26 1530 aa48.98■■■■■ 5.43
CPTP-202ENST00000464957 C3P01024 1663 aa48.96■■■■■ 5.43
CPTP-202ENST00000464957 CERKQ8TCT0 537 aa48.96■■■■■ 5.43
CPTP-202ENST00000464957 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP48.94■■■■■ 5.43
CPTP-202ENST00000464957 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP48.93■■■■■ 5.42
CPTP-202ENST00000464957 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP48.93■■■■■ 5.42
CPTP-202ENST00000464957 CCNB3Q8WWL7 1395 aa48.91■■■■■ 5.42
CPTP-202ENST00000464957 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP48.91■■■■■ 5.42
CPTP-202ENST00000464957 MTUS2Q5JR59 1369 aa48.9■■■■■ 5.42
CPTP-202ENST00000464957 DMRT2Q9Y5R5 561 aa48.9■■■■■ 5.42
CPTP-202ENST00000464957 CNTLNQ9NXG0 1405 aa48.87■■■■■ 5.41
CPTP-202ENST00000464957 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa48.86■■■■■ 5.41
CPTP-202ENST00000464957 STRCQ7RTU9 1775 aa48.83■■■■■ 5.41
CPTP-202ENST00000464957 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa48.82■■■■■ 5.41
CPTP-202ENST00000464957 ATP7AQ04656 1500 aa48.78■■■■■ 5.4
CPTP-202ENST00000464957 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP48.76■■■■■ 5.4
CPTP-202ENST00000464957 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP48.7■■■■■ 5.39
CPTP-202ENST00000464957 MROH2AA6NES4 1674 aa48.68■■■■■ 5.38
CPTP-202ENST00000464957 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa48.68■■■■■ 5.38
CPTP-202ENST00000464957 A2MP01023 1474 aa48.67■■■■■ 5.38
CPTP-202ENST00000464957 TIAM1Q13009 1591 aa48.64■■■■■ 5.38
CPTP-202ENST00000464957 ZMYM3Q14202 1370 aa48.64■■■■■ 5.38
CPTP-202ENST00000464957 PTPRTO14522 1441 aa48.62■■■■■ 5.37
CPTP-202ENST00000464957 PLXNC1O60486 1568 aa48.61■■■■■ 5.37
CPTP-202ENST00000464957 NPATQ14207 1427 aa48.61■■■■■ 5.37
CPTP-202ENST00000464957 CEP162Q5TB80 1403 aa48.61■■■■■ 5.37
CPTP-202ENST00000464957 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP48.58■■■■■ 5.37
CPTP-202ENST00000464957 GGT6Q6P531 493 aa48.57■■■■■ 5.37
CPTP-202ENST00000464957 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
CPTP-202ENST00000464957 ADGBQ8N7X0 1667 aa48.53■■■■■ 5.36
CPTP-202ENST00000464957 NCOA1Q15788 1441 aa48.52■■■■■ 5.36
CPTP-202ENST00000464957 MBD5Q9P267 1494 aa48.48■■■■■ 5.35
CPTP-202ENST00000464957 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa48.47■■■■■ 5.35
CPTP-202ENST00000464957 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa48.41■■■■■ 5.34
CPTP-202ENST00000464957 PPP6R1Q9UPN7 881 aa48.41■■■■■ 5.34
CPTP-202ENST00000464957 PTPRKQ15262 1439 aa48.37■■■■■ 5.33
CPTP-202ENST00000464957 MYO3AQ8NEV4 1616 aa48.36■■■■■ 5.33
CPTP-202ENST00000464957 NCOA2Q15596 1464 aa48.36■■■■■ 5.33
CPTP-202ENST00000464957 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP48.33■■■■■ 5.33
CPTP-202ENST00000464957 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa48.32■■■■■ 5.33
CPTP-202ENST00000464957 CCDC141Q6ZP82 1450 aa48.31■■■■■ 5.32
CPTP-202ENST00000464957 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP48.31■■■■■ 5.32
CPTP-202ENST00000464957 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa48.3■■■■■ 5.32
CPTP-202ENST00000464957 LTBP4Q8N2S1 1624 aa48.29■■■■■ 5.32
CPTP-202ENST00000464957 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP48.28■■■■■ 5.32
CPTP-202ENST00000464957 RSPH4AQ5TD94 716 aa48.26■■■■■ 5.32
CPTP-202ENST00000464957 KIF3BO15066 747 aa48.23■■■■■ 5.31
CPTP-202ENST00000464957 PLA2R1Q13018 1463 aa48.23■■■■■ 5.31
CPTP-202ENST00000464957 PKD2Q13563 968 aa48.22■■■■■ 5.31
CPTP-202ENST00000464957 IQSEC2Q5JU85 1478 aa48.17■■■■■ 5.3
CPTP-202ENST00000464957 TSPY4P0CV99 314 aa48.13■■■■■ 5.3
CPTP-202ENST00000464957 TSPY10P0CW01 314 aa48.13■■■■■ 5.3
CPTP-202ENST00000464957 VPS8Q8N3P4 1428 aa48.12■■■■■ 5.29
CPTP-202ENST00000464957 A2ML1A8K2U0 1454 aa48.11■■■■■ 5.29
CPTP-202ENST00000464957 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms