RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, human

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IMP4-209	ENST00000462357	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.22	■■■□□ 2.75
IMP4-209	ENST00000462357	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.21	■■■□□ 2.75
IMP4-209	ENST00000462357	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.2	■■■□□ 2.75
IMP4-209	ENST00000462357	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
IMP4-209	ENST00000462357	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.16	■■■□□ 2.74
IMP4-209	ENST00000462357	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
IMP4-209	ENST00000462357	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.11	■■■□□ 2.73
IMP4-209	ENST00000462357	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.1	■■■□□ 2.73
IMP4-209	ENST00000462357	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
IMP4-209	ENST00000462357	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.08	■■■□□ 2.73
IMP4-209	ENST00000462357	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.06	■■■□□ 2.72
IMP4-209	ENST00000462357	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.06	■■■□□ 2.72
IMP4-209	ENST00000462357	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.06	■■■□□ 2.72
IMP4-209	ENST00000462357	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.04	■■■□□ 2.72
IMP4-209	ENST00000462357	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
IMP4-209	ENST00000462357	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
IMP4-209	ENST00000462357	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.03	■■■□□ 2.72
IMP4-209	ENST00000462357	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.02	■■■□□ 2.72
IMP4-209	ENST00000462357	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.01	■■■□□ 2.72
IMP4-209	ENST00000462357	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32	■■■□□ 2.71
IMP4-209	ENST00000462357	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.99	■■■□□ 2.71
IMP4-209	ENST00000462357	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
IMP4-209	ENST00000462357	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.98	■■■□□ 2.71
IMP4-209	ENST00000462357	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.95	■■■□□ 2.71
IMP4-209	ENST00000462357	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.95	■■■□□ 2.71
IMP4-209	ENST00000462357	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.95	■■■□□ 2.7
IMP4-209	ENST00000462357	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.94	■■■□□ 2.7
IMP4-209	ENST00000462357	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.94	■■■□□ 2.7
IMP4-209	ENST00000462357	ABCC1	P33527	1531 aa		31.92	■■■□□ 2.7
IMP4-209	ENST00000462357	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.91	■■■□□ 2.7
IMP4-209	ENST00000462357	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
IMP4-209	ENST00000462357	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.88	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.87	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.86	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.85	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.85	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.85	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	ATP10A	O60312	1499 aa		31.84	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.84	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	KDM5C	P41229	1560 aa		31.83	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.83	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.83	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.83	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.83	■■■□□ 2.69
IMP4-209	ENST00000462357	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.82	■■■□□ 2.68
IMP4-209	ENST00000462357	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.79	■■■□□ 2.68
IMP4-209	ENST00000462357	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.77	■■■□□ 2.68
IMP4-209	ENST00000462357	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.75	■■■□□ 2.67
IMP4-209	ENST00000462357	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.72	■■■□□ 2.67
IMP4-209	ENST00000462357	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.7	■■■□□ 2.66
IMP4-209	ENST00000462357	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.69	■■■□□ 2.66
IMP4-209	ENST00000462357	MLEC	Q14165	292 aa		31.67	■■■□□ 2.66
IMP4-209	ENST00000462357	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
IMP4-209	ENST00000462357	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.63	■■■□□ 2.65
IMP4-209	ENST00000462357	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.62	■■■□□ 2.65
IMP4-209	ENST00000462357	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.6	■■■□□ 2.65
IMP4-209	ENST00000462357	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.6	■■■□□ 2.65
IMP4-209	ENST00000462357	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.6	■■■□□ 2.65
IMP4-209	ENST00000462357	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.58	■■■□□ 2.65
IMP4-209	ENST00000462357	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
IMP4-209	ENST00000462357	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.56	■■■□□ 2.64
IMP4-209	ENST00000462357	AGL	P35573	1532 aa		31.55	■■■□□ 2.64
IMP4-209	ENST00000462357	A2M	P01023	1474 aa		31.55	■■■□□ 2.64
IMP4-209	ENST00000462357	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.55	■■■□□ 2.64
IMP4-209	ENST00000462357	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
IMP4-209	ENST00000462357	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.53	■■■□□ 2.64
IMP4-209	ENST00000462357	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
IMP4-209	ENST00000462357	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
IMP4-209	ENST00000462357	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.51	■■■□□ 2.63
IMP4-209	ENST00000462357	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
IMP4-209	ENST00000462357	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.51	■■■□□ 2.63
IMP4-209	ENST00000462357	PTPRM	P28827	1452 aa		31.46	■■■□□ 2.63
IMP4-209	ENST00000462357	GGT6	Q6P531	493 aa		31.45	■■■□□ 2.63
IMP4-209	ENST00000462357	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.44	■■■□□ 2.62
IMP4-209	ENST00000462357	ABCC5	O15440	1437 aa		31.43	■■■□□ 2.62
IMP4-209	ENST00000462357	DAPK1	P53355	1430 aa		31.42	■■■□□ 2.62
IMP4-209	ENST00000462357	KIF3B	O15066	747 aa		31.42	■■■□□ 2.62
IMP4-209	ENST00000462357	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.41	■■■□□ 2.62
IMP4-209	ENST00000462357	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.41	■■■□□ 2.62
IMP4-209	ENST00000462357	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.41	■■■□□ 2.62
IMP4-209	ENST00000462357	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.41	■■■□□ 2.62
IMP4-209	ENST00000462357	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.4	■■■□□ 2.62
IMP4-209	ENST00000462357	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.38	■■■□□ 2.61
IMP4-209	ENST00000462357	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		31.37	■■■□□ 2.61
IMP4-209	ENST00000462357	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.36	■■■□□ 2.61
IMP4-209	ENST00000462357	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		31.36	■■■□□ 2.61
IMP4-209	ENST00000462357	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.35	■■■□□ 2.61
IMP4-209	ENST00000462357	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	31.35	■■■□□ 2.61
IMP4-209	ENST00000462357	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
IMP4-209	ENST00000462357	KIF15	Q9NS87	1388 aa		31.32	■■■□□ 2.6
IMP4-209	ENST00000462357	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
IMP4-209	ENST00000462357	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.31	■■■□□ 2.6
IMP4-209	ENST00000462357	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		31.29	■■■□□ 2.6
IMP4-209	ENST00000462357	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		31.28	■■■□□ 2.6
IMP4-209	ENST00000462357	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
IMP4-209	ENST00000462357	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.24	■■■□□ 2.59
IMP4-209	ENST00000462357	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.24	■■■□□ 2.59
IMP4-209	ENST00000462357	ITGAE	P38570	1179 aa		31.23	■■■□□ 2.59
IMP4-209	ENST00000462357	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		31.23	■■■□□ 2.59

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