RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.19■■■■□ 3.7
SMKR1-201ENST00000462322 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.15■■■■□ 3.7
SMKR1-201ENST00000462322 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.15■■■■□ 3.7
SMKR1-201ENST00000462322 PREX2Q70Z35 1606 aa38.15■■■■□ 3.7
SMKR1-201ENST00000462322 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.12■■■■□ 3.69
SMKR1-201ENST00000462322 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.12■■■■□ 3.69
SMKR1-201ENST00000462322 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.09■■■■□ 3.69
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.08■■■■□ 3.69
SMKR1-201ENST00000462322 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.06■■■■□ 3.68
SMKR1-201ENST00000462322 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.04■■■■□ 3.68
SMKR1-201ENST00000462322 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.04■■■■□ 3.68
SMKR1-201ENST00000462322 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
SMKR1-201ENST00000462322 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
SMKR1-201ENST00000462322 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.03■■■■□ 3.68
SMKR1-201ENST00000462322 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.03■■■■□ 3.68
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.02■■■■□ 3.68
SMKR1-201ENST00000462322 AFAP1Q8N556 730 aa38.01■■■■□ 3.68
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
SMKR1-201ENST00000462322 ABCC1P33527 1531 aa37.97■■■■□ 3.67
SMKR1-201ENST00000462322 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
SMKR1-201ENST00000462322 TIAM1Q13009 1591 aa37.96■■■■□ 3.67
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.94■■■■□ 3.66
SMKR1-201ENST00000462322 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.93■■■■□ 3.66
SMKR1-201ENST00000462322 KDM5CP41229 1560 aa37.93■■■■□ 3.66
SMKR1-201ENST00000462322 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.91■■■■□ 3.66
SMKR1-201ENST00000462322 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.9■■■■□ 3.66
SMKR1-201ENST00000462322 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.89■■■■□ 3.66
SMKR1-201ENST00000462322 ATP10AO60312 1499 aa37.86■■■■□ 3.65
SMKR1-201ENST00000462322 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.86■■■■□ 3.65
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.85■■■■□ 3.65
SMKR1-201ENST00000462322 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.85■■■■□ 3.65
SMKR1-201ENST00000462322 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
SMKR1-201ENST00000462322 NCOA2Q15596 1464 aa37.84■■■■□ 3.65
SMKR1-201ENST00000462322 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.82■■■■□ 3.65
SMKR1-201ENST00000462322 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.82■■■■□ 3.64
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.82■■■■□ 3.64
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.82■■■■□ 3.64
SMKR1-201ENST00000462322 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.82■■■■□ 3.64
SMKR1-201ENST00000462322 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.81■■■■□ 3.64
SMKR1-201ENST00000462322 MAP3K1Q13233 1512 aa37.81■■■■□ 3.64
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.79■■■■□ 3.64
SMKR1-201ENST00000462322 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.79■■■■□ 3.64
SMKR1-201ENST00000462322 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
SMKR1-201ENST00000462322 APLP2Q06481 763 aa37.74■■■■□ 3.63
SMKR1-201ENST00000462322 MLECQ14165 292 aa37.74■■■■□ 3.63
SMKR1-201ENST00000462322 MADDQ8WXG6 1647 aa37.74■■■■□ 3.63
SMKR1-201ENST00000462322 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.73■■■■□ 3.63
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRMP28827 1452 aa37.71■■■■□ 3.63
SMKR1-201ENST00000462322 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
SMKR1-201ENST00000462322 ABCA6Q8N139 1617 aa37.7■■■■□ 3.63
SMKR1-201ENST00000462322 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.68■■■■□ 3.62
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SMKR1-201ENST00000462322 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
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SMKR1-201ENST00000462322 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.58■■■■□ 3.61
SMKR1-201ENST00000462322 ATP7AQ04656 1500 aa37.58■■■■□ 3.61
SMKR1-201ENST00000462322 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
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SMKR1-201ENST00000462322 AGLP35573 1532 aa37.53■■■■□ 3.6
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SMKR1-201ENST00000462322 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.5■■■■□ 3.59
SMKR1-201ENST00000462322 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.49■■■■□ 3.59
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.48■■■■□ 3.59
SMKR1-201ENST00000462322 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.44■■■■□ 3.58
SMKR1-201ENST00000462322 MIA2Q96PC5 1412 aa37.44■■■■□ 3.58
SMKR1-201ENST00000462322 A2MP01023 1474 aa37.43■■■■□ 3.58
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.41■■■■□ 3.58
SMKR1-201ENST00000462322 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
SMKR1-201ENST00000462322 TSPY4P0CV99 314 aa37.37■■■■□ 3.57
SMKR1-201ENST00000462322 TSPY10P0CW01 314 aa37.37■■■■□ 3.57
SMKR1-201ENST00000462322 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.37■■■■□ 3.57
SMKR1-201ENST00000462322 PLXNC1O60486 1568 aa37.36■■■■□ 3.57
SMKR1-201ENST00000462322 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
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SMKR1-201ENST00000462322 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.25■■■■□ 3.55
SMKR1-201ENST00000462322 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.25■■■■□ 3.55
SMKR1-201ENST00000462322 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.24■■■■□ 3.55
SMKR1-201ENST00000462322 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.2■■■■□ 3.55
SMKR1-201ENST00000462322 C3P01024 1663 aa37.18■■■■□ 3.54
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SMKR1-201ENST00000462322 ABCC5O15440 1437 aa37.12■■■■□ 3.53
SMKR1-201ENST00000462322 HSPA2P54652 639 aa37.11■■■■□ 3.53
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SMKR1-201ENST00000462322 MROH2AA6NES4 1674 aa37.11■■■■□ 3.53
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SMKR1-201ENST00000462322 DAPK1P53355 1430 aa37.08■■■■□ 3.53
SMKR1-201ENST00000462322 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.07■■■■□ 3.52
SMKR1-201ENST00000462322 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
SMKR1-201ENST00000462322 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.05■■■■□ 3.52
SMKR1-201ENST00000462322 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.04■■■■□ 3.52
SMKR1-201ENST00000462322 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
SMKR1-201ENST00000462322 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
SMKR1-201ENST00000462322 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.98■■■■□ 3.51
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