RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461426.1

SIGMAR1-204, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SIGMAR1, Length 939 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-204ENST00000461426 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.86■■■■■ 4.29
SIGMAR1-204ENST00000461426 APLP2Q06481 763 aa41.85■■■■■ 4.29
SIGMAR1-204ENST00000461426 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.84■■■■■ 4.29
SIGMAR1-204ENST00000461426 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
SIGMAR1-204ENST00000461426 PREX2Q70Z35 1606 aa41.8■■■■■ 4.28
SIGMAR1-204ENST00000461426 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.8■■■■■ 4.28
SIGMAR1-204ENST00000461426 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
SIGMAR1-204ENST00000461426 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.78■■■■■ 4.28
SIGMAR1-204ENST00000461426 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.76■■■■■ 4.28
SIGMAR1-204ENST00000461426 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.76■■■■■ 4.27
SIGMAR1-204ENST00000461426 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
SIGMAR1-204ENST00000461426 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.73■■■■■ 4.27
SIGMAR1-204ENST00000461426 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
SIGMAR1-204ENST00000461426 RICTORQ6R327 1708 aa41.72■■■■■ 4.27
SIGMAR1-204ENST00000461426 NCOA2Q15596 1464 aa41.7■■■■■ 4.27
SIGMAR1-204ENST00000461426 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
SIGMAR1-204ENST00000461426 AFAP1Q8N556 730 aa41.65■■■■■ 4.26
SIGMAR1-204ENST00000461426 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.65■■■■■ 4.26
SIGMAR1-204ENST00000461426 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.64■■■■■ 4.26
SIGMAR1-204ENST00000461426 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.63■■■■■ 4.25
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCC1P33527 1531 aa41.6■■■■■ 4.25
SIGMAR1-204ENST00000461426 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.59■■■■■ 4.25
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.58■■■■■ 4.25
SIGMAR1-204ENST00000461426 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.58■■■■■ 4.25
SIGMAR1-204ENST00000461426 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.56■■■■■ 4.24
SIGMAR1-204ENST00000461426 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.54■■■■■ 4.24
SIGMAR1-204ENST00000461426 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.54■■■■■ 4.24
SIGMAR1-204ENST00000461426 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.54■■■■■ 4.24
SIGMAR1-204ENST00000461426 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.54■■■■■ 4.24
SIGMAR1-204ENST00000461426 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
SIGMAR1-204ENST00000461426 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.51■■■■■ 4.24
SIGMAR1-204ENST00000461426 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
SIGMAR1-204ENST00000461426 KDM5CP41229 1560 aa41.5■■■■■ 4.23
SIGMAR1-204ENST00000461426 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.49■■■■■ 4.23
SIGMAR1-204ENST00000461426 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.49■■■■■ 4.23
SIGMAR1-204ENST00000461426 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.49■■■■■ 4.23
SIGMAR1-204ENST00000461426 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.45■■■■■ 4.23
SIGMAR1-204ENST00000461426 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.44■■■■■ 4.23
SIGMAR1-204ENST00000461426 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
SIGMAR1-204ENST00000461426 ATP10AO60312 1499 aa41.41■■■■■ 4.22
SIGMAR1-204ENST00000461426 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.38■■■■■ 4.22
SIGMAR1-204ENST00000461426 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.38■■■■■ 4.21
SIGMAR1-204ENST00000461426 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
SIGMAR1-204ENST00000461426 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.36■■■■■ 4.21
SIGMAR1-204ENST00000461426 MIA2Q96PC5 1412 aa41.35■■■■■ 4.21
SIGMAR1-204ENST00000461426 MBD5Q9P267 1494 aa41.35■■■■■ 4.21
SIGMAR1-204ENST00000461426 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.32■■■■■ 4.21
SIGMAR1-204ENST00000461426 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.31■■■■■ 4.2
SIGMAR1-204ENST00000461426 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.22■■■■■ 4.19
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.22■■■■■ 4.19
SIGMAR1-204ENST00000461426 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.2■■■■■ 4.19
SIGMAR1-204ENST00000461426 TSPY4P0CV99 314 aa41.18■■■■■ 4.18
SIGMAR1-204ENST00000461426 TSPY10P0CW01 314 aa41.18■■■■■ 4.18
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCA6Q8N139 1617 aa41.18■■■■■ 4.18
SIGMAR1-204ENST00000461426 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.18■■■■■ 4.18
SIGMAR1-204ENST00000461426 ATP7AQ04656 1500 aa41.17■■■■■ 4.18
SIGMAR1-204ENST00000461426 REREQ9P2R6 1566 aa41.16■■■■■ 4.18
SIGMAR1-204ENST00000461426 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.15■■■■■ 4.18
SIGMAR1-204ENST00000461426 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.15■■■■■ 4.18
SIGMAR1-204ENST00000461426 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.13■■■■■ 4.17
SIGMAR1-204ENST00000461426 MLECQ14165 292 aa41.13■■■■■ 4.17
SIGMAR1-204ENST00000461426 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.13■■■■■ 4.17
SIGMAR1-204ENST00000461426 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
SIGMAR1-204ENST00000461426 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.11■■■■■ 4.17
SIGMAR1-204ENST00000461426 AGLP35573 1532 aa41.07■■■■■ 4.16
SIGMAR1-204ENST00000461426 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.05■■■■■ 4.16
SIGMAR1-204ENST00000461426 A2MP01023 1474 aa41.02■■■■■ 4.16
SIGMAR1-204ENST00000461426 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
SIGMAR1-204ENST00000461426 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
SIGMAR1-204ENST00000461426 MADDQ8WXG6 1647 aa40.97■■■■■ 4.15
SIGMAR1-204ENST00000461426 PTPRMP28827 1452 aa40.96■■■■■ 4.15
SIGMAR1-204ENST00000461426 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
SIGMAR1-204ENST00000461426 ABCC5O15440 1437 aa40.93■■■■■ 4.14
SIGMAR1-204ENST00000461426 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.92■■■■■ 4.14
SIGMAR1-204ENST00000461426 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
SIGMAR1-204ENST00000461426 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.91■■■■■ 4.14
SIGMAR1-204ENST00000461426 PLXNC1O60486 1568 aa40.91■■■■■ 4.14
SIGMAR1-204ENST00000461426 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
SIGMAR1-204ENST00000461426 DAPK1P53355 1430 aa40.86■■■■■ 4.13
SIGMAR1-204ENST00000461426 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.84■■■■■ 4.13
SIGMAR1-204ENST00000461426 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
SIGMAR1-204ENST00000461426 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
SIGMAR1-204ENST00000461426 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.81■■■■■ 4.12
SIGMAR1-204ENST00000461426 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.81■■■■■ 4.12
SIGMAR1-204ENST00000461426 GGT6Q6P531 493 aa40.8■■■■■ 4.12
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIF3BO15066 747 aa40.79■■■■■ 4.12
SIGMAR1-204ENST00000461426 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.75■■■■■ 4.11
SIGMAR1-204ENST00000461426 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.73■■■■■ 4.11
SIGMAR1-204ENST00000461426 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.73■■■■■ 4.11
SIGMAR1-204ENST00000461426 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.72■■■■■ 4.11
SIGMAR1-204ENST00000461426 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.72■■■■■ 4.11
SIGMAR1-204ENST00000461426 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.71■■■■■ 4.11
SIGMAR1-204ENST00000461426 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.71■■■■■ 4.11
SIGMAR1-204ENST00000461426 KIF15Q9NS87 1388 aa40.7■■■■■ 4.11
SIGMAR1-204ENST00000461426 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
SIGMAR1-204ENST00000461426 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.67■■■■■ 4.1
SIGMAR1-204ENST00000461426 NCOA1Q15788 1441 aa40.64■■■■■ 4.1
SIGMAR1-204ENST00000461426 ZMYM3Q14202 1370 aa40.61■■■■■ 4.09
SIGMAR1-204ENST00000461426 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
SIGMAR1-204ENST00000461426 ADGRL2O95490 1459 aa40.58■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms