RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461134.1

TTPAL-205, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 2

Gene TTPAL, Length 3,455 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-205ENST00000461134 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.26□□□□□ -0.61
TTPAL-205ENST00000461134 IQGAP2Q13576 1575 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPAL-205ENST00000461134 UACAQ9BZF9 1416 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPAL-205ENST00000461134 TSPOAP1O95153 1857 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPAL-205ENST00000461134 NUP160Q12769 1436 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPAL-205ENST00000461134 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPAL-205ENST00000461134 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.22□□□□□ -0.61
TTPAL-205ENST00000461134 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.22□□□□□ -0.61
TTPAL-205ENST00000461134 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TTPAL-205ENST00000461134 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTPAL-205ENST00000461134 ASXL2Q76L83 1435 aa11.21□□□□□ -0.62
TTPAL-205ENST00000461134 FMN1Q68DA7 1419 aa11.2□□□□□ -0.62
TTPAL-205ENST00000461134 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-205ENST00000461134 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-205ENST00000461134 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-205ENST00000461134 KIF3BO15066 747 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-205ENST00000461134 CD109Q6YHK3 1445 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-205ENST00000461134 CUL7Q14999 1698 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-205ENST00000461134 DISP1Q96F81 1524 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-205ENST00000461134 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 FOXD1Q16676 465 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.12□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 ATP10BO94823 1461 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.11□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 KIF21BO75037 1637 aa11.1□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.09□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 WDR97A6NE52 1622 aa11.09□□□□□ -0.63
TTPAL-205ENST00000461134 RGL3Q3MIN7 710 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.05□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.04□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 KIAA0556O60303 1618 aa11.04□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.04□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 ABCC2Q92887 1545 aa11.03□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.02□□□□□ -0.64
TTPAL-205ENST00000461134 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.01□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.01□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 PIP4K2BP78356 416 aa11□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 ZMYND15Q9H091 742 aa10.99□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.98□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 C14orf37Q86TY3 774 aa10.98□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.97□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.97□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
TTPAL-205ENST00000461134 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 FANCAO15360 1455 aa10.96□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.96□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 NCOA2Q15596 1464 aa10.95□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 ADGRL1O94910 1474 aa10.94□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 NEFMP07197 916 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 AKNAQ7Z591 1439 aa10.93□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 NUTM2FA1L443 756 aa10.92□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.91□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.91□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.91□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 KDM6BO15054 1643 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 NUP155O75694 1391 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 PKD2Q13563 968 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.9□□□□□ -0.66
TTPAL-205ENST00000461134 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.89□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 HECW1Q76N89 1606 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.88□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 STK26Q9P289 416 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 KDM5BQ9UGL1 1544 aa10.87□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.86□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 KIF15Q9NS87 1388 aa10.86□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.85□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
TTPAL-205ENST00000461134 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms