RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.55■■■□□ 2.8
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RPUSD3-210ENST00000460909 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.51■■■□□ 2.79
RPUSD3-210ENST00000460909 RAPGEF3O95398 923 aa32.5■■■□□ 2.79
RPUSD3-210ENST00000460909 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
RPUSD3-210ENST00000460909 ADGRL1O94910 1474 aa32.49■■■□□ 2.79
RPUSD3-210ENST00000460909 RICTORQ6R327 1708 aa32.48■■■□□ 2.79
RPUSD3-210ENST00000460909 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
RPUSD3-210ENST00000460909 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
RPUSD3-210ENST00000460909 NCOA2Q15596 1464 aa32.46■■■□□ 2.79
RPUSD3-210ENST00000460909 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.45■■■□□ 2.79
RPUSD3-210ENST00000460909 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.45■■■□□ 2.79
RPUSD3-210ENST00000460909 APLP2Q06481 763 aa32.41■■■□□ 2.78
RPUSD3-210ENST00000460909 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.39■■■□□ 2.78
RPUSD3-210ENST00000460909 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.38■■■□□ 2.77
RPUSD3-210ENST00000460909 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.38■■■□□ 2.77
RPUSD3-210ENST00000460909 ABCC1P33527 1531 aa32.38■■■□□ 2.77
RPUSD3-210ENST00000460909 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.36■■■□□ 2.77
RPUSD3-210ENST00000460909 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.36■■■□□ 2.77
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.29■■■□□ 2.76
RPUSD3-210ENST00000460909 KDM5CP41229 1560 aa32.28■■■□□ 2.76
RPUSD3-210ENST00000460909 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.27■■■□□ 2.76
RPUSD3-210ENST00000460909 AFAP1Q8N556 730 aa32.27■■■□□ 2.76
RPUSD3-210ENST00000460909 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.26■■■□□ 2.76
RPUSD3-210ENST00000460909 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.26■■■□□ 2.75
RPUSD3-210ENST00000460909 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.26■■■□□ 2.75
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
RPUSD3-210ENST00000460909 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.25■■■□□ 2.75
RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.24■■■□□ 2.75
RPUSD3-210ENST00000460909 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.22■■■□□ 2.75
RPUSD3-210ENST00000460909 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.21■■■□□ 2.75
RPUSD3-210ENST00000460909 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.21■■■□□ 2.75
RPUSD3-210ENST00000460909 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.2■■■□□ 2.75
RPUSD3-210ENST00000460909 MBD5Q9P267 1494 aa32.17■■■□□ 2.74
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RPUSD3-210ENST00000460909 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.16■■■□□ 2.74
RPUSD3-210ENST00000460909 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.16■■■□□ 2.74
RPUSD3-210ENST00000460909 MIA2Q96PC5 1412 aa32.15■■■□□ 2.74
RPUSD3-210ENST00000460909 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.11■■■□□ 2.73
RPUSD3-210ENST00000460909 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.11■■■□□ 2.73
RPUSD3-210ENST00000460909 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.08■■■□□ 2.73
RPUSD3-210ENST00000460909 ATP10AO60312 1499 aa32.08■■■□□ 2.73
RPUSD3-210ENST00000460909 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.07■■■□□ 2.72
RPUSD3-210ENST00000460909 ABCA6Q8N139 1617 aa32.07■■■□□ 2.72
RPUSD3-210ENST00000460909 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
RPUSD3-210ENST00000460909 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.04■■■□□ 2.72
RPUSD3-210ENST00000460909 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.03■■■□□ 2.72
RPUSD3-210ENST00000460909 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.02■■■□□ 2.72
RPUSD3-210ENST00000460909 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.02■■■□□ 2.72
RPUSD3-210ENST00000460909 ATP7AQ04656 1500 aa32.01■■■□□ 2.72
RPUSD3-210ENST00000460909 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.01■■■□□ 2.72
RPUSD3-210ENST00000460909 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.01■■■□□ 2.71
RPUSD3-210ENST00000460909 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.01■■■□□ 2.71
RPUSD3-210ENST00000460909 REREQ9P2R6 1566 aa31.99■■■□□ 2.71
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RPUSD3-210ENST00000460909 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
RPUSD3-210ENST00000460909 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.97■■■□□ 2.71
RPUSD3-210ENST00000460909 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.96■■■□□ 2.71
RPUSD3-210ENST00000460909 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
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RPUSD3-210ENST00000460909 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.88■■■□□ 2.69
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RPUSD3-210ENST00000460909 TSPY10P0CW01 314 aa31.85■■■□□ 2.69
RPUSD3-210ENST00000460909 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
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RPUSD3-210ENST00000460909 A2MP01023 1474 aa31.84■■■□□ 2.69
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RPUSD3-210ENST00000460909 DAPK1P53355 1430 aa31.81■■■□□ 2.68
RPUSD3-210ENST00000460909 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.78■■■□□ 2.68
RPUSD3-210ENST00000460909 MLECQ14165 292 aa31.78■■■□□ 2.68
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RPUSD3-210ENST00000460909 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.61■■■□□ 2.65
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RPUSD3-210ENST00000460909 KIF15Q9NS87 1388 aa31.6■■■□□ 2.65
RPUSD3-210ENST00000460909 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.59■■■□□ 2.65
RPUSD3-210ENST00000460909 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.58■■■□□ 2.65
RPUSD3-210ENST00000460909 KIF3BO15066 747 aa31.58■■■□□ 2.65
RPUSD3-210ENST00000460909 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
RPUSD3-210ENST00000460909 GGT6Q6P531 493 aa31.56■■■□□ 2.64
RPUSD3-210ENST00000460909 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.53■■■□□ 2.64
RPUSD3-210ENST00000460909 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
RPUSD3-210ENST00000460909 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.52■■■□□ 2.64
RPUSD3-210ENST00000460909 ERBINQ96RT1 1412 aa31.51■■■□□ 2.64
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