RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458069.5

IRF1-205, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene IRF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-205ENST00000458069 TIAM1Q13009 1591 aa27.26■■□□□ 1.95
IRF1-205ENST00000458069 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.26■■□□□ 1.95
IRF1-205ENST00000458069 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
IRF1-205ENST00000458069 PREX2Q70Z35 1606 aa27.22■■□□□ 1.95
IRF1-205ENST00000458069 MAP3K1Q13233 1512 aa27.21■■□□□ 1.95
IRF1-205ENST00000458069 APLP2Q06481 763 aa27.21■■□□□ 1.95
IRF1-205ENST00000458069 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.21■■□□□ 1.95
IRF1-205ENST00000458069 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.21■■□□□ 1.95
IRF1-205ENST00000458069 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.2■■□□□ 1.94
IRF1-205ENST00000458069 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
IRF1-205ENST00000458069 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.18■■□□□ 1.94
IRF1-205ENST00000458069 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.17■■□□□ 1.94
IRF1-205ENST00000458069 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.17■■□□□ 1.94
IRF1-205ENST00000458069 RICTORQ6R327 1708 aa27.15■■□□□ 1.94
IRF1-205ENST00000458069 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
IRF1-205ENST00000458069 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
IRF1-205ENST00000458069 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.13■■□□□ 1.93
IRF1-205ENST00000458069 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
IRF1-205ENST00000458069 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
IRF1-205ENST00000458069 NCOA2Q15596 1464 aa27.11■■□□□ 1.93
IRF1-205ENST00000458069 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.08■■□□□ 1.93
IRF1-205ENST00000458069 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.08■■□□□ 1.93
IRF1-205ENST00000458069 ABCC1P33527 1531 aa27.06■■□□□ 1.92
IRF1-205ENST00000458069 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.06■■□□□ 1.92
IRF1-205ENST00000458069 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.05■■□□□ 1.92
IRF1-205ENST00000458069 AFAP1Q8N556 730 aa27.04■■□□□ 1.92
IRF1-205ENST00000458069 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.04■■□□□ 1.92
IRF1-205ENST00000458069 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.02■■□□□ 1.92
IRF1-205ENST00000458069 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.02■■□□□ 1.92
IRF1-205ENST00000458069 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27■■□□□ 1.91
IRF1-205ENST00000458069 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27■■□□□ 1.91
IRF1-205ENST00000458069 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.99■■□□□ 1.91
IRF1-205ENST00000458069 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.99■■□□□ 1.91
IRF1-205ENST00000458069 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
IRF1-205ENST00000458069 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.99■■□□□ 1.91
IRF1-205ENST00000458069 KDM5CP41229 1560 aa26.98■■□□□ 1.91
IRF1-205ENST00000458069 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.98■■□□□ 1.91
IRF1-205ENST00000458069 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.98■■□□□ 1.91
IRF1-205ENST00000458069 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
IRF1-205ENST00000458069 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
IRF1-205ENST00000458069 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.93■■□□□ 1.9
IRF1-205ENST00000458069 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.9■■□□□ 1.9
IRF1-205ENST00000458069 ATP10AO60312 1499 aa26.9■■□□□ 1.9
IRF1-205ENST00000458069 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.89■■□□□ 1.9
IRF1-205ENST00000458069 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
IRF1-205ENST00000458069 MIA2Q96PC5 1412 aa26.87■■□□□ 1.89
IRF1-205ENST00000458069 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.86■■□□□ 1.89
IRF1-205ENST00000458069 MBD5Q9P267 1494 aa26.86■■□□□ 1.89
IRF1-205ENST00000458069 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.84■■□□□ 1.89
IRF1-205ENST00000458069 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.83■■□□□ 1.89
IRF1-205ENST00000458069 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.82■■□□□ 1.88
IRF1-205ENST00000458069 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.81■■□□□ 1.88
IRF1-205ENST00000458069 ABCA6Q8N139 1617 aa26.8■■□□□ 1.88
IRF1-205ENST00000458069 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.8■■□□□ 1.88
IRF1-205ENST00000458069 ATP7AQ04656 1500 aa26.79■■□□□ 1.88
IRF1-205ENST00000458069 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.78■■□□□ 1.88
IRF1-205ENST00000458069 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.76■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.76■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 REREQ9P2R6 1566 aa26.75■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.74■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.74■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 TSPY4P0CV99 314 aa26.74■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 TSPY10P0CW01 314 aa26.74■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 MLECQ14165 292 aa26.73■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 PTPRMP28827 1452 aa26.73■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.72■■□□□ 1.87
IRF1-205ENST00000458069 MADDQ8WXG6 1647 aa26.7■■□□□ 1.86
IRF1-205ENST00000458069 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
IRF1-205ENST00000458069 AGLP35573 1532 aa26.69■■□□□ 1.86
IRF1-205ENST00000458069 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
IRF1-205ENST00000458069 A2MP01023 1474 aa26.67■■□□□ 1.86
IRF1-205ENST00000458069 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.64■■□□□ 1.86
IRF1-205ENST00000458069 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
IRF1-205ENST00000458069 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
IRF1-205ENST00000458069 FBXO41Q8TF61 875 aa26.61■■□□□ 1.85
IRF1-205ENST00000458069 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.61■■□□□ 1.85
IRF1-205ENST00000458069 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
IRF1-205ENST00000458069 PLXNC1O60486 1568 aa26.6■■□□□ 1.85
IRF1-205ENST00000458069 ABCC5O15440 1437 aa26.59■■□□□ 1.85
IRF1-205ENST00000458069 DAPK1P53355 1430 aa26.58■■□□□ 1.85
IRF1-205ENST00000458069 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.58■■□□□ 1.85
IRF1-205ENST00000458069 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
IRF1-205ENST00000458069 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.56■■□□□ 1.84
IRF1-205ENST00000458069 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.56■■□□□ 1.84
IRF1-205ENST00000458069 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
IRF1-205ENST00000458069 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.54■■□□□ 1.84
IRF1-205ENST00000458069 GGT6Q6P531 493 aa26.51■■□□□ 1.83
IRF1-205ENST00000458069 KIF3BO15066 747 aa26.5■■□□□ 1.83
IRF1-205ENST00000458069 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.5■■□□□ 1.83
IRF1-205ENST00000458069 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.48■■□□□ 1.83
IRF1-205ENST00000458069 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.48■■□□□ 1.83
IRF1-205ENST00000458069 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.47■■□□□ 1.83
IRF1-205ENST00000458069 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.47■■□□□ 1.83
IRF1-205ENST00000458069 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.46■■□□□ 1.83
IRF1-205ENST00000458069 KIF15Q9NS87 1388 aa26.46■■□□□ 1.83
IRF1-205ENST00000458069 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.44■■□□□ 1.82
IRF1-205ENST00000458069 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
IRF1-205ENST00000458069 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
IRF1-205ENST00000458069 NCOA1Q15788 1441 aa26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms