RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 AKNAQ7Z591 1439 aa17.3■□□□□ 0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 RAPGEF3O95398 923 aa17.3■□□□□ 0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 NEO1Q92859 1461 aa17.3■□□□□ 0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 APLP2Q06481 763 aa17.29■□□□□ 0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
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RPRD1B-202ENST00000449186 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.27■□□□□ 0.36
RPRD1B-202ENST00000449186 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.27■□□□□ 0.36
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RPRD1B-202ENST00000449186 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.25■□□□□ 0.35
RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.25■□□□□ 0.35
RPRD1B-202ENST00000449186 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.24■□□□□ 0.35
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RPRD1B-202ENST00000449186 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.2■□□□□ 0.34
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RPRD1B-202ENST00000449186 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.18■□□□□ 0.34
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RPRD1B-202ENST00000449186 FGD6Q6ZV73 1430 aa17.08■□□□□ 0.32
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RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.07■□□□□ 0.32
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RPRD1B-202ENST00000449186 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17.06■□□□□ 0.32
RPRD1B-202ENST00000449186 HECW2Q9P2P5 1572 aa17.06■□□□□ 0.32
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RPRD1B-202ENST00000449186 MLH3Q9UHC1 1453 aa17.03■□□□□ 0.32
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RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.01■□□□□ 0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.01■□□□□ 0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17■□□□□ 0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP10AO60312 1499 aa16.99■□□□□ 0.31
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCC5O15440 1437 aa16.99■□□□□ 0.31
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RPRD1B-202ENST00000449186 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 DAPK1P53355 1430 aa16.96■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.96■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.95■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 MLECQ14165 292 aa16.95■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.95■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.94■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 PTPRKQ15262 1439 aa16.94■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 TSPY4P0CV99 314 aa16.93■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 TSPY10P0CW01 314 aa16.93■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 ITGAEP38570 1179 aa16.93■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.93■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.92■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.91■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.91■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 A2MP01023 1474 aa16.91■□□□□ 0.3
RPRD1B-202ENST00000449186 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
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RPRD1B-202ENST00000449186 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.88■□□□□ 0.29
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RPRD1B-202ENST00000449186 MADDQ8WXG6 1647 aa16.88■□□□□ 0.29
RPRD1B-202ENST00000449186 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.87■□□□□ 0.29
RPRD1B-202ENST00000449186 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RPRD1B-202ENST00000449186 AGLP35573 1532 aa16.86■□□□□ 0.29
RPRD1B-202ENST00000449186 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RPRD1B-202ENST00000449186 NCOA1Q15788 1441 aa16.83■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.83■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF15Q9NS87 1388 aa16.83■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF3BO15066 747 aa16.82■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.81■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 GGT6Q6P531 493 aa16.81■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.81■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 ADGRL2O95490 1459 aa16.8■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.8■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16.79■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
RPRD1B-202ENST00000449186 PTPRMP28827 1452 aa16.78■□□□□ 0.28
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