RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448450.5

HTATSF1-203, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene HTATSF1, Length 1,014 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-203ENST00000448450 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.32■■■■■ 4.04
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HTATSF1-203ENST00000448450 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.25■■■■■ 4.03
HTATSF1-203ENST00000448450 FBXO41Q8TF61 875 aa40.25■■■■■ 4.03
HTATSF1-203ENST00000448450 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.23■■■■■ 4.03
HTATSF1-203ENST00000448450 CEP162Q5TB80 1403 aa40.22■■■■■ 4.03
HTATSF1-203ENST00000448450 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.22■■■■■ 4.03
HTATSF1-203ENST00000448450 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.2■■■■■ 4.03
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HTATSF1-203ENST00000448450 PREX2Q70Z35 1606 aa39.83■■■■□ 3.97
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HTATSF1-203ENST00000448450 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.72■■■■□ 3.95
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HTATSF1-203ENST00000448450 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.68■■■■□ 3.94
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HTATSF1-203ENST00000448450 MAP3K1Q13233 1512 aa39.33■■■■□ 3.89
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HTATSF1-203ENST00000448450 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
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HTATSF1-203ENST00000448450 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.04■■■■□ 3.84
HTATSF1-203ENST00000448450 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.03■■■■□ 3.84
HTATSF1-203ENST00000448450 PLA2R1Q13018 1463 aa39.03■■■■□ 3.84
HTATSF1-203ENST00000448450 MBD5Q9P267 1494 aa39.02■■■■□ 3.84
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HTATSF1-203ENST00000448450 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.99■■■■□ 3.83
HTATSF1-203ENST00000448450 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.99■■■■□ 3.83
HTATSF1-203ENST00000448450 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.98■■■■□ 3.83
HTATSF1-203ENST00000448450 PKD2Q13563 968 aa38.95■■■■□ 3.83
HTATSF1-203ENST00000448450 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
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