RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446477.6

PRRT4-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRRT4, Length 3,544 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-201ENST00000446477 IQGAP2Q13576 1575 aa22.87■■□□□ 1.25
PRRT4-201ENST00000446477 SLC24A1O60721 1099 aa22.86■■□□□ 1.25
PRRT4-201ENST00000446477 IL27Q8NEV9 243 aa22.86■■□□□ 1.25
PRRT4-201ENST00000446477 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PRRT4-201ENST00000446477 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.85■■□□□ 1.25
PRRT4-201ENST00000446477 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.84■■□□□ 1.25
PRRT4-201ENST00000446477 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PRRT4-201ENST00000446477 SYNJ2O15056 1496 aa22.83■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.82■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 PTPRKQ15262 1439 aa22.82■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.82■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 NUP155O75694 1391 aa22.81■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.8■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.79■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.78■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 CUL7Q14999 1698 aa22.77■■□□□ 1.24
PRRT4-201ENST00000446477 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PRRT4-201ENST00000446477 KIF3BO15066 747 aa22.75■■□□□ 1.23
PRRT4-201ENST00000446477 ANP32CO43423 234 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT4-201ENST00000446477 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PRRT4-201ENST00000446477 PLEKHG5O94827 1062 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT4-201ENST00000446477 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT4-201ENST00000446477 ARHGEF11O15085 1522 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT4-201ENST00000446477 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT4-201ENST00000446477 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT4-201ENST00000446477 WDR62O43379 1518 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT4-201ENST00000446477 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT4-201ENST00000446477 RAPGEF3O95398 923 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT4-201ENST00000446477 ADAMTS12P58397 1594 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT4-201ENST00000446477 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PRRT4-201ENST00000446477 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PRRT4-201ENST00000446477 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
PRRT4-201ENST00000446477 DISP1Q96F81 1524 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 PBRM1Q86U86 1689 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT4-201ENST00000446477 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 CEP170Q5SW79 1584 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 NAIPQ13075 1403 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.56■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 ATP10BO94823 1461 aa22.55■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 KIF15Q9NS87 1388 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 UACAQ9BZF9 1416 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRT4-201ENST00000446477 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PRRT4-201ENST00000446477 ABCC5O15440 1437 aa22.47■■□□□ 1.19
PRRT4-201ENST00000446477 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.47■■□□□ 1.19
PRRT4-201ENST00000446477 HECW1Q76N89 1606 aa22.47■■□□□ 1.19
PRRT4-201ENST00000446477 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.46■■□□□ 1.19
PRRT4-201ENST00000446477 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 DAPK1P53355 1430 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.44■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 STK26Q9P289 416 aa22.44■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 KIAA0556O60303 1618 aa22.44■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 MRS2Q9HD23 443 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.42■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 WDR97A6NE52 1622 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 NUP160Q12769 1436 aa22.4■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 HFM1A2PYH4 1435 aa22.4■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PRRT4-201ENST00000446477 TMC1Q8TDI8 760 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRT4-201ENST00000446477 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PRRT4-201ENST00000446477 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT4-201ENST00000446477 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT4-201ENST00000446477 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRT4-201ENST00000446477 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.36■■□□□ 1.17
PRRT4-201ENST00000446477 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRT4-201ENST00000446477 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRT4-201ENST00000446477 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PRRT4-201ENST00000446477 SAMD9Q5K651 1589 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRT4-201ENST00000446477 KIF14Q15058 1648 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRT4-201ENST00000446477 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PRRT4-201ENST00000446477 MAPKBP1O60336 1514 aa22.3■■□□□ 1.16
PRRT4-201ENST00000446477 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRRT4-201ENST00000446477 NUTM2FA1L443 756 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms