RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445402.5

PQLC3-205, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene PQLC3, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-205ENST00000445402 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.12■■■■□ 3.53
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PQLC3-205ENST00000445402 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.1■■■■□ 3.53
PQLC3-205ENST00000445402 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.1■■■■□ 3.53
PQLC3-205ENST00000445402 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.1■■■■□ 3.53
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PQLC3-205ENST00000445402 TIAM1Q13009 1591 aa36.95■■■■□ 3.51
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PQLC3-205ENST00000445402 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.86■■■■□ 3.49
PQLC3-205ENST00000445402 ATP10AO60312 1499 aa36.82■■■■□ 3.48
PQLC3-205ENST00000445402 NCOA2Q15596 1464 aa36.82■■■■□ 3.48
PQLC3-205ENST00000445402 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.81■■■■□ 3.48
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PQLC3-205ENST00000445402 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.81■■■■□ 3.48
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PQLC3-205ENST00000445402 MAP3K1Q13233 1512 aa36.8■■■■□ 3.48
PQLC3-205ENST00000445402 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.79■■■■□ 3.48
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PQLC3-205ENST00000445402 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.76■■■■□ 3.48
PQLC3-205ENST00000445402 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
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PQLC3-205ENST00000445402 MADDQ8WXG6 1647 aa36.7■■■■□ 3.47
PQLC3-205ENST00000445402 PTPRMP28827 1452 aa36.68■■■■□ 3.46
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PQLC3-205ENST00000445402 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.42■■■■□ 3.42
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PQLC3-205ENST00000445402 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.4■■■■□ 3.42
PQLC3-205ENST00000445402 PLXNC1O60486 1568 aa36.38■■■■□ 3.41
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PQLC3-205ENST00000445402 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.08■■■■□ 3.37
PQLC3-205ENST00000445402 ZMYM3Q14202 1370 aa36.08■■■■□ 3.37
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PQLC3-205ENST00000445402 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
PQLC3-205ENST00000445402 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.04■■■■□ 3.36
PQLC3-205ENST00000445402 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36■■■■□ 3.35
PQLC3-205ENST00000445402 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
PQLC3-205ENST00000445402 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
PQLC3-205ENST00000445402 KIF15Q9NS87 1388 aa35.97■■■■□ 3.35
PQLC3-205ENST00000445402 NPATQ14207 1427 aa35.97■■■■□ 3.35
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