RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445150.3

SRP19-202, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP19, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-202ENST00000445150 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
SRP19-202ENST00000445150 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SRP19-202ENST00000445150 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SRP19-202ENST00000445150 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SRP19-202ENST00000445150 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SRP19-202ENST00000445150 PREX2Q70Z35 1606 aa27.4■■□□□ 1.98
SRP19-202ENST00000445150 ADGRL1O94910 1474 aa27.39■■□□□ 1.98
SRP19-202ENST00000445150 NCOA2Q15596 1464 aa27.38■■□□□ 1.97
SRP19-202ENST00000445150 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.38■■□□□ 1.97
SRP19-202ENST00000445150 RAPGEF3O95398 923 aa27.36■■□□□ 1.97
SRP19-202ENST00000445150 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
SRP19-202ENST00000445150 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.35■■□□□ 1.97
SRP19-202ENST00000445150 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.35■■□□□ 1.97
SRP19-202ENST00000445150 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.32■■□□□ 1.96
SRP19-202ENST00000445150 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.32■■□□□ 1.96
SRP19-202ENST00000445150 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.27■■□□□ 1.96
SRP19-202ENST00000445150 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.26■■□□□ 1.95
SRP19-202ENST00000445150 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.26■■□□□ 1.95
SRP19-202ENST00000445150 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.24■■□□□ 1.95
SRP19-202ENST00000445150 ABCC1P33527 1531 aa27.23■■□□□ 1.95
SRP19-202ENST00000445150 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.23■■□□□ 1.95
SRP19-202ENST00000445150 MIA2Q96PC5 1412 aa27.23■■□□□ 1.95
SRP19-202ENST00000445150 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.22■■□□□ 1.95
SRP19-202ENST00000445150 RICTORQ6R327 1708 aa27.21■■□□□ 1.95
SRP19-202ENST00000445150 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.21■■□□□ 1.95
SRP19-202ENST00000445150 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.94
SRP19-202ENST00000445150 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.2■■□□□ 1.94
SRP19-202ENST00000445150 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.2■■□□□ 1.94
SRP19-202ENST00000445150 AFAP1Q8N556 730 aa27.2■■□□□ 1.94
SRP19-202ENST00000445150 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.2■■□□□ 1.94
SRP19-202ENST00000445150 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.16■■□□□ 1.94
SRP19-202ENST00000445150 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.16■■□□□ 1.94
SRP19-202ENST00000445150 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
SRP19-202ENST00000445150 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.14■■□□□ 1.94
SRP19-202ENST00000445150 KDM5CP41229 1560 aa27.13■■□□□ 1.93
SRP19-202ENST00000445150 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.12■■□□□ 1.93
SRP19-202ENST00000445150 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SRP19-202ENST00000445150 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.12■■□□□ 1.93
SRP19-202ENST00000445150 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.12■■□□□ 1.93
SRP19-202ENST00000445150 TSPY4P0CV99 314 aa27.09■■□□□ 1.93
SRP19-202ENST00000445150 TSPY10P0CW01 314 aa27.09■■□□□ 1.93
SRP19-202ENST00000445150 MBD5Q9P267 1494 aa27.08■■□□□ 1.93
SRP19-202ENST00000445150 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.08■■□□□ 1.93
SRP19-202ENST00000445150 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.07■■□□□ 1.92
SRP19-202ENST00000445150 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.07■■□□□ 1.92
SRP19-202ENST00000445150 ATP10AO60312 1499 aa27.06■■□□□ 1.92
SRP19-202ENST00000445150 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.05■■□□□ 1.92
SRP19-202ENST00000445150 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.05■■□□□ 1.92
SRP19-202ENST00000445150 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SRP19-202ENST00000445150 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.02■■□□□ 1.92
SRP19-202ENST00000445150 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
SRP19-202ENST00000445150 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.01■■□□□ 1.92
SRP19-202ENST00000445150 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.01■■□□□ 1.91
SRP19-202ENST00000445150 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27■■□□□ 1.91
SRP19-202ENST00000445150 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
SRP19-202ENST00000445150 ATP7AQ04656 1500 aa26.96■■□□□ 1.91
SRP19-202ENST00000445150 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SRP19-202ENST00000445150 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.94■■□□□ 1.9
SRP19-202ENST00000445150 REREQ9P2R6 1566 aa26.92■■□□□ 1.9
SRP19-202ENST00000445150 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.92■■□□□ 1.9
SRP19-202ENST00000445150 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SRP19-202ENST00000445150 ABCA6Q8N139 1617 aa26.9■■□□□ 1.9
SRP19-202ENST00000445150 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.89■■□□□ 1.9
SRP19-202ENST00000445150 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SRP19-202ENST00000445150 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.891e-6■■■■■ 32.9
SRP19-202ENST00000445150 A2MP01023 1474 aa26.87■■□□□ 1.89
SRP19-202ENST00000445150 ABCC5O15440 1437 aa26.86■■□□□ 1.89
SRP19-202ENST00000445150 DAPK1P53355 1430 aa26.86■■□□□ 1.89
SRP19-202ENST00000445150 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.86■■□□□ 1.89
SRP19-202ENST00000445150 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.86■■□□□ 1.89
SRP19-202ENST00000445150 AGLP35573 1532 aa26.85■■□□□ 1.89
SRP19-202ENST00000445150 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SRP19-202ENST00000445150 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SRP19-202ENST00000445150 MLECQ14165 292 aa26.82■■□□□ 1.88
SRP19-202ENST00000445150 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.82■■□□□ 1.88
SRP19-202ENST00000445150 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.8■■□□□ 1.88
SRP19-202ENST00000445150 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SRP19-202ENST00000445150 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.79■■□□□ 1.88
SRP19-202ENST00000445150 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SRP19-202ENST00000445150 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.76■■□□□ 1.87
SRP19-202ENST00000445150 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.75■■□□□ 1.87
SRP19-202ENST00000445150 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.75■■□□□ 1.87
SRP19-202ENST00000445150 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.74■■□□□ 1.87
SRP19-202ENST00000445150 PLXNC1O60486 1568 aa26.74■■□□□ 1.87
SRP19-202ENST00000445150 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.73■■□□□ 1.87
SRP19-202ENST00000445150 KIF15Q9NS87 1388 aa26.72■■□□□ 1.87
SRP19-202ENST00000445150 KIF3BO15066 747 aa26.72■■□□□ 1.87
SRP19-202ENST00000445150 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.71■■□□□ 1.87
SRP19-202ENST00000445150 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.7■■□□□ 1.87
SRP19-202ENST00000445150 GGT6Q6P531 493 aa26.7■■□□□ 1.86
SRP19-202ENST00000445150 ADGRL2O95490 1459 aa26.69■■□□□ 1.86
SRP19-202ENST00000445150 NCOA1Q15788 1441 aa26.69■■□□□ 1.86
SRP19-202ENST00000445150 ITGAEP38570 1179 aa26.68■■□□□ 1.86
SRP19-202ENST00000445150 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.66■■□□□ 1.86
SRP19-202ENST00000445150 MADDQ8WXG6 1647 aa26.66■■□□□ 1.86
SRP19-202ENST00000445150 ROCK1Q13464 1354 aa26.66■■□□□ 1.86
SRP19-202ENST00000445150 ERBINQ96RT1 1412 aa26.65■■□□□ 1.86
SRP19-202ENST00000445150 PTPRMP28827 1452 aa26.64■■□□□ 1.86
SRP19-202ENST00000445150 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SRP19-202ENST00000445150 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.8 ms