RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437002.5

MMS19-208, Transcript of MMS19 homolog, cytosolic iron-sulfur assembly component, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene MMS19, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MMS19-208	ENST00000437002	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		29.68	■■■□□ 2.34
MMS19-208	ENST00000437002	KIF14	Q15058	1648 aa		29.67	■■■□□ 2.34
MMS19-208	ENST00000437002	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	29.66	■■■□□ 2.34
MMS19-208	ENST00000437002	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		29.65	■■■□□ 2.34
MMS19-208	ENST00000437002	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		29.62	■■■□□ 2.33
MMS19-208	ENST00000437002	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		29.59	■■■□□ 2.33
MMS19-208	ENST00000437002	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	29.59	■■■□□ 2.33
MMS19-208	ENST00000437002	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		29.56	■■■□□ 2.32
MMS19-208	ENST00000437002	MLEC	Q14165	292 aa		29.55	■■■□□ 2.32
MMS19-208	ENST00000437002	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	29.54	■■■□□ 2.32
MMS19-208	ENST00000437002	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		29.53	■■■□□ 2.32
MMS19-208	ENST00000437002	ATP10A	O60312	1499 aa		29.52	■■■□□ 2.32
MMS19-208	ENST00000437002	HSPA2	P54652	639 aa		29.5	■■■□□ 2.31
MMS19-208	ENST00000437002	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		29.49	■■■□□ 2.31
MMS19-208	ENST00000437002	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.49	■■■□□ 2.31
MMS19-208	ENST00000437002	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		29.49	■■■□□ 2.31
MMS19-208	ENST00000437002	AFAP1	Q8N556	730 aa		29.48	■■■□□ 2.31
MMS19-208	ENST00000437002	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		29.47	■■■□□ 2.31
MMS19-208	ENST00000437002	KDM5C	P41229	1560 aa		29.47	■■■□□ 2.31
MMS19-208	ENST00000437002	CLIP1	P30622	1438 aa		29.46	■■■□□ 2.31
MMS19-208	ENST00000437002	FBXO41	Q8TF61	875 aa		29.46	■■■□□ 2.31
MMS19-208	ENST00000437002	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		29.46	■■■□□ 2.31
MMS19-208	ENST00000437002	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		29.45	■■■□□ 2.3
MMS19-208	ENST00000437002	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		29.43	■■■□□ 2.3
MMS19-208	ENST00000437002	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		29.39	■■■□□ 2.29
MMS19-208	ENST00000437002	PREX2	Q70Z35	1606 aa		29.38	■■■□□ 2.29
MMS19-208	ENST00000437002	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		29.37	■■■□□ 2.29
MMS19-208	ENST00000437002	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		29.36	■■■□□ 2.29
MMS19-208	ENST00000437002	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	29.36	■■■□□ 2.29
MMS19-208	ENST00000437002	ABCC1	P33527	1531 aa		29.35	■■■□□ 2.29
MMS19-208	ENST00000437002	ABCA6	Q8N139	1617 aa		29.34	■■■□□ 2.29
MMS19-208	ENST00000437002	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		29.33	■■■□□ 2.29
MMS19-208	ENST00000437002	RERE	Q9P2R6	1566 aa		29.31	■■■□□ 2.28
MMS19-208	ENST00000437002	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.3	■■■□□ 2.28
MMS19-208	ENST00000437002	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		29.29	■■■□□ 2.28
MMS19-208	ENST00000437002	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		29.28	■■■□□ 2.28
MMS19-208	ENST00000437002	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		29.27	■■■□□ 2.28
MMS19-208	ENST00000437002	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		29.25	■■■□□ 2.27
MMS19-208	ENST00000437002	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		29.23	■■■□□ 2.27
MMS19-208	ENST00000437002	AGL	P35573	1532 aa		29.22	■■■□□ 2.27
MMS19-208	ENST00000437002	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		29.2	■■■□□ 2.26
MMS19-208	ENST00000437002	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
MMS19-208	ENST00000437002	C3	P01024	1663 aa		29.16	■■■□□ 2.26
MMS19-208	ENST00000437002	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		29.15	■■■□□ 2.26
MMS19-208	ENST00000437002	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
MMS19-208	ENST00000437002	STRC	Q7RTU9	1775 aa		29.15	■■■□□ 2.26
MMS19-208	ENST00000437002	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		29.13	■■■□□ 2.25
MMS19-208	ENST00000437002	CERK	Q8TCT0	537 aa		29.13	■■■□□ 2.25
MMS19-208	ENST00000437002	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	29.1	■■■□□ 2.25
MMS19-208	ENST00000437002	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
MMS19-208	ENST00000437002	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
MMS19-208	ENST00000437002	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		29.04	■■■□□ 2.24
MMS19-208	ENST00000437002	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
MMS19-208	ENST00000437002	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
MMS19-208	ENST00000437002	ATP7A	Q04656	1500 aa		29.02	■■■□□ 2.24
MMS19-208	ENST00000437002	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		29.01	■■■□□ 2.24
MMS19-208	ENST00000437002	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		29.01	■■■□□ 2.23
MMS19-208	ENST00000437002	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
MMS19-208	ENST00000437002	PLXNC1	O60486	1568 aa		29	■■■□□ 2.23
MMS19-208	ENST00000437002	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		29	■■■□□ 2.23
MMS19-208	ENST00000437002	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
MMS19-208	ENST00000437002	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.97	■■■□□ 2.23
MMS19-208	ENST00000437002	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
MMS19-208	ENST00000437002	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.96	■■■□□ 2.23
MMS19-208	ENST00000437002	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.96	■■■□□ 2.23
MMS19-208	ENST00000437002	A2M	P01023	1474 aa		28.95	■■■□□ 2.22
MMS19-208	ENST00000437002	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.95	■■■□□ 2.22
MMS19-208	ENST00000437002	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MMS19-208	ENST00000437002	PTPRT	O14522	1441 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MMS19-208	ENST00000437002	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MMS19-208	ENST00000437002	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MMS19-208	ENST00000437002	NPAT	Q14207	1427 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MMS19-208	ENST00000437002	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MMS19-208	ENST00000437002	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MMS19-208	ENST00000437002	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
MMS19-208	ENST00000437002	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MMS19-208	ENST00000437002	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MMS19-208	ENST00000437002	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MMS19-208	ENST00000437002	GGT6	Q6P531	493 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MMS19-208	ENST00000437002	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MMS19-208	ENST00000437002	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MMS19-208	ENST00000437002	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MMS19-208	ENST00000437002	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MMS19-208	ENST00000437002	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MMS19-208	ENST00000437002	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
MMS19-208	ENST00000437002	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
MMS19-208	ENST00000437002	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MMS19-208	ENST00000437002	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
MMS19-208	ENST00000437002	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MMS19-208	ENST00000437002	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MMS19-208	ENST00000437002	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MMS19-208	ENST00000437002	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
MMS19-208	ENST00000437002	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
MMS19-208	ENST00000437002	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MMS19-208	ENST00000437002	KIF3B	O15066	747 aa		28.64	■■■□□ 2.18
MMS19-208	ENST00000437002	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.63	■■■□□ 2.17
MMS19-208	ENST00000437002	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
MMS19-208	ENST00000437002	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MMS19-208	ENST00000437002	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
MMS19-208	ENST00000437002	PKD2	Q13563	968 aa		28.61	■■■□□ 2.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.5 ms