RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429990.1

NPIPB15-201, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NPIPB15, Length 1,428 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15-201ENST00000429990 ARID3CA6NKF2 412 aa11.45□□□□□ -0.58
NPIPB15-201ENST00000429990 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.44□□□□□ -0.58
NPIPB15-201ENST00000429990 CEP162Q5TB80 1403 aa11.43□□□□□ -0.58
NPIPB15-201ENST00000429990 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NPIPB15-201ENST00000429990 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
NPIPB15-201ENST00000429990 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NPIPB15-201ENST00000429990 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.39□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 NEO1Q92859 1461 aa11.39□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 KIF14Q15058 1648 aa11.39□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.38□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.38□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.37□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 RNF39Q9H2S5 420 aa11.35□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.35□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.34□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 FANCAO15360 1455 aa11.34□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.34□□□□□ -0.59
NPIPB15-201ENST00000429990 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
NPIPB15-201ENST00000429990 PLCH2O75038 1416 aa11.33□□□□□ -0.6
NPIPB15-201ENST00000429990 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.31□□□□□ -0.6
NPIPB15-201ENST00000429990 AKNAQ7Z591 1439 aa11.3□□□□□ -0.6
NPIPB15-201ENST00000429990 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.3□□□□□ -0.6
NPIPB15-201ENST00000429990 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
NPIPB15-201ENST00000429990 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.28□□□□□ -0.6
NPIPB15-201ENST00000429990 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.28□□□□□ -0.6
NPIPB15-201ENST00000429990 PREX2Q70Z35 1606 aa11.27□□□□□ -0.6
NPIPB15-201ENST00000429990 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.27□□□□□ -0.6
NPIPB15-201ENST00000429990 RICTORQ6R327 1708 aa11.27□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 ADGRL1O94910 1474 aa11.27□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 MAP3K1Q13233 1512 aa11.27□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.26□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.26□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.25□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.25□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.25□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 TIAM1Q13009 1591 aa11.24□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.24□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 RAPGEF3O95398 923 aa11.24□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.24□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.23□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.23□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.22□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.22□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.21□□□□□ -0.61
NPIPB15-201ENST00000429990 ABCC1P33527 1531 aa11.21□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.2□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 KDM5CP41229 1560 aa11.2□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 APLP2Q06481 763 aa11.19□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.19□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.19□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 NCOA2Q15596 1464 aa11.18□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 HECW2Q9P2P5 1572 aa11.17□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 MLH3Q9UHC1 1453 aa11.17□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.16□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.16□□□□□ -0.62
NPIPB15-201ENST00000429990 ATP10AO60312 1499 aa11.14□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.14□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.14□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 REREQ9P2R6 1566 aa11.13□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.13□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 AFAP1Q8N556 730 aa11.13□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 YEATS2Q9ULM3 1422 aa11.13□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.13□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.12□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.12□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 MIA2Q96PC5 1412 aa11.12□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 ADAMTSL3P82987 1691 aa11.11□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.1□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.1□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.1□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.1□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 ABCA6Q8N139 1617 aa11.09□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.09□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 MBD5Q9P267 1494 aa11.09□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.09□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 ATP7AQ04656 1500 aa11.09□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 CAPN15O75808 1086 aa11.09□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
NPIPB15-201ENST00000429990 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.08□□□□□ -0.64
NPIPB15-201ENST00000429990 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.08□□□□□ -0.64
NPIPB15-201ENST00000429990 AGLP35573 1532 aa11.08□□□□□ -0.64
NPIPB15-201ENST00000429990 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.06□□□□□ -0.64
NPIPB15-201ENST00000429990 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
NPIPB15-201ENST00000429990 MADDQ8WXG6 1647 aa11.05□□□□□ -0.64
NPIPB15-201ENST00000429990 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.05□□□□□ -0.64
NPIPB15-201ENST00000429990 PTPRMP28827 1452 aa11.04□□□□□ -0.64
NPIPB15-201ENST00000429990 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms