RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429859.5

CCDC18-AS1-208, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 418 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CEP162Q5TB80 1403 aa11.32□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.32□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MLECQ14165 292 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.27□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 YEATS2Q9ULM3 1422 aa11.27□□□□□ -0.6
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 RICTORQ6R327 1708 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 AFAP1Q8N556 730 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.23□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PREX2Q70Z35 1606 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.22□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MADDQ8WXG6 1647 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PTPRMP28827 1452 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 20.1
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ATP10AO60312 1499 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 HECW2Q9P2P5 1572 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ADAMTSL3P82987 1691 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ABCC1P33527 1531 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 APLP2Q06481 763 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 KDM5CP41229 1560 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.15□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MLH3Q9UHC1 1453 aa11.14□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.14□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ABCA6Q8N139 1617 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TIAM1Q13009 1591 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 NCOA2Q15596 1464 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 HSPA2P54652 639 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 GGT6Q6P531 493 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ATP7AQ04656 1500 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TSPY4P0CV99 314 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TSPY10P0CW01 314 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 REREQ9P2R6 1566 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 A2MP01023 1474 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 AGLP35573 1532 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MBD5Q9P267 1494 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 KIF3BO15066 747 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MAP3K1Q13233 1512 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.02□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ZMYM3Q14202 1370 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 C3P01024 1663 aa11□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ADGBQ8N7X0 1667 aa11□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MIA2Q96PC5 1412 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PLXNC1O60486 1568 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.97□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.97□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.96□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.96□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.95□□□□□ -0.66
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.95□□□□□ -0.66
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.94□□□□□ -0.66
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.94□□□□□ -0.66
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MROH2AA6NES4 1674 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.8 ms